| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP025533 | 2272423 = | 1 (0.010) | 161 (1.040) | 135/492 | 0.0 | 99.4% | coding (168/219 nt) | CYL77_10780 | hypothetical protein |
| ? | CP025533 | = 2353688 | NA (NA) | intergenic (‑421/+163) | CYL77_11120/CYL77_11125 | IS30 family transposase ISCg2/RDD family protein | |||||
Only 100 of 312 total aligned reads displayed.
TTTCGCCCTTGGTCTTGCATTAGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGAATTAGCGCAAATTTTCGATCAGAATTGGCCTCTCACGCCGGACTGAGGACGGATTTTTGCAACCCACCTCCCCTTAGGGCCCAACGGGGATTTCTGAATGTTTGCCGAGGTTCTATGGCAAGGATCCACCACAAACTGCCACCTTTCGGCAGCAATTTGTGGTGAATATTAGAACATTCTTTCCCTTTGCGTCTATTCATGGGCAACCACCGCCCAAAAGCACCCCGAAACCCGATGAAACCC > CP025533/2272175‑2272671 | tctcaagtttctcggcggtgtcaaaagcattgccacctcgcgggccgcgggtcagtttcaccccggcggccttcgcccactttcgcccggtgaattcactgaccccgaccgctgtagacgcagcaagacctgacataccttgattgatcatgtcgaggaaagccgtacggctttcctctgggattgttctacgaatgcccacttcgcacccttcgggttgctcgtggtgcattcaccccctgaacccgc < 1:810487‑M1/1‑1 (MQ=255) caagtttctcggcggtgtcaaaagcattgccacctcgcgggccgcgggtcagtttcaccccggcggccttcgcccactttcgcccggtgaattcactgaccccgaccgctgtagacgcagcaagacctgacataccttgattgatcatgtcgaggaaagccgtacggctttcctctgggattgttctacgaatgcccacttcgcacccttcgggttgctcgtggtgcattcaccccctgaacccgCCTc < 1:237383‑M1/4‑1 (MQ=255) cGCCCTTGGTCTTGCATTAGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTc < 2:1256675/249‑1 (MQ=255) aagtttctcggcggtgtcaaaagcattgccacctcgcgggccgcgggtcagtttcaccccggcggccttcgcccactttcgcccggtgaattcactgaccccgaccgctgtagacgcagcaagacctgacataccttgattgatcatgtcgaggaaagccgtacggctttcctctgggattgttctacgaatgcccacttcgcacccttcgggttgctcgtggtgcattcaccccctgaacccgCCTCg > 1:230530‑M1/245‑249 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |