Predicted mutation | ||||||
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MC JC | CP025533 | 2,200,552 | 1289 bp→CCATCCACTAAACTTAAACA | coding (19‑1307/1344 nt) | CYL77_10460 ← | glutamate dehydrogenase |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | CP025533 | 2200552 | 2201840 | 1289 | 165 [0] | [0] 165 | CYL77_10460 | glutamate dehydrogenase |
New junction evidence | |||||||||||
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? | CP025533 | 2201841 = | 0 (0.000) | coding (18/1344 nt) | CYL77_10460 | glutamate dehydrogenase |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
GCAGAGTTGAACTGCACGCGGAAACCACGGTTGACGTGGACCTGGCCCTGGTCATCAACCCAAGGCACACGGAAGATGAGCTGACGCTCAGGCTCGCACAGGCGCTGGATGAGACCGTAATCAGCGTAATGAGGGTCCTTTTCCAGGACGATCTTCAAAGATTCCAAAACCTCTGCCACTGCCTGGTGAAATTCAGGCTCGCCAGCATTGCGCTTCAGAAGCATGTCGTAATAGTTAGAGACCTGCTCATCAACTGTCATGATTTCCTCGTTCCCATCTCGGCTGCATGCGCGCACGATTTTAAAGTGTGTACCTGGGCCATTTAGTGATGTTGGTGGTTCCCATTGAGGGCACCATGTACATCCTAGGCGTTTGCTGGAGCAAAATGCCTGTGAAAAATCTGATCCTGAAACTTTTAAAAACTGCGTTCACATCAACCGGCTTGTCATACCTAACGGTTAATAGTTTTAAACTACGGATGCCCTAAAGAG > CP025533/2201599‑2202089 | caccaagatgcgctcaatcaagcggatctttcccagactctggccacgcttaaagacaccacggtgatcatcattgcgcaccgcacagctgcattaacccatgtggatcggataattgacctggaagaaatcaaaaatccctgatccttaacgcggatcaggggtttaagtaaagcgcaggggtcttagatgacgccctgtgccagcatcgcgtcagctaccccatccactaaacttaaacaCTGAtca > 2:411768‑M2/243‑249 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |