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Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
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ATCATTATTTAATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCA > 2:717003/1‑249 TCATTATTTAATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGTAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTGTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCAC < 2:586874/249‑1 ATTATTTAATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCC < 2:1273283/249‑1 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AGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTC > 1:984407/1‑249 GAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTT < 1:1187901/249‑1 ATTCGTCCAAGAGTGCTGATGGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGT < 2:827634/249‑1 CGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACACTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTAT > 1:887007/1‑249 GTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATG > 1:143157/1‑249 AAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAG > 1:77323/1‑249 AAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGATATGGCAG > 1:104664/1‑249 nGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATG < 2:557489/248‑1 AGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTAGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGT < 1:57826/249‑1 GTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTATTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTT > 2:688069/1‑249 ACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTGTGAATGGAGTTGAGCTT > 1:412794/1‑249 CTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGGGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTG > 1:839767/1‑249 CTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTG < 1:540137/249‑1 TCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGA > 1:6660/1‑249 GCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTT > 1:1024142/1‑249 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GGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGAGTTCCATCC > 1:847448/1‑249 GAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGAGTTCCATCCC > 2:1224408/1‑249 AGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGAGTTCCATCCCT < 1:328616/249‑1 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CGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGAGTTCCATCCCTTGAAGAGAAATTA > 2:1109833/1‑249 AATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGAGTTCCATCCCTTGAAGAGAAATTATC < 1:1006281/249‑1 TGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGAGTTCCATCCCTTGAAGAGAAATTATCTGC < 1:1065974/249‑1 TATTTTTTATGAAGGGATCCTGCAGAATCTAATTCAAGATGGGTGGGATGTGCACCTTGTTTCAAATCCAGGCCCAGTTGGGAAGAAATTACTGAATGGTAAAGCTCATACTATCGAGATGTCTAGAGAGATTTCAATAGGTACCGATGTTAAATCATTATTTAATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP025533/372425‑372681‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cacgaattgTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGAGTTCCATCCCTTGAAGAGAAATTATCTGC > CP025533/372700‑372946 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |