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Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
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aGCGCAGGGGTCTTAGATGACGCCCTGTGCCAGCATCGCGTCAGCTACCccatccactaaacttaaacactgctcatcaactgtcatgatttcctcgttcccatctcggctgcatgcgcgcacgattttaaagtgtgtacctgggccatttagtgatgttggtggttcccattgagggcaccatgtacatcctaggcgtttgctggagcaaaatgcctgtgaaaaatctgatcctgaaacttttaaaaa > 1:425926‑M1/1‑49 (MQ=255) cgcAGGGGTCTTAGATGACGCCCTGTGCCAGCATCGCGTCAGCTACCccatccactaaacttaaacactgctcatcaactgtcatgatttcctcgttcccatctcggctgcatgcgcgcacgattttaaagtgtgtacctgggccatttagtgatgttggtggttcccattgagggcaccatgtacatcctaggcgtttgctggagcaaaatgcctgtgaaaaatctgatcctgaaacttttaaaaact < 2:427447‑M1/249‑203 (MQ=255) gcAGGGGTCTTAGATGACGCCCTGTGCCAGCATCGCGTCAGCTACCccatccactaaacttaaacactgctcatcaactgtcatgatttcctcgttcccatctcggctgcatgcgcgcacgattttaaagtgtgtacctgggccatttagtgatgttggtggttcccattgagggcaccatgtacatcctaggcgtttgctggagcaaaatgcctgtgaaaaatctgatcctgaaacttttaaaaactg > 2:729367‑M1/1‑46 (MQ=255) 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GTACTGATTGTCGATGAAGCCACCAGCCACCAAGATGCGCTCAATCAAGCGGATCTTTCCCAGACTCTGGCCACGCTTAAAGACACCACGGTGATCATCATTGCGCACCGCACAGCTGCATTAACCCATGTGGATCGGATAATTGACCTGGAAGAAATCAAAAATCCCTGATCCTTAACGCGGATCAGGGGTTTAAGTAAAGCGCAGGGGTCTTAGATGACGCCCTGTGCCAGCATCGCGTCAGCTACCTTCTTGAAGCCAGCAATGTTAGCGCCGACAACGTAATCGTTCTCGTGTCCATACTCTGCTGCGGTCTCTGCACAGGTCTTGAAGATGTTCTTCATGATCACCTGGAGGCGCTCGTCGGTGTACTCGAAGCTCCAGGAATCGCGCGAAGCGTTCTGCTGCATCTCCAGAGCGGAGGTTGCAACGCCACCAGCGTTAGCTGCCTTGCCTGGTCCGAAGCGGATGTCGCGCTCACGGAAGACCTCAACA > CP025533/2200303‑2200797 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |