| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | = 612724 | 6 (0.040) | 167 (1.070) | 144/496 | 0.0 | 96.5% | coding (334/1617 nt) | groL | molecular chaperone GroEL |
| ? | CP025533 | = 2632710 | NA (NA) | intergenic (‑129/‑113) | CYL77_12475/CYL77_12480 | ISL3 family transposase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
CTCGGCCCACGCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP025533/612478‑612724‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGCAGACGCACTCGA < CP025533/2632710‑2632463 CTCGGCCCACGCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGG > 2:1305124/1‑249 CCCACGCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTT < 1:281713/249‑1 CACGCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCC < 1:667050/249‑1 CGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTT > 1:1455819/1‑249 GGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTT > 1:462363/1‑249 GCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTT < 1:1447878/249‑1 CCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTG > 1:205525/1‑249 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AGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGG > 2:442332/1‑249 ATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTA < 1:1442348/249‑1 CGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCG < 2:1308075/249‑1 GGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGT < 1:296614/249‑1 GACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTA < 2:1041270/249‑1 CCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGA < 2:1148845/249‑1 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acGCTTGTGAAGTCCGTTTCTGTTAACACCAACTACATTGTCAGTGACGGCACTACGACTGCCACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTTCGCAACGCTGGTGCTGGCGCAAACCGGCCCTCCCGGTTTTGGGGTACATCAAAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGATATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCT < 2:18179/247‑1 CAGCTGGTGAATGCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGGTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAACCGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCT < 1:1136246/249‑1 CAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTTGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCT < 1:797247/249‑1 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AAGTCCGTTACTGTTAAGACCAACGACATAGCTTGTTACGGAACCACGACTGCAACTCCGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGACTGCGCAACGTTGCTGCTTGCGCAAACCGGCCATTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAATCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATACACGAGCCTTTTGTCAGAGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAA < 1:1489456/249‑1 AGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAG < 2:553099/249‑1 TCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTC < 2:59951/249‑1 TTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACC < 1:1000797/249‑1 TTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACC > 1:1497372/1‑249 TTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAAC > 1:1355995/1‑249 AAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACAT > 2:717297/1‑249 GACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCA > 1:1401290/1‑249 CGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTG < 1:737011/249‑1 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nGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCT < 2:326908/248‑1 TGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCC < 2:1157548/249‑1 GCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACT > 1:661043/1‑249 GCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACT < 2:790799/249‑1 ACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGC > 2:743898/1‑249 ACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGC < 2:462363/249‑1 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GCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCA > 2:1082486/1‑249 TGCTCGGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCA < 1:823536/249‑1 TGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGAGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCA < 2:1196615/249‑1 CTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACC > 1:890903/1‑249 TCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCG > 1:416924/1‑249 TCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCC > 1:574104/1‑249 ATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGA > 2:1125468/1‑249 TTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGAT < 2:591674/249‑1 TTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGAT > 2:1107103/1‑249 GCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGC > 2:663017/1‑249 CTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGTTTCCGATGCA < 2:388411/249‑1 CTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCn > 2:724424/1‑248 GAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGG > 2:889498/1‑249 CGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCTCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACACGAAAATAAACGATCCTTTTGTCATGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACAC < 1:1256185/249‑1 CGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGA > 2:1450863/1‑249 GTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGAT > 2:538397/1‑249 TGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCG > 2:1099619/1‑249 TGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCG < 2:1187474/249‑1 nGCTGGCGCAAACCGGCGCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACATGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAG < 2:487314/248‑1 AACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGCAGACGCACT < 2:1480694/249‑1 CCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGCAGACGCACTCG < 2:467219/249‑1 CTCGGCCCACGCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP025533/612478‑612724‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGCAGACGCACTCGA < CP025533/2632710‑2632463 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |