| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | = 470736 | 129 (0.830) | 13 (0.100) | 11/418 | 19.4 | 12.2% | intergenic (+343/‑366) | ccsB/CYL77_02305 | c‑type cytochrome biogenesis protein CcsB/hypothetical protein |
| ? | CP025533 | 471039 = | 78 (0.590) | intergenic (+646/‑63) | ccsB/CYL77_02305 | c‑type cytochrome biogenesis protein CcsB/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
GGCATTGTGTGCTTGCCTAGTCGATTATTTGTCATCCCTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTAAACCAAGGAGCTTGTTTGAGGGGGAGCGCTTGGTTTGATTCGACAGTTTTCGGGAGTTGAAAGTGAAGAATTAGGCCAGAGGGGGCTCGAAAATCCGTCTCCTTGGTTCCAATCGCACGCTTTACTCTTTCTCGTGCCCCACATTGTCTTTGACTTTCGTTGGATCGTGGCTTTCACCCGCTCATACGTGCACGCCATTTAGCCAACGGATAGGAAGGGTTTTTAGGGAGGCCCTCTCTG > CP025533/470488‑470983 | tgtgCTTGCCTAGTCGATTATTTGTCATCCCTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTa > 1:96564/1‑249 (MQ=255) gctctccTAGTCGATTATTTGTCATCCCTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTGCGAATGGGTGTGTGGCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGGCCTTAAGAGCGATGCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTAAAc < 2:960580/244‑1 (MQ=255) gCTTGCCTAGTCGATTATTTGTCATCCCTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTAAAc < 1:204549/249‑1 (MQ=255) ntGCCTAGTCGATTATTTGTCATCCCTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTAAACCa < 1:858453/248‑1 (MQ=255) gCCTAGTCGATTATTTGTCATCCCTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTAAACCAAg > 1:688636/1‑249 (MQ=255) naGTCGATTATTTGTCATCCCTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTAAACCAAGGAg < 1:64680/248‑1 (MQ=255) gTCGATTATTTGTCATCCCTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTAAACCAAGGAGCt < 1:1420181/249‑1 (MQ=255) tCGATTATTTGTCATCCCTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGTGTGTACGTATTAAACCAAGGAGCtt > 2:1404003/1‑249 (MQ=255) tCGATTATTTGTCATCCCTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTAAACCAAGGAGCtt > 1:343803/1‑249 (MQ=255) cGATTATTTGTCATCCCTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTTAACCAAGGAGCTTg > 2:233654/1‑249 (MQ=255) gATTATTTGTCATCCCTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTAAACCAAGGAGCTTGt < 2:928286/249‑1 (MQ=255) ttattTGTCATCCCTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTGCGGGTGGCGTGTACGTATTAAACCAAGGAGCTTGttt > 1:648912/1‑249 (MQ=255) attTGTCATCCCTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTAAACCAAGGAGCTTGTTTGa < 2:158752/249‑1 (MQ=255) 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cATGCCTTTGGCTTTCCAGCAGCCTTGGAAGCAGTCATAGGCGTAATGTCTTATCCCGCGACAGAACAGGTACTTCCTTGAATCGAATTTAAAGGTGATCTAAGGGTGCGTGTTTTTCGAATGGGCGTGGGTCAGGGTTGGGTGGGGCTAGGGCCTTATAAGCGATTCTAGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTATGTATTAAACCAAGGAGCTTGTTTGAGGGGGa < 2:343803/249‑1 (MQ=25) cATCCCTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTAAACCAAGGAGCTTGTTTGAgggggn > 1:369370/1‑248 (MQ=255) cccTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTAAACCAAGGAGCTTGTTTGAGGGGGAgcg < 1:647185/249‑1 (MQ=255) cccTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCCGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTAAACCAAGTAGCTTGTTTGAGGGGGAgcg < 1:656307/249‑1 (MQ=255) ccTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTAAACCAAGGAGCTTGTTTGAGGGGGAgcgc < 2:861806/249‑1 (MQ=255) tttCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTAAACCAAGGAGCTTGTTTGAGGGGGAGCGCTTGGTTTg > 1:5009/1‑249 (MQ=255) 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cTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTAAACCAAGGAGCTTGTTTGAGGGGGAGCGCTTGGTTTGATTCGACAGttt < 2:812251/249‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTAAACCAAGGAGCTTGTTTGAGGGGGAGCGCTTGGTTTGATTCGACAGTTTTc < 1:1112228/249‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGATTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTAAGTATTAAACCAAGAAGCTCGTGTGAGGGGGGGCGCTTGGTTTGATTCGACAGtttcc > 1:1437043/1‑247 (MQ=255) 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GGCATTGTGTGCTTGCCTAGTCGATTATTTGTCATCCCTTTGGCTTTCCATCAGTCCTTGAAGCAGTCATAGGGGGAATGTCTTAGTCCACGAAAGTACAGGTACTTCCCGGAATCTCATTTAAAGGCGATCTAAGGGGGCGGGTTTTTCGAATGGGTGTGTGTCTGGGTTGGGTGGGGCTAGGCCCTTAAAAGCGATTCTGGGAGGGCAAGTTTTTCGAGGTTGGGGTGGCTTTTCGGGTGGCGTGTACGTATTAAACCAAGGAGCTTGTTTGAGGGGGAGCGCTTGGTTTGATTCGACAGTTTTCGGGAGTTGAAAGTGAAGAATTAGGCCAGAGGGGGCTCGAAAATCCGTCTCCTTGGTTCCAATCGCACGCTTTACTCTTTCTCGTGCCCCACATTGTCTTTGACTTTCGTTGGATCGTGGCTTTCACCCGCTCATACGTGCACGCCATTTAGCCAACGGATAGGAAGGGTTTTTAGGGAGGCCCTCTCTG > CP025533/470488‑470983 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |