| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | = 497710 | 145 (0.930) | 7 (0.060) | 6/346 | 19.9 | 6.8% | intergenic (+2/‑251) | CYL77_02460/CYL77_02465 | tRNA‑Thr/tRNA‑Thr |
| ? | CP025533 | 498036 = | 90 (0.830) | intergenic (+3/‑36) | CYL77_02465/CYL77_02470 | tRNA‑Thr/tRNA‑Met | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
CGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGAAACCGCTTCTAACTGCAAATTTTTTGAGGTTAGAAGCGGTGTTTTCGCAAATTGACAGGCTGATGGTAACATTGCCTGTGCTCCATAGGGGCGTAGCTCAATTGGCAGAGCAACGGTCTCCAAAACCGT > CP025533/497791‑498282 | cGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAACGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTg > 2:1260907/1‑249 (MQ=255) gTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGc > 2:109265/1‑249 (MQ=255) gTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGc > 2:772697/1‑249 (MQ=255) aGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCttt < 2:931332/249‑1 (MQ=255) tttttAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTa > 2:788521/1‑249 (MQ=255) gTTTCAGGTCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCg < 1:451947/249‑1 (MQ=255) ttCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTa < 1:338737/249‑1 (MQ=255) ttCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTa > 2:894425/1‑249 (MQ=255) aGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAagn > 1:218621/1‑248 (MQ=255) aGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAagn > 2:188388/1‑248 (MQ=255) aGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCCTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAagn > 2:1130711/1‑248 (MQ=255) ggCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAagnn > 1:892240/1‑247 (MQ=255) cacaTGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATg > 2:38017/1‑249 (MQ=255) cacaTGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATg > 2:184835/1‑249 (MQ=255) aTGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTg > 2:1318549/1‑249 (MQ=255) cATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGc > 1:902516/1‑249 (MQ=255) aGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAGGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAAtttg > 1:416989/1‑249 (MQ=255) aGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAAtgtg > 1:622247/1‑249 (MQ=255) aGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAAtgtg < 1:35875/249‑1 (MQ=255) gCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAg > 1:871230/1‑249 (MQ=255) cAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGc > 2:602905/1‑249 (MQ=255) cAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGtnn > 2:914049/1‑247 (MQ=255) ttAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACt < 1:205288/249‑1 (MQ=255) aGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCa < 1:712252/249‑1 (MQ=255) gCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCAt < 1:109265/249‑1 (MQ=255) ccTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATc > 1:557491/1‑249 (MQ=255) tGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGc > 2:1459247/1‑249 (MQ=255) aGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCtgt < 1:1332471/249‑1 (MQ=255) aGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCtgt > 1:1190534/1‑249 (MQ=255) tttGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTc < 1:1377057/249‑1 (MQ=255) tgtTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTcgcgn > 1:1283970/1‑248 (MQ=255) ggTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCaa > 2:1156181/1‑249 (MQ=255) gTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAAt > 2:54395/1‑249 (MQ=255) tAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAAtt < 1:1269466/249‑1 (MQ=255) aGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATtc > 1:1266731/1‑249 (MQ=255) cGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAACTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATtctc > 1:732818/1‑249 (MQ=255) ggtgcaggTTATAGTTCTTAAGGCTTCAACGCAGCGCAGCGGTAGCAATACCGGCTTCTTTTCGAAGAGGTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCg < 2:1043746/243‑1 (MQ=37) 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gggTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATc > 1:492740/1‑249 (MQ=255) gggTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATc < 1:956094/249‑1 (MQ=255) gTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGc > 2:45329/1‑249 (MQ=255) 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aGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGAAACCGCTTCTAAc < 2:828545/249‑1 (MQ=255) gcAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGAAACCGCTTCTAACTGc > 1:251548/1‑249 (MQ=255) cGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGAAACCGCTTCTAACTGCAAAt > 2:702580/1‑249 (MQ=255) 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CGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGAAACCGCTTCTAACTGCAAATTTTTTGAGGTTAGAAGCGGTGTTTTCGCAAATTGACAGGCTGATGGTAACATTGCCTGTGCTCCATAGGGGCGTAGCTCAATTGGCAGAGCAACGGTCTCCAAAACCGT > CP025533/497791‑498282 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |