| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP025533 | 2702916 = | NA (NA) | 157 (1.010) | 132/494 | 0.0 | 97.5% | pseudogene (98/474 nt) | CYL77_12850 | IS630 family transposase |
| ? | CP025533 | 3286432 = | 4 (0.030) | coding (2392/4932 nt) | CYL77_15535 | damage‑inducible protein | |||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
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cacTCCGATGATCAGAACGCTGGAGTAACTCCCGGGTCACCTCAGCGAACAACCGTTCAACCTGGTTGATCCAGGACGAATACGTCGGGGTGAAGTGCATGTGAAACCGTGGATGCTTGACCAACCAGGTATTGATGGTCGGGTGTTTATGCGTGGCGTAGTTGTCACAAATAACATGAACATCAAGGTCCTGGGGAACAGTCTTGTCGATCTTGACCAGGAACTTCTTAAACCTGGATCCACCGAtgt > 2:1025235/1‑249 (MQ=255) cacTCCGATGATCAGAACGCTGGAGTAACTCCCGGGTCACCTCAGCGAACAACCGTTCAACCTGGTTGATCCAGGACGAATACGTCGGGGTGAAGTGCATGTGAAACCGTGGATGCTTGACCAACCAGGTATTGATGGTCGGGTGTTTATGCGTGGCGTAGTTGTCACAAATAACATGAACATCAAGGTCCTGGGGAACAGTCTTGTCGATCTTGACCAGGAACTTCTTAAACCTGGATCCACCGAtgt < 1:512526/249‑1 (MQ=255) acTCCGATGATCAGAACGCTGGAGTAACTCCCGGGTCACCTCAGCGAACAACCGTTCAACCTGGTTGATCCAGGACGAATACGTCGGGGTGAAGTGCATGTGAAACCGTGGATGCTTGACCAACCAGGTATTGATGGTCGGGTGTTTATGCGTGGCGTAGTTGTCACAAATAACATGAACATCAAGGTCCTGGGGAACAGTCTTGTCGATCTTGACCAGGAACTTCTTAAACCTGGATCCACCGAtgtg < 2:1480962/249‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |