| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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|
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| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP025533 | = 1778275 | 0 (0.000) | 138 (1.090) +TGTTTAAGTTTAGTGGATGG |
118/456 | 0.0 | 100% | intergenic (‑287/‑61) | CYL77_08495/CYL77_08500 | tRNA‑Gly/tRNA‑Val |
| ? | CP025533 | 2000080 = | 0 (0.000) | intergenic (‑471/+15) | CYL77_09540/CYL77_09545 | hypothetical protein/anion transporter | |||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
ATCGCTCACCCTCTCGCCCGCGTGGGGTGAACGTGGGGTGAGTGGATTCATTTCTGGTCATTCTTGGGCGCTTCCTGCTAAAATGAAGCCATCGCGACCTCGCGTTTTATGAAGGCACCAGGGCGCTACGGCTGGTTCGAACCCAGCTAGGACCACAACTAAACCCCCTGTAAACAGGGGGTTTTCGTCGTTTCATGACTATCTATAGCTTCTTCAGCTTTTCAAGGGATGAAGGTTCCAGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAACCATGGTTGCCACAGTTGGGAGGAAAAATACGATGAGCGCTCCCCCGATGATGTCAAAGCTAATTCCAGTGCGGATCATTCGAGCAATGGATACGCAGCCCGAACCGTAGACGATGGCGTTCTGCGGTGTGGAAATCGGAAGCATGAACCCAAATGAAGCACCGAATGCAGCCGCCATAGCCGGGATAACTGGATCAATACCGGCCGCTATGGCAAG > CP025533/1999840‑2000325 | cgctccctcgaacacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGa > 2:965856‑M2/241‑249 (MQ=255) ctcgaacacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACg > 1:1360928‑M2/235‑249 (MQ=255) cgaacacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTc < 1:606894‑M2/17‑1 (MQ=255) acacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGc > 2:81130‑M2/230‑249 (MQ=255) cacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGcc > 1:103905‑M2/229‑249 (MQ=255) acaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCa > 1:122130‑M2/228‑249 (MQ=255) atccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTc > 2:1302719‑M2/224‑249 (MQ=255) gccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAACCATGGTTGcc > 2:728987‑M2/210‑249 (MQ=255) acaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAACCATGGTTGCcaca < 2:397847‑M2/43‑1 (MQ=255) acaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAACCATGGTTGCcaca < 1:157773‑M2/43‑1 (MQ=255) caaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAACCATGGTTGCCACAg < 2:984071‑M2/44‑1 (MQ=255) aaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAACCATGGTTGCCACAGtt < 1:13466‑M2/46‑1 (MQ=255) agcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAACCATGGTTGCCACAGTTgg > 1:551868‑M2/202‑249 (MQ=255) 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ATCGCTCACCCTCTCGCCCGCGTGGGGTGAACGTGGGGTGAGTGGATTCATTTCTGGTCATTCTTGGGCGCTTCCTGCTAAAATGAAGCCATCGCGACCTCGCGTTTTATGAAGGCACCAGGGCGCTACGGCTGGTTCGAACCCAGCTAGGACCACAACTAAACCCCCTGTAAACAGGGGGTTTTCGTCGTTTCATGACTATCTATAGCTTCTTCAGCTTTTCAAGGGATGAAGGTTCCAGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAACCATGGTTGCCACAGTTGGGAGGAAAAATACGATGAGCGCTCCCCCGATGATGTCAAAGCTAATTCCAGTGCGGATCATTCGAGCAATGGATACGCAGCCCGAACCGTAGACGATGGCGTTCTGCGGTGTGGAAATCGGAAGCATGAACCCAAATGAAGCACCGAATGCAGCCGCCATAGCCGGGATAACTGGATCAATACCGGCCGCTATGGCAAG > CP025533/1999840‑2000325 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |