| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP025533 | 32,227 | T→A | I184N (ATT→AAT) | CYL77_00185 → | ribose ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP025533 | 32,227 | 0 | T | A | 99.3% | 561.4 / NA | 143 | I184N (ATT→AAT) | CYL77_00185 | ribose ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (75/67); minor base C (1/0); total (76/67) | |||||||||||
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Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
GGGTGGGCGCGCTGATTGCATTGGTGATTTCGCTGGCCATCGGCTTTTTCAACGGCTTTTTGGTAGTGAAAACCAAGATTGCATCCTTCCTGATCACCCTTGCCACTTTCCTTATGCTGCAGGGTATTAATCTGGCGGTCACCAAGCTGATTTCCGGCACCGTGGCCACGCCAACCATCGCGGATATGGAAGGTTTTCCTTCAGCGCGTGCGGTGTTTGCCAGCTCGATTCCCATCTTTGGTGTGATTATTCGCATCACTGTTTTTTGGTGGCTGCTGTTTGTTATCGTCGGCACTTTTGTGTTGTTTAAGACGCGCATCGGCAACTGGATTTTTGCGGTCGGTGGCGATGAAGAGGCAGCTCGCGCAGTCGGCGTTCCCGTGCGTGGCGTGAAAATCGGCCTGTTCATGTTCGTTGGTTTTGCCGCCTGGTTTGTGGGCATGCACAACCTGTTCCTCTTTGATTCGATTCAGGCTGGTCAAGGCGTGG > CP025533/31981‑32469 | gggtgggCGCGCTGATTGCATTGGTGATTTCGCTGGCCATCGGCTTTTTCAACGGCTTTTTGGTAGTGAAAACCAAGATTGCATCCTTCCTGATCACCCTTGCCACTTTCCTTATGCTGCAGGGTATTAATCTGGCGGTCACCAAGCTGATTTCCGGCACCGTGGCCACGCCAACCATCGCGGATATGGAAGGTTTTCCTTCAGCGCGTGCGGTGTTTGCCAGCTCGATTCCCATCTTTGGTGTGaata < 2:992052/249‑1 (MQ=255) ggtgggCGCGCTGATTGCATTGGTGATTTCGCTGGCCATCGGCTTTTTCAACGGCTTTTTGGTAGTGAAAACCAAGATTGCATCCTTCCTGATCACCCTTGCCACTTTCCTTATGCTGCAGGGTATTAATCTGGCGGTCACCAAGCTGATTTCCGGCACCGTGGCCACGCCAACCATCGCGGATATGGAAGGTTTTCCTTCAGCGCGTGCGGTGTTTGCCAGCTCGATTCCCATCTTTGGTGTGaatat < 2:1198511/249‑1 (MQ=255) ggtgggCGCGCTGATTGCATTGGTGATTTCGCTGGCCATCGGCTTTTTCAACGGCTTTTTGGTAGTGAAAACCAAGATTGCATCCTTCCTGATCACCCTTGCCACTTTCCTTATGCTGCAGGGTATTAATCTGGCGGTCACCAAGCTGATTTCCGGCACCGTGGCCACGCCAACCATCGCGGATATGGAAGGTTTTCCTTCAGCGCGTGCGGTGTTTGCCAGCTCGATTCCCATCTTTGGTGTGaatat < 2:567604/249‑1 (MQ=255) tgggCGCGCTGATTGCATTGGTGATTTCGCTGGCCATCGGCTTTTTCAACGGCTTTTTGGTAGTGAAAACCAAGATTGCATCCTTCCTGATCACCCTTGCCACTTTCCTTATGCTGCAGGGTATTAATCTGGCGGTCACCAAGCTGATTTCCGGCACCGTGGCCACGCCAACCATCGCGGATATGGAAGGTTTTCCTTCAGCGCGTGCGGTGTTTGCCAGCTCGATTCCCATCTTTGGTGTGACTATTc > 2:1063461/1‑249 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |