| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | = 1777777 | 73 (0.530) | 5 (0.050) | 5/340 | 17.8 | 6.9% | intergenic (‑3/+31) | CYL77_08485/CYL77_08490 | tRNA‑Gly/tRNA‑Val |
| ? | CP025533 | 1777992 = | 84 (0.890) | intergenic (‑4/‑344) | CYL77_08495/CYL77_08500 | tRNA‑Gly/tRNA‑Val | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGCACTACTTAGAACTTGTTCCTGCTTGTTCCGT > CP025533/1777535‑1778023 | ccTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCACCCGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACAtt < 1:8329/249‑1 (MQ=255) ctctTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTg > 1:842955/1‑249 (MQ=255) atctTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATGCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTg < 1:519270/248‑1 (MQ=255) ttCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGAtt > 1:314310/1‑249 (MQ=255) ccGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTaa > 1:478535/1‑249 (MQ=255) cGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTaan > 1:428960/1‑248 (MQ=255) gtgtCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGCACGTGGTAAACATACCAGCGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGGCCCTCACCTTGGCAAGGGGATGCGCTCCCAACTGCGCTCCATCCGCATGAACATTgcataact > 2:451328/1‑242 (MQ=255) tgtCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTaatgn > 1:696771/1‑246 (MQ=255) tgtCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAagn > 1:960691/1‑248 (MQ=255) tgtCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTACGCACGTCACACATACACCAGACCAGACGACGCCGCTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAaga < 2:733608/249‑1 (MQ=37) 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aGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAAGCTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAAGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACACCCCAATGAACATGGATTaaaacgatcgttcg > 2:1075635/1‑238 (MQ=255) ctctCCCGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCct < 1:1050617/249‑1 (MQ=255) cccGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACAATGTTTAAAGTGGTTGTTCGTCctctgg > 2:783494/1‑247 (MQ=255) ccGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGTTTAAATAGTTTGTTCGTCCTCTTgt > 2:1142754/1‑248 (MQ=255) cGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGt > 2:496583/1‑249 (MQ=255) aGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGCACATTTTTTAACGAGTTTCTTCTTCCTCTTggctcccc > 2:992240/1‑243 (MQ=37) tAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGTTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGAtc > 1:1283498/1‑248 (MQ=255) ccAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGAtt > 1:71576/1‑249 (MQ=255) cAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTg > 1:28633/1‑249 (MQ=255) gttGGAAACGGGCATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTTCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATGCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGAcc < 1:9530/247‑1 (MQ=255) aaCGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTcc > 1:153705/1‑249 (MQ=255) gtgtGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGct > 1:159455/1‑249 (MQ=255) cACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTTCTCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGCAAGCGCTCTccc > 1:466868/1‑249 (MQ=255) aCGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCg > 1:773794/1‑249 (MQ=255) aCGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCg > 1:444274/1‑249 (MQ=255) 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aaTTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGagag > 1:819052/1‑249 (MQ=255) gCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGAt < 1:57754/249‑1 (MQ=255) ccTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATg > 1:534107/1‑249 (MQ=255) 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ccAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGATCTCGCGAcccg > 1:440269/1‑248 (MQ=255) agCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCAcc < 1:1061536/249‑1 (MQ=255) agCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCGACCTCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCAcc < 1:334173/249‑1 (MQ=255) aCGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAg > 1:97837/1‑249 (MQ=255) gaCTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGa < 1:1179499/249‑1 (MQ=255) gAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATgcgc > 1:1190528/1‑249 (MQ=255) aaCTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGCGCGCCATACTGGGATTGAACCAGTAACCTCTTCCGTGTCAGACACGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGAGCGACACATTTCACCGATAGGCCCGGCGAAATGACAAAGGCTGACGAGACTCGAACTCGAGACCCGCACCTAGGAAAGGTAATgctcg > 2:98877/1‑246 (MQ=17) tGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGCCCCTCACCTTGGCAAGGGGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGCac > 2:1263854/1‑249 (MQ=255) ccAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGCACTACTTAGAAc > 1:119257/1‑249 (MQ=255) aaCTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGCACTACTTAGAACtt < 1:778235/249‑1 (MQ=255) aCTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGCACTACTTAGAACTTg > 1:1108851/1‑249 (MQ=255) tGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCt > 2:114216/1‑191 (MQ=255) tGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCt < 1:114216/191‑1 (MQ=255) gcTACATCCTCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGCACTACTTAGAACTTGTTCCt < 1:1142988/249‑1 (MQ=255) gcTACATCCGCATGAACGTTGATTAATGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGACTGAACCAGTGACCTCTTGCGCGTCAGGGAAGCGCTCTGCCGCTCAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGGCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGCACTACTTAGAACTTGTTCCt < 1:22127/249‑1 (MQ=255) cTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGCACTACTTAGAACTTGTTCCTg > 1:49140/1‑249 (MQ=255) tCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGCACTACTTAGAACTTGTTCCTGCTTGt > 2:191543/1‑249 (MQ=255) ccGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGCACTACTTAGAACTTGTTCCTGCTTGtt > 1:91531/1‑249 (MQ=255) ccGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGCACTACTTAGAACTTGTTCCTGCTTGtt > 1:435427/1‑249 (MQ=255) gCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGCACTACTTAGAACTTGTTCCTGCTTGTTcc > 2:655584/1‑249 (MQ=255) aTGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGCACTACTTAGAACTTGTTCCTGCTTGTTCCGt > 1:320164/1‑249 (MQ=255) | CCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCGGGACATTTCATCGATTGGCCCGGTGAAATGAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGCACTACTTAGAACTTGTTCCTGCTTGTTCCGT > CP025533/1777535‑1778023 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |