| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP025533 | 1044913 = | 0 (0.000) | 142 (1.030) | 122/494 | 0.0 | 65.1% | intergenic (+336/+114) | CYL77_05015/CYL77_05020 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | CP025533 | 2793967 = | 152 (1.110) | intergenic (‑388/+10) | CYL77_13260/CYL77_13265 | LysR family transcriptional regulator/diaminopimelate dehydrogenase | |||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
TCGTAACCGCTGCAAATGGTCAAGAGACCGAAACCGAAGATATTGAGGTGAAGCTTTCCTTCCCCACCGAGTCTTCCCAAGGCCTAGTGTTCACTCAGGTCACCGTCGATGGACAGGTTCTCTTCCTCTAATCCTCCATAATTAGAGAGCGTAAGGCCCCTACTTCCTGTTTTAGGAAATAGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP025533/1045157‑1044913‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCGGTGTCGCCGGTGGTAATCACGTGGCCACCGTGTG > CP025533/2793967‑2794212 TCGTAACCGCTGCAAATGGTCAAGAGACCGAAACCGAAGATATTGAGGTGAAGCTTTCCTTCCCCACCGAGTCTTCCCAAGGCCTAGTGTTCACTCAGGTCACCGTCGATGGACAGGTTCTCTTCCTCTAATCCTCCATAATTAGAGAGCGTAAGGCCCCTACTTCCTGTTTTAGGAAATAGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGA < 1:582747/249‑1 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AAGATATTGAGGTGAAGCTTTCCTTCCCCACCGAGTCTTCCCAAGGCCTAGTGTTCACTCAGGTCACCGTCGATGGACAGGTTCTCTTCCTCTAATCCTCCATAATTAGAGAGCGTAAGGCCCCTACTTCCTGTTTTAGGAAATAGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAn > 2:1049710/1‑248 TGAGGTGAAGCTTTCCTTCCCCACCGAGTCTTCCCAAGGCCTAGTGTTCACTCAGGTCACCGTCGATGGACAGGTTCTCTTCCTCTAATCCTCCATAATTAGAGAGCGTAAGGCCCCTACTTCCTGTTTTAGGAAATAGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCT < 2:1026932/249‑1 AGGTGAAGCTTTCCTTCCCCACCGAGTCTTCCCAAGGCCTAGTGTTCACTCAGGTCACCGTCGATGGACAGGTTCTCTTCCTCTAATCCTCCATAATTAGAGAGCGTAAGGCCCCTACTTCCTGTTTTAGGAAATAGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGG > 1:943732/1‑249 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GAGCGTAAGGCCCCTACTTCCTGTTTTAGGAAATAGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAG < 2:448825/249‑1 GAGCGTAAGGCCCCTACTTCCTGTTTTAGGAAATAGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCGCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAG < 1:165118/249‑1 CGTAAGGCCCCTACTTCCTGTTTTAGGAAATAGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGG > 1:215275/1‑249 GTAAGGCCCCTACTTCCTGTTTTAGGAAATAGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGT < 1:399964/249‑1 AAGGCCCCTACTTCCTGTTTTAGGAAATAGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGA < 2:1346421/249‑1 CCCCTACTTCCTGTTTTAGGAAATAGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTATATTAGCCGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGAGGATATGGGGCAACTTCGAGGCCGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCGCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATATGTGAGGAAGCGGTGAAATC > 1:1220340/1‑249 CCCCTACTTCCTGTTTTAGGAAATAGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATC > 2:1235125/1‑249 CTACTTCCTGTTTTAGGAAATAGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGG > 1:735109/1‑249 CCTGTTTTAGGAAATAGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCG > 1:768179/1‑249 nGTTTTAGGAAATAGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGT < 1:1241187/248‑1 nTAGGAAATAGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAG < 1:639431/248‑1 TAGGAAATAGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGC < 1:344590/249‑1 GGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATG < 1:1255997/249‑1 GGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATG < 2:78276/249‑1 gcaTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTACTTAAGAAGTTTAAATAGTGTCCATGAGGTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATAAGATCGTCCAAGATCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCTGCTTTGGCCCGGCTGCTTCATACGGTGTGCTGCACGGCCGAAAGCAGTATGTGAGGAACAGGTGCAATCTCAGTTTCGATCAGGCTTGAGGAAGTAT > 2:924214/4‑249 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TTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCC > 1:870113/1‑249 TTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGCCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGT > 2:254933/1‑249 TGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTG > 1:77307/1‑249 TCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTT < 2:144688/249‑1 CTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTG > 2:540962/1‑249 TGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGC > 2:73234/1‑249 AGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCATGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAATCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTACAGCTTGAGGATGTATTCGACGGTGTGGTTGAAGCCAC > 2:835468/1‑249 AGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCAC < 2:575447/249‑1 GCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCG > 2:1049148/1‑249 ATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCGGTG > 2:338182/1‑249 ATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCGGTG > 1:1131931/1‑249 TTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCGGTGT < 1:223498/249‑1 TTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCGGTGTCGCCGGTGG < 1:990090/249‑1 TTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCGGTGTCGCCGGTGGT < 2:943732/249‑1 TAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCGGTGTCGCCGGTGGTA < 1:751644/249‑1 AATTGTGTCCATGAGTTCTCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCGGTGTCGCCGGTGGTAAT < 2:231491/249‑1 AATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGTGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCGGTGTCGCCGGTGGTAAT > 2:571212/1‑249 ATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCGGTGTCGCCGGTGGTAATC < 2:54901/249‑1 TGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCGGTGTAGCCGGTGGTAATCACGT > 2:876179/1‑249 GTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCGGTGTCGCCGGTGGTAATCACGTG > 1:14301/1‑249 CCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCGGTGTCGCCGGTGGTAATCACGTGGC > 1:1206750/1‑249 CATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCGGTGTCGCCGGTGGTAATCACGTGGCC > 1:656684/1‑249 ATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCGGTGTCGCCGGTGGTAATCACGTGGCCA > 2:1189109/1‑249 GAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCGGTGTCGCCGGTGGTAATCACGTGGCCACC < 1:332602/249‑1 TCGTAACCGCTGCAAATGGTCAAGAGACCGAAACCGAAGATATTGAGGTGAAGCTTTCCTTCCCCACCGAGTCTTCCCAAGGCCTAGTGTTCACTCAGGTCACCGTCGATGGACAGGTTCTCTTCCTCTAATCCTCCATAATTAGAGAGCGTAAGGCCCCTACTTCCTGTTTTAGGAAATAGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP025533/1045157‑1044913‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCGGTGTCGCCGGTGGTAATCACGTGGCCACCGTGTG > CP025533/2793967‑2794212 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |