| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | CP025533 | 2,042,148 | 725 bp→TGTTTAAGTTTAGTGGATGG | coding (19‑743/780 nt) | CYL77_09745 → | DeoR/GlpR transcriptional regulator |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | CP025533 | 2042148 | 2042872 | 725 | 158 [0] | [0] 163 | CYL77_09745 | DeoR/GlpR transcriptional regulator |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | = 2042147 | 0 (0.000) | 146 (1.020) +TGTTTAAGTTTAGTGGATGG |
129/456 | 0.0 | 100% | coding (18/780 nt) | CYL77_09745 | DeoR/GlpR transcriptional regulator |
| ? | CP025533 | 2042873 = | 0 (0.000) | coding (744/780 nt) | CYL77_09745 | DeoR/GlpR transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
GGGTAATCGGGCAAATAAGTTTTTGCTGATCTAGAAAGTGAGTTTACCTGTGGGTTTTCGAAAATTCTGGGCCGGACAATAGAAAAACGCTGCCCGGTTTTTTTGATTGACTCCCGATTTCACCCCTCCGCCGGCAACCAAATGAGGCTTTTGGGCGTTGGACAGTGAGACAATGGGTAAGAAATTCGGACATATTTAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP025533/2041902‑2042147‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAATCTCTCATTACATGCGCCTGGTGACGTT > CP025533/2042873‑2043120 |||||||||||||||||||| GTAATCGGGCAAATAAGTTTTTGCTGATCTAGAAAGTGAGTTTACCTGTGGGTTTTCGAAAATTCTGGGCCGGACAATAGAAAAACGCTGCCCGGTTTTTTTGATTGACTCCCGATTTCACCCCTCCGCCGGCAACCAAATGAGGCTTTTGGGCGTTGGACAGTGAGACAATGGGTAAGAAATTCGGACATATTTAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTT < 1:1234333/249‑1 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GGACATATTTAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCAC < 2:669079/249‑1 GACATATTTAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACC > 1:1458134/1‑249 GACATATTTAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACC < 2:750798/249‑1 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TATTTAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGT > 2:803442/1‑249 TAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTA < 1:1316704/249‑1 TAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGG < 2:1037515/249‑1 AATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCG > 1:862812/1‑249 TGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCA > 1:1191674/1‑249 GGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAA > 2:291567/1‑249 GCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAAT < 1:1286928/249‑1 GCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTACAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAAT < 1:979392/249‑1 CTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATG < 2:317407/249‑1 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TTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTG < 1:732548/249‑1 TTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTG < 1:582011/249‑1 TAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGC > 1:904360/1‑249 AGGAGTGACATGTACGCGGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAG < 2:1051259/249‑1 GGAGGGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGT < 2:860377/249‑1 AGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATTGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTT < 1:990725/249‑1 AGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCATACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTT < 1:1276106/249‑1 GTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTT < 1:378605/249‑1 TGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTT > 1:15536/1‑249 TGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTT > 1:296773/1‑249 TGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCATTTTTTCCCGC > 2:850490/1‑249 GTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTAGCAGTTTTTCCCGCT < 1:516532/249‑1 CAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGA < 2:418477/249‑1 GAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAA > 1:350127/1‑249 AGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAAT > 1:1203072/1‑249 AGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAATCTC < 2:543945/249‑1 TTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAATCTCTCATTAC < 2:1429175/249‑1 TAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAATCTCTCATTACAT < 2:1307856/249‑1 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GTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATTCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAATCTCTCATTACATGCGCCTGG < 2:1205229/249‑1 ATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAATCTCTCATTACATGCGCCTGGTGAC < 2:669710/249‑1 GGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAATCTCTCATTACATGCGCCTGGTGACGTT < 1:253626/249‑1 |||||||||||||||||||| GGGTAATCGGGCAAATAAGTTTTTGCTGATCTAGAAAGTGAGTTTACCTGTGGGTTTTCGAAAATTCTGGGCCGGACAATAGAAAAACGCTGCCCGGTTTTTTTGATTGACTCCCGATTTCACCCCTCCGCCGGCAACCAAATGAGGCTTTTGGGCGTTGGACAGTGAGACAATGGGTAAGAAATTCGGACATATTTAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP025533/2041902‑2042147‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAATCTCTCATTACATGCGCCTGGTGACGTT > CP025533/2042873‑2043120 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |