Read alignment evidence... | |||||||||||
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Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
CCTGACTCAACGCATCGCGTTGTTTGCTTCTGAGTTGGTGTGCTCGGCACCCAATTGTGACAGGCCGCAGTTAGAGTGCGAGGTTCATCATTTAGATCCCTGGATGAGAGGTGGGCTGACCAACCTGGTCAATCTCACGCATCAGTGCTTTAATCACCACCCACGCAACGATGATTCCAGGAGTGGGGTCAATGGTAAAGGGTTTATGGACCGCGATCCTGCTACTGGAAGAGTGGGGCACTACCCAGTGGGTGGTGAGGGGCCGGTGTTTAACCGGTCGGCTGCTGCTGATAGTTCGGGTGGTGCGTGGGCCAGACGTAAACATCATGGCCCACCACCCGAACCGCCGAGCCCGCCGGATCCACCTGGTCCTGAGCCGGATCCTGGTGATGAGGGCAGATTGTTCTAGCCCTTGTTATTGCTGAGTTGTTGTCATGTTGTTGTGCCTGTTGTCAGTCGCCCCAGTGTGTCTGATACCGGACACACCCATGCCTTG > CP025533/2420489‑2420984 | cATCGCGTTGTTTGCTTCTGAGTTGGTGTGCTCGGCACCCAATTGTGACAGGCCGCAGTTAGAGTGCGAGGTTCATCATTTAGATCCCTGGATGAGAGGTGGGCTGACCAACCTGGTCAATCTCACGCATCAGTGCTTTAATCACCACCCACGCAACGATGATTCCAGGAGTGGGGTCAATGGTAAAGGGTTTATGGACCGCGATCCTGCTACTGGAAGAGTGGGGCACTACCCAGTGGGTGGTGAggg < 2:521845/249‑1 (MQ=32) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |