New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP025533 | = 273426 | 146 (1.060) | 137 (1.010) +GCTA |
118/488 | 0.0 | 49.2% | coding (1035/1035 nt) | CYL77_01370 | aspartate‑semialdehyde dehydrogenase |
? | CP025533 | 1241641 = | 141 (1.020) | coding (1636/1653 nt) | CYL77_05965 | arginine‑‑tRNA ligase |
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
GCCGAATTCGACAAGGCAATCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTGCTACACTTTAAGCGGGGTTTTAATGTTTGAGGGGCGATGGGGGTCGAGCTTGTGAAGTGGAATTTTCCACAAGTTTTAAGTTTCTTTAGCAGGGGAAACACTGCTGATAGCACTAGCGATAAAGAACATGAAAATGCAACGGAGCTAGCGGCCGAAGCTTTAGCGGATGTCATTTTTCAGTGGAAAAACTGGGTCTACCGACGCGTTGATAGTGTGCA > CP025533/273178‑273674 | ccGAATTCGACAAGGCAATCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTaaa < 2:596158/249‑1 (MQ=255) ccGAATTCGACAAGGCAATCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGACCTGCTGGTTAAGTaaa < 2:572720/249‑1 (MQ=255) gAATTCGACAAGGCAATCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgct < 2:1179373‑M1/249‑4 (MQ=255) ttCGACAAGGCAATCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagc > 1:1003877‑M1/1‑243 (MQ=255) gACAAGGCAATCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcacc > 1:700207‑M1/1‑240 (MQ=255) aaGGCAATCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggn > 2:634635‑M1/1‑237 (MQ=255) ggCAATCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggaga < 1:265368‑M1/249‑15 (MQ=255) cAATCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaag < 2:143016‑M1/249‑17 (MQ=255) aaTCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTaaaaa > 2:162629/1‑249 (MQ=255) tCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACt < 1:235728/249‑1 (MQ=255) ccGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaa > 1:1221534‑M1/1‑227 (MQ=255) cGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaac > 2:932133‑M1/1‑226 (MQ=255) gTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCt > 2:504175/1‑249 (MQ=255) gTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCt > 1:645910/1‑249 (MQ=255) ggACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaat > 2:622916‑M1/1‑223 (MQ=255) aCCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCCACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCTTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAATCACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAg < 2:1249956/249‑1 (MQ=255) aGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTGc < 1:442470/249‑1 (MQ=255) gcgcAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacn > 2:781906‑M1/1‑216 (MQ=255) gcgcAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTGCTa < 1:1319985/249‑1 (MQ=255) gcAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTGCTaca > 1:550454/1‑249 (MQ=255) agaTCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaaa < 2:828113‑M1/249‑41 (MQ=255) agaTCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGACCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaaa > 2:231088‑M1/1‑209 (MQ=255) gaTCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTGCTACACTTTaa < 2:1153453/249‑1 (MQ=255) gggTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTGCTACACTTTAAGCgggg < 1:368555/249‑1 (MQ=255) gggTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTGCTACACTTTAAGCgggg < 1:980247/249‑1 (MQ=255) 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gTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaaaatttcaatgaacttcccgcacac < 2:1084894‑M1/249‑64 (MQ=255) cGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaaaatttcaatgaacttcccgcacacgtatggccacg < 1:17259‑M1/249‑75 (MQ=255) cccAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaaaatttcaatgaacttcccgcacacgtatggccacgcaatgc < 1:500170‑M1/249‑81 (MQ=255) ccAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTGCTACACTTTAAGCGGGGTTTTAATGTTTGAGGGGCGATGGGGGTCGAGCtt > 2:1338448/1‑249 (MQ=255) aaCCCCCCTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGCCGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTGCTACACTTTAAGCGGGGTTTTAATGTTTGAGGGGCGATGGGGGTCGAGCTtgt < 2:202164/249‑1 (MQ=255) aaCCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaaaatttcaatgaacttcccgcacacgtatggccacgcaatgccgt > 1:1275300‑M1/1‑166 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |