| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | = 2632709 | NA (NA) | 148 (1.080) | 123/494 | 0.0 | 98.7% | intergenic (‑128/‑114) | CYL77_12475/CYL77_12480 | ISL3 family transposase/hypothetical protein |
| ? | CP025533 | 2702553 = | 2 (0.010) | pseudogene (461/474 nt) | CYL77_12850 | IS630 family transposase | |||||
Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
AGTTACGTACCTAGCTTCGCTAAAAGTGATAGCATTCGTCGGCTTTCTTGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTCGTTTTAAGTATCGGGCGATAGAGGAAAGGATCTCCTCCGCGGTTTTGGTCCAGATAAACGGCTTAGGATCCTCGTTCCATGCTTTCACCCAGTTGCGTAAATCTTTCTCCAGGGCCTGGACACTCCGATGATCAGAACGCTGGAGTAACTCCCGGGTCACCTCAGCGAACAACCGTTCAACCTGGTTGATCCAGGACGAATACGTCGGGGTGAAGTGCATGTGAAACCGTG > CP025533/2702307‑2702793 | gagtgcgtctgcttcgatcagggtgtaatcacctgcatcggaagcgccggtgatggtgagtcctagttccgcagtgcggcagatggtgtcagcgatgatgttgccggtagacttcatgggtagagccttttgttggtgtttggttagcttagatacctaaaccttaaccctgacaaaaggctcgattattttcgggtctacaccgctagcccaggttctgtgatgtaccccaaaaccggaagggcCCGt > 2:1231396‑M2/246‑249 (MQ=255) gtgcgtctgcttcgatcagggtgtaatcacctgcatcggaagcgccggtgatggtgagtcctagttccgcagtgcggcagatggtgtcagcgatgatgttgccggtagacttcatgggtagagccttttgttggtgtttggttagcttagatacctaaaccttaaccctgacaaaaggctcgtttattttcgggtctacaccgctagcccaggttctgtgatgtaccccaaaaccggaagggcCCGTTa > 1:795609‑M2/244‑249 (MQ=255) gCTTCGCTAAAAGTGATAGCATTCGTCGGCTTTCTTGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTggctctt > 1:177941‑M2/1‑242 (MQ=255) cGCTAAAAGTGATAGCATTCGTCGGCTTTCTTGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTggctcttcctg > 1:1159373‑M2/1‑238 (MQ=255) cGCTAAAAGTGATAGCATTCGTCGGCTTTCTTGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTggctcttcctg < 1:845995‑M2/249‑12 (MQ=255) atcagggtgtaatcacctgcatcggaagcgccggtgatggtgagtcctagttccgcagtgcggcagatggtgtcagcgatgatgttgccggtagacttcatgggtagagccttttgttggtgtttggttagcttagatacctaaaccttaaccctgacaaaaggctcgtttattttcgggtctacaccgctagcccaggttctgtgatgtaccccaaaaccggaagggcCCGTTAATTCGTTTTAAGTa > 1:667330‑M2/230‑249 (MQ=255) atcagggtgtaatcacctgcatcggaagcgccggtgatggtgagtcctagttccgcagtgcggcagatggtgtcagcgatgatgttgccggtagacttcatgggtagagccttttgttggtgtttggttagcttagatacctaaaccttaaccctgacaaaaggctcgtttattttcgggtctacaccgctagcccaggttctgtgatgtaccccaaaaccggaagggcCCGTTAATTCGTTTTAAGTa < 2:510424‑M2/20‑1 (MQ=255) cTAAAAGTGATAGCATTCGTCGGCTTTCTTGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTggctcttcctgtt > 1:455825‑M2/1‑236 (MQ=255) ggtgtaatcacctgcatcggaagcgccggtgatggtgagtcctagttccgcagtgcggcagatggtgtcagcgatgatgttgccggtagacttcatgggtagagccttttgttggtgtttggttagcttagatacctaaaccttaaccctgacaaaaggctcgtttattttcgggtctacaccgctagcccaggttctgtgatgtaccccaaaaccggaagggcCCGTTAATTCGTTTTAAGTATCggg < 2:364511‑M2/25‑1 (MQ=255) gatttattcacctgcatccaaagcgccgttgagggcgagtcctagttccgcagtgcggcagatggtcgcagcgatgatgttgccggtagacttcatgcgtagagccttttgttggtgtttggttaccttagatacctaaaccttacccctgacaaaaggctcgtttattttcgggtctacaccgctagcccaggttctgtgatgtaccccaaaaccggaagggcCCGTTAATTCGTTTTAAGTATCggg < 1:993557‑M2/25‑1 (MQ=255) aaaGTGATAGCATTCGTCGGCTTTCTTGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTggctcttcctgttttn < 1:16915‑M2/249‑17 (MQ=255) tGATAGCATTCGTCGGCTTTCTTGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTggctcttcctgttttagagt > 1:1128407‑M2/1‑229 (MQ=255) cacctgcatcggaagcgccggtgatggtgagtcctagttccgcagtgcggcagatggtgtcagcgatgatgttgccggtagacttcatgggtagagccttttgttggtgtttggttagcttagatacctaaaccttaaccctgacaaaaggctcgtttattttcgggtctacaccgctagcccaggttctgtgatgtaccccaaaaccggaagggcCCGTTAATTCGTTTTAAGTATCGGGCGATagag > 2:1263522‑M2/217‑249 (MQ=255) 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tcgtcgGCTTTCTTGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGATTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGAGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTCACCCGTTAATTggatattcctgttttagagtgcattgatc < 2:582908‑M2/249‑30 (MQ=255) gtcgGCTTTCTTGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTggctcttcctgttttagagtgcattgatctt < 1:1006228‑M2/249‑32 (MQ=255) tcgGCTTTCTTGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTggctcttcctgttttagagtgcattgatctta > 2:172097‑M2/1‑217 (MQ=255) ggCTTTCTTGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTggctcttcctgttttagagtgcattgatcttatg > 1:140280‑M2/1‑215 (MQ=255) gaagcgccggtgatggtgagtcctagttccgcagtgcggcagatggtgtcagcgatgatgttgccggtagacttcatgggtagagccttttgttggtgtttggttagcttagatacctaaaccttaaccctgacaaaaggctcgtttattttcgggtctacaccgctagcccaggttctgtgatgtaccccaaaaccggaagggcCCGTTAATTCGTTTTAAGTATCGGGCGATAGAGGAAAGGAtctc < 2:942852‑M2/44‑1 (MQ=255) aagcgccggtgatggtgagtcctagttccgcagtgcggcagagggtgtcagcgatgatgttgccggtagacttcatgggtagagccttttgttggtgtttggttagcttagatacctaaaccttaaccctgacaaaaggctcgtttattttcgggtctacaccgctagcccaggttctgtgatgtaccccaaaaccggaagggcCCGTTAATTCGTTTTAAGTATCGGGCGATAGAGGAAAGGATctcc < 2:1095016‑M2/45‑1 (MQ=255) ttCTTGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTggctcttcctgttttagagtgcattgatcttatggacc > 1:221109‑M2/1‑211 (MQ=255) gccggtgatggtgagtcctagttccgtagtgcggcagatggtgtcagcgatgatgttgccggtagacttcatgggtagagccttttgttggtgtttggttagcttagatacctaaaccttaaccctgacaaaaggctcgtttattttcgggtctacaccgctagcccaggttctgtgatgtaccccaaaaccggaagggcCCGTTAATTCGTTTTAAGTATCGGGCGATAGAGGAAAGGATCTCCTCcg < 2:80848‑M2/49‑1 (MQ=255) gccggtgatggtgagtcctagttccgcagtgcggcagatggtgtcagcgatgatgttgccggtagacttcatgggtagagccttttgttggtgtttggttagcttagatacctaaaccttaaccctgacaaaaggctcgtttattttcgggtctacaccgctagcccaggttctgtgatgtaccccaaaaccggaagggcCCGTTAATTCGTTTTAAGTATCGGGCGATAGAGGAAAGGATCTCCTCcg > 1:781074‑M2/201‑249 (MQ=255) cTTGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTggctcttcctgttttagagtgcattgatcttatggaccaa < 2:499395‑M2/249‑41 (MQ=255) ntgGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTggctcttcctgttttagagtgcattgatcttatggaccaac > 1:932938‑M2/2‑208 (MQ=255) ttCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTggctcttcctgttttagagtgcattgatcttatggaccaactgccc > 1:482234‑M2/1‑203 (MQ=255) 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AGTTACGTACCTAGCTTCGCTAAAAGTGATAGCATTCGTCGGCTTTCTTGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTCGTTTTAAGTATCGGGCGATAGAGGAAAGGATCTCCTCCGCGGTTTTGGTCCAGATAAACGGCTTAGGATCCTCGTTCCATGCTTTCACCCAGTTGCGTAAATCTTTCTCCAGGGCCTGGACACTCCGATGATCAGAACGCTGGAGTAACTCCCGGGTCACCTCAGCGAACAACCGTTCAACCTGGTTGATCCAGGACGAATACGTCGGGGTGAAGTGCATGTGAAACCGTG > CP025533/2702307‑2702793 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |