| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | = 273426 | 149 (1.120) | 136 (1.040) +GCTA |
120/488 | 0.0 | 49.9% | coding (1035/1035 nt) | CYL77_01370 | aspartate‑semialdehyde dehydrogenase |
| ? | CP025533 | 1241641 = | 129 (0.970) | coding (1636/1653 nt) | CYL77_05965 | arginine‑‑tRNA ligase | |||||
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
CCGAATTCGACAAGGCAATCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTGCTACACTTTAAGCGGGGTTTTAATGTTTGAGGGGCGATGGGGGTCGAGCTTGTGAAGTGGAATTTTCCACAAGTTTTAAGTTTCTTTAGCAGGGGAAACACTGCTGATAGCACTAGCGATAAAGAACATGAAAATGCAACGGAGCTAGCGGCCGAAGCTTTAGCGGATGTCATTTTTCAGTGGAAAAACTGGGTCTACCGACGCGTTGATAGTGTGC > CP025533/273179‑273673 | aTTCGACAAGGCAATCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAAcc > 2:1219620/1‑249 (MQ=255) tCGACAAGGCAATCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCg < 2:1213245/249‑1 (MQ=255) aaGGCAATCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggn > 1:339056‑M1/1‑237 (MQ=255) aaTCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaaga < 2:1191264‑M1/249‑18 (MQ=255) aaTCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTaaaaa < 2:523258/249‑1 (MQ=255) aaTCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTaaaaa > 2:1032149/1‑249 (MQ=255) aTCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAAc < 1:959486/249‑1 (MQ=255) ccGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaa > 2:1170103‑M1/1‑227 (MQ=255) cGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGc < 1:501513/249‑1 (MQ=255) cAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGCCGCATCCGTCAGGACTCCACGGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTg < 1:681915/249‑1 (MQ=255) 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aGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGTTCTGTTTCTCGTCGTATCTGTCGACAACCTCCGCAACGGTGCTGCGCTAAACACCATCAAGATCGCTCCGCTACTGGCCAAGTAAAAACCCACCATTCAAAACTACGCTTGAGTTCTaaccc > 2:687427/1‑245 (MQ=255) aGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTGCTACACt < 1:179482/249‑1 (MQ=255) ggAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTGCTACACtt < 1:613257/249‑1 (MQ=255) 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nnntgggTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaaaatt < 2:770726‑M1/246‑44 (MQ=255) gggTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaaaatttcaa > 1:485555‑M1/1‑202 (MQ=255) ccGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTGCTACACTTTAAGCGGGGTTTTa < 2:933868/249‑1 (MQ=255) 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cAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaaaatttcaatgaacttcccgcacacgtatggccacgcaatgccg < 2:928887‑M1/249‑83 (MQ=255) aaCCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaaaatttcaatgaacttcccgcacacgtatggccacgcaatgccgt > 1:1002554‑M1/1‑166 (MQ=255) aCCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACTAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCAGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaaaatttcaatgaacttcccgcacacgtatggccacgcaatgccgtg > 2:755772‑M1/1‑165 (MQ=255) 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tCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaaaatttcaatgaacttcccgcacacgtatggccacgcaatgccgtgcgccaagaagacggcgttgtcaccgtcgctggtgtgcctctgcctgacctcgctgaagaatacggaaccccactgttcgtagtcgacgaggacgatttccgttcccgctgtcgcgacatggctaccgcattcggtg < 1:1163118‑M1/249‑221 (MQ=255) cTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaaaatttcaatgaacttcccgcacacgtatggccacgcaatgccgtgcgccaagaagacggcgttgtcaccgtcgctggtgtgcctctgcctgacctcgctgaagaatacggaaccccactgttcgtagtcgacgaggacgatttccgttcccgctgtcgcgacatggctaccgcattcggtggaccaggca > 1:539386‑M1/1‑20 (MQ=255) tGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaaaatttcaatgaacttcccgcacacgtatggccacgcaatgccgtgcgccaagaagacggcgttgtcaccgtcgctggtgtgcctctgcctgacctcgctgaagaatacggaaccccactgttcgtagtcgacgaggacgatttccgttcccgctgtcgcgacatggctaccgcattcggtggaccaggcaa > 1:9044‑M1/1‑19 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |