| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | 272376 = | 173 (1.110) | 149 (0.960) +CT |
131/492 | 0.1 | 50.5% | intergenic (+8/‑16) | CYL77_01365/CYL77_01370 | aspartate kinase/aspartate‑semialdehyde dehydrogenase |
| ? | CP025533 | 2085498 = | 121 (0.770) | intergenic (‑47/+5) | CYL77_09945/CYL77_09950 | thymidylate synthase (FAD)/4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate reductase | |||||
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
CCACTTCCATGATGTGGCGCAGATACGCAGCATTGGAAGCAGTTCGAGGGTTCGGCTTATCAAAAGTTTCGTAGCAGGCACGACCCGCAAACTCGACGAGTGCTTCCGCGCCCTCAACATCAGTTGACCACTCAACATCAGCGGGTGGAGTAAAAGAACTGCACGCTATCAACTCCACGCTCAATTTAACTTGTTCGGCCACAGCCTTTAAACGCTCCTTTTAAAAAATTCCACCCGCTGCTGAAATGAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGCGCCACGGGAACCCTCAAGTGCCTGCTCGGTC > CP025533/2085250‑2085746 | gtgcctccagcggagaacaacgcaacgtcgatgtccttgagggactcctcggttgcctgagtaatgtcttctacctcgatttccgtgccacggaattcaatcttacggcctgcggaacgtggggaagcaaagaaacgaacagtgtcagctgggaaattgcgctcttccaaaagggtgcgcataacctggccgacctggccggttgcaccaacaactgcgatggtggtcattgtaaaactactccttcta < 2:670438‑M2/1‑1 (MQ=255) tCCATGATGTGGCGCAGATACGCAGCATTGGAAGCAGTTCGAGGGTTCGGCTTATCAAAAGTTTCGTAGCAGGCACGACCCGCAAACTCGACGAGTGCTTCCGCGCCCTCAACATCAGTTGACCACTCAACATCAGCGGGTGGAGTAAAAGAACTGCACGCTATCAACTCCACGCTCAATTTAACTTGTTCGGCCACAGCCTTTAAACGCTCCTTTTAAAAAATTCCACCCGCTGCTGAAATGAGCCtt > 2:1412080/1‑249 (MQ=255) ccagcggagaacaacgcaacgtcgatgtccttgagggactcctcggttgcctgagtaatgtcttctacctcgatttccgtgccacggaattcaatcttacggcctgcggaacgtggggaagcaaagaaacgaacagtgtcagctgggaaattgcgctcttccaaaagggtgcgcataacctggccgacctggccggttgcaccaacaactgcgatggtggtcattgtaaaactactccttctAGCCttt < 2:259531‑M2/7‑1 (MQ=255) ccATGATGTGGCGCAGATACGCAGCATTGGAAGCAGTTCGAGGGTTCGGCTTATCAAAAGTTTCGTAGCAGGCACGACCCGCAAACTCGACGAGTGCTTCCGCGCCCTCAACATCAGTTGACCACTCAACATCAGCGGGTGGAGTAAAAGAACTGCACGCTATCAACTCCACGCTCAATTTAACTTGTTCGGCCACAGCCTTTAAACGCTCCTTTTAAAAAATTCCACCCGCTGCTGAAATGAGCCttt < 2:1327183/249‑1 (MQ=255) agcggagaacaacgcaacgtcgatgtccttgagggactcctcggttgcctgagtaatgtcttctacctcgatttccgtgccacggaattcaatcttacggcctgcggaacgtggggaagcaaagaaacgaacagtgtcagctgggaaattgcgctcttccaaaagggtgcgcataacctggccgacctggccggttgcaccaacaactgcgatggtggtcattgtaaaactactccttctAGCCTTTAc > 2:828161‑M2/241‑249 (MQ=255) atgTGGCGCAGATACGCAGCATTGGAAGCAGTTCGAGGGTTCGGCTTATCAAAAGTTTCGTAGCAGGCACGACCCGCAAACTCGACGAGTGCTTCCGCGCCCTCAACATCAGTTGACCACTCAACATCAGCGGGTGGAGTAAAAGAACTGCACGCTATCAACTCCACGCTCAATTTAACTTGTTCGGCCACAGCCTTTAAACGCTCCTTTTAAAAAATTCCACCCGCTGCTGAAATGAGCCTTTACAgg > 1:1090999/1‑249 (MQ=255) ggCGCAGATACGCAGCATTGGAAGCAGTTCGAGGGTTCGGCTTATCAAAAGTTTCGTAGCAGGCACGACCCGCAAACTCGACGAGTGCTTCCGCGCCCTCAACATCAGTTGACCACTCAACATCAGCGGGTGGAGTAAAAGAACTGCACGCTATCAACTCCACGCTCAATTTAACTTGTTCGGCCACAGCCTTTAAACGCTCCTTTTAAAAAATTCCACCCGCTGCTGAAATGAGCCTTTACAGGCCtn > 1:570582/1‑248 (MQ=255) 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cGGCTTATCAAAAGTTTCGTAGCAGGCACGACCCGCAAACTCGACGAGTGCTTCCGCGCCCTCAACATCAGTTGACCACTCAACATCAGCGGGTGGAGTAAAAGAACTGCACGCTATCAACTCCACGCTCAATTTAACTTGTTCGGCCACAGCCTTTAAACGCTCCTTTTAAAAAATTCCACCCGCTGCTGAAATGAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCtg > 2:1258729/1‑249 (MQ=255) ctgagtaatgtcttctacctcgatttccgtgccacggaattcaatcttacggcctgcggaacgtggggaagcaaagaaacgaacagtgtcagctgggaaattgcgctcttccaaaagggtgcgcataacctggccgacctggccggttgcaccaacaactgcgatggtggtcattgtaaaactactccttctAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCa < 2:937607‑M2/57‑1 (MQ=255) ngagtaatgtcttctacctcgatttccgtgccacggaattcaatcttacggcctgcggaacgtggggaagcaaagaaacgaacagtgtcagctgggaaattgcgctcttccaaaagggtgcgcataacctggccgacctggccggttgcaccaacaactgcgatggtggtcattgtaaaactactccttctAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCaa < 2:286189‑M2/58‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |