| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP025533 | = 1243002 | 137 (1.030) | 129 (0.970) | 109/494 | 0.1 | 48.5% | intergenic (+4/+281) | lysA/CYL77_05975 | diaminopimelate decarboxylase/hypothetical protein |
| ? | CP025533 | = 2794955 | 137 (1.030) | intergenic (‑16/‑51) | CYL77_13265/CYL77_13270 | diaminopimelate dehydrogenase/polyhydroxybutyrate depolymerase | |||||
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
AAGCACCCGCATCGTGGGCTCCCACTGCGAATCCGGCGATATCCTGATCAACGATGAAATCTACCCATCTGACATCACCAGCGGCGACTTCCTTGCACTCGCAGCCACCGGCGCATACTGCTACGCCATGAGCTCCCGCTACAACGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGAAAAGCCGGTCATTGTCGTATGAAGTCTGCGCACGAGAAGTTGAGCGGAAGAAGTCGGTGTTAAGAAGTCGA > CP025533/1242755‑1243250 | cACCCGCATCGTGGGCTCCCACTGCGAATCCGGCGATATCCTGATCAACGATGAAATCTACCCATCTGACATCACCAGCGGCGACTTCCTTGCACTCGCAGCCACCGGCGCATACTGCTACGCCATGAGCTCCCGCTACAACGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTggag < 1:1029914‑M1/249‑5 (MQ=255) tGGGCTCCCACTGCGAATCCGGCGATATCCTGATCAACGATGAAATCTACCCATCTGACATCACCAGCGGCGACTTCCTTGCACTCGCAGCCACCGGCGCATACTGCTACGCCATGAGCTCCCGCTACAACGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTggaggattacaagaa < 2:440189‑M1/249‑16 (MQ=255) gCTCCCACTGCGAATCCGGCTATATCCTGATCAACGATGAAATCTACCCATCTGACATCACCAGCGGCGACTTCCTTGCACTCGCAGCCACCGGCGCATACTGCTACGCCATGAGCTCCCGCTACAACGCCTTCACGCGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCg < 1:163023/249‑1 (MQ=255) tCCCACTGCGAATCCGGCGATATCCTGATCAACGATGAAATCTACCCATCTGACATCACCAGCGGCGACTTCCTTGCACTCGCAGCCACCGGCGCATACTGCTACGCCATGAGCTCCCGCTACAACGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGcc > 1:199455/1‑249 (MQ=255) ncccaCTGCGAATCCGGCGATATCCTGATCAACGATGAAATCTACCCATCTGACATCACCAGCGGCGACTTCCTTGCACTCGCAGCCACCGGCGCATACTGCTACGCCATGAGCTCCCGCTACAACGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTggaggattacaagaacatga < 2:1073104‑M1/248‑21 (MQ=255) ncccACTGCGAATCCGGCGATATCCTGATCAACGATGAAATCTACCCATCTGACATCACCAGCGGCGACTTCCTTGCACTCGCAGCCACCGGCGCATACTGCTACGCCATGAGCTCCCGCTACAACGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGcc < 2:113029/248‑1 (MQ=255) ccGGCGATATCCTGATCAACGATGAAATCTACCCATCTGACATCACCAGCGGCGACTTCCTTGCACTCGCAGCCACCGGCGCATACTGCTACGCCATGAGCTCCCGCTACAACGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTggaggattacaagaacatgaccaacatccgcgt > 2:1008107‑M1/1‑216 (MQ=255) 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aaaTCTACCCATCTGACATCACCAGCGGCGACTTCCTTGCACTCGCAGCCACCGGCGCATACTGCTACGCCATGAGCTCCCGCTACAACGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTtgggtttctg > 2:592627/1‑249 (MQ=255) aaTCTACCCCTCTGACATCACCAGCGGCGACTTCCTTGCACTCGCAGCCACCGGCGCATACTGCTACGCCATGAGCTCCCGCTACAACGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTtgggtttctgg < 1:1058220/249‑1 (MQ=255) aaTCTACCCATCTGACATCACCAGCGGCGACTTCCTTGCACTCGCAGCCGCCGGCGCATACTGCTACGCCATGAGCTCCCGCTACAACGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTtgggtttctgg > 2:666463/1‑249 (MQ=255) aTCTACCCATCTGACATCACCAGCGGCGACTTCCTTGCACTCGCAGCCACCGGCGCATACTGCTACGCCATGAGCTCCCGCTACAACGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTggaggattacaagaacatgaccaacatccgcgtagctatcgtgggctacggaaacctgg < 2:637590‑M1/249‑60 (MQ=255) aCCCATCTGACATCACCAGCGGCGACTTCCTTGCACTCGCAGCCACCGGCGCATACTGCTACGCCATGAGCTCCCGCTACAACGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTtgggtttctgggtttc > 2:342349/1‑249 (MQ=255) cccATCTGACATCACCAGCGGCGACTTCCTTGCACGCGCAGCCACCGGCGCATACTGCTACGCCATGAGCTCCCGCTACAACGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCGCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTgggtttctgggtttct < 2:1170216/249‑1 (MQ=255) naTCTGACATCACCAGCGGCGACTTCCTTGCACTCGCAGCCACCGGCGCATACTGCTACGCCATGAGCTCCCGCTACAACGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCttt < 1:1232451/248‑1 (MQ=255) cATCTGACATCGCCAGCGGCGACTTCCTTGCACTCGCAGCCACCGGCGCATACTGCTACGCCATGAGCTCCCGCTACAACGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCttt < 1:27159/249‑1 (MQ=255) cATCTGACATCACCAGCGGCGACTTCCTTGCACTCGCAGCCACCGGCGCATACTGCTACGCCATGAGCTCCCGCTACAACGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCttt > 1:942777/1‑249 (MQ=255) 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aaCGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTcg > 2:1312726/1‑249 (MQ=255) aaCGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTcg < 2:870136/249‑1 (MQ=255) gCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGt > 1:472813/1‑249 (MQ=255) ccTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTggaggattacaagaacatgaccaacatccgcgtagctatcgtgggctacggaaacctgggacgcagcgtcgaaaagcttattgccaagcagcccgacatggaccttgtaggaatcttctcgcgccgggccaccctcgacacaaagac > 2:984195‑M1/1‑102 (MQ=255) cTTCACAGGGCCCGCCATCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTCCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCCTCGCCGTGGAGGGCGGTTCTGGGTTTCTGGCGGTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGAGGTCTGCAGTCGAGGCTGCAGAGGTTTTATTCCCGGACTTACCGTGGGCTGGCTTCGCGtcc > 2:193169/1‑247 (MQ=255) cacaCGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCa > 1:1173588/1‑249 (MQ=255) acacGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCaa > 1:724709/1‑249 (MQ=255) ggCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTggaggattacaagaacatgaccaacatccgcgtagctatcgtgggctacggaaacctgggacgcagcgtcgaaaagcttattgccaagcagcccgacatggaccttgtaggaatcttctcgcgccgggccaccctcgacacaaagacgccagtctt > 1:808204‑M1/1‑93 (MQ=255) ggCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGAGTCTAGGGGTCTGCAGTCGTGGCTTCAGAGGATTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGAGTTCGCGTGCTCAACTtc > 1:560482/1‑249 (MQ=255) 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gcTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGaaa > 2:260138/1‑249 (MQ=255) tGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTggaggattacaagaacatgaccaacatccgcgtagctatcgtgggctacggaaacctgggacgcagcgtcgaaaagcttattgccaagcagcccgacatggaccttgtaggaatcttctcgcgccgggccaccctcgacacaaagacgccagtctttgatgtcgccgacgtggacaagcac > 1:127692‑M1/1‑68 (MQ=255) aGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTggaggattacaagaacatgaccatcatccgcgtagctatcgtgggctacggaaacctgggacgcagcgtcgaaaagcttattgccaagcagcccgacatggaccttgtaggaatcttctcgcgccgggccaccctcgacacaaagacgccagtctttgatgtcgccgacgtggacaagcacgccg < 1:438650‑M1/249‑186 (MQ=255) ccGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGAAAAGCCGGTCAtt > 1:924594/1‑249 (MQ=255) ccTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTggaggattacaagaacatgaccaacatccgcgtagctatcgtgggctacggaaacctgggacgcagcgtcgaaaagcttattgccaagcagcccgacatggaccttgtaggaatcttctcgcgccgggccaccctcgacacaaagacgccagtctttgatgtcgccgacgtggacaagcacgccgacgacgtg < 2:104355‑M1/249‑194 (MQ=255) aTGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTATAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCTCTTCACCTTCTCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCGGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGTTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGTTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGAAAAGCCGGTCATTGTCGTAt < 2:326547/249‑1 (MQ=255) gcgAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGAAAAGCCGGTCATTGTCGTATGAAGTCTgcg > 2:1255836/1‑249 (MQ=255) gAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTggaggattacaagaacatgaccaacatccgcgtagctatcgtgggctacggaaacctgggacgcagcgtcgaaaagcttattgccaagcagcccgacatggaccttgtaggaatcttctcgcgccgggccaccctcgacacaaagacgccagtctttgatgtcgccgacgtggacaagcacgccgacgacgtggacgtgctgttcctgt > 2:505377‑M1/1‑40 (MQ=255) aaaCGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGAAAAGCCGGTCATTGTCGTATGAAGTCTGCGCAc > 2:880579/1‑249 (MQ=255) cGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGAAAAGCCGGTCATTGTCGTATGAAGTCTGCGCACgnn > 1:1167657/1‑247 (MQ=255) cgacATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGAAAAGCCGGTCATTGTCGTATGAAGTCTGCGCACGAGAAGTTGa < 1:342349/249‑1 (MQ=255) gacATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTggaggattacaagaacatgaccaacatccgcgtagctatcgtgggctacggaaacctgggacgcagcgtcgaaaagcttattgccaagcagcccgacatggaccttgtaggaatcttctcgcgccgggccaccctcgacacaaagacgccagtctttgatgtcgccgacgtggacaagcacgccgacgacgtggacgtgctgttcctgtgcatgggctccg < 1:1319734‑M1/249‑222 (MQ=255) acATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGAAAAGCCGGTCATTGTCGTATGAAGTCTGCGCACGAGAAGTTGAGc < 1:450581/249‑1 (MQ=255) cATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGAAAAGCCGGTCATTGTCGTATGAAGTCTGCGCACGAGAAGTTGAGCg < 2:419900/249‑1 (MQ=255) aTCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGAAAAGCCGGTCATTGTCGTATGAAGTCTGCGCACGAGAAGTTGAGCgg < 1:1068147/249‑1 (MQ=255) tCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGAAAAGCCGGTCATTGTCGTATGAAGTCTGCGCACGAGAAGTTGAGCGga < 1:370797/249‑1 (MQ=255) ctctCACTAGAGGCATAACGCTggaggattacaagaacatgaccaacatccgcgtagctatcgtgggctacggaaacctgggacgcagcgtcgaaaagcttattgccaagcagcccgacatggaccttgtaggaatcttctcgcgccgggccaccctcgacacaaagacgccagtctttgatgtcgccgacgtggacaagcacgccgacgacgtggacgtgctgttcctgtgcatgggctccgccaccg > 1:354501‑M1/1‑22 (MQ=255) ctctCACTAGAGGCATAACGCTggaggattacaagaacatgaccaacatccgcgtagctatcgtgggctacggaaacctgggacgcagcgtcgaaaagcttattgccaagcagcccgacatggaccttgtaggaatcttctcgcgccgggccaccctcgacacaaagacgccagtctttgatgtcgccgacgtggacaagcacgccgacgacgtggacgtgctgttcctgtgcatgggctccgccaccg > 2:109702‑M1/1‑22 (MQ=255) nncACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGAAAAGCCGGTCATTGTCGTATGAAGTCTGCGCACGAGAAGTTGAGCGgaagaa < 2:523312/247‑1 (MQ=255) cACTAGAGGCATAACGCTggaggattacaagaacatgaccaacatccgcgtagctatcgtgggctacggaaacctgggacgcagcgtcgaaaagcttattgccaagcagcccgacatggaccttgtaggaatcttctcgcgccgggccaccctcgacacaaagacgccagtctttgatgtcgccgacgtggacaagcacgccgacgacgtggacgtgctgttcctgtgcatgggctccgccaccgacat < 1:1011509‑M1/249‑232 (MQ=255) cACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTACTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTGAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCATGTATGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGAAAAGCCGGTCATTGTCGTATGAAGTCTGCGCACGAGAAGTTGAGCGGAAGAAGt > 2:537357/1‑249 (MQ=255) agGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGAAAAGCCGGTCATTGTCGTATGAAGTCTGCGCACGAGAAGTTGAGCGGAAGAAGTCGgtgt < 2:314250/249‑1 (MQ=255) gCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGAAAAGCCGGTCATTGTCGTATGAAGTCTGCGCACGAGAAGTTGAGCGGAAGAAGTCGGTGTTa < 1:245570/249‑1 (MQ=255) cATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGAAAAGCCGGTCATTGTCGTATGAAGTCTGCGCACGAGAAGTTGAGCGGAAGAAGTCGGTGTTaa < 1:514987/249‑1 (MQ=255) aCGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGAAAAGCCGGTCATTGTCGTATGAAGTCTGCGCACGAGAAGTTGAGCGGAAGAAGTCGGTGTTaagaag < 1:853457/249‑1 (MQ=255) tggaggattacaagaacatgaccaacatccgcgtagctatcgtgggctacggaaacctgggccgcagcgtcgaaaagcttattgccaagcagcccgccatggaccttgtaggaatcttctcgcgccgggccaccctcgacacaaagacgccagtctttgatgtcgccgacgtggacaagcacgccgaagacgtggacgtgctgttcctgtgcatgcgctccgccaccgacatccctggtcgggcaccaa > 2:134383‑M1/1‑1 (MQ=255) tggaggattacaagaacatgaccaacatccgcgtagctatcgtgggctacggaaacctgggacgcagcgtcgaaaagcttattgccaagcagcccgacatggaccttgtaggaatcttctcgcgccgggccaccctcgacacaaagacgccagtctttgatgtcgccgacgtggacaagcacgccgacgacgtggacgtgctgttcctgtgcatgggctccgccaccgacatccctgagcaggcaccaa < 2:16823‑M1/249‑249 (MQ=255) | AAGCACCCGCATCGTGGGCTCCCACTGCGAATCCGGCGATATCCTGATCAACGATGAAATCTACCCATCTGACATCACCAGCGGCGACTTCCTTGCACTCGCAGCCACCGGCGCATACTGCTACGCCATGAGCTCCCGCTACAACGCCTTCACACGGCCCGCCGTCGTGTCCGTCCGCGCTGGCAGCTCCCGCCTCATGCTGCGCCGCGAAACGCTCGACGACATCCTCTCACTAGAGGCATAACGCTTTTCGACGCCTGACCCCGCCCTTCACCTTCGCCGTGGAGGGCGGTTTTGGGTTTCTGGGTTTCTTTGCGAACTTAAGGTGTCTAGGGGTCTGCAGTCGAGGCTTCAGAGGTTTTATTGCTCGACTTCACGTGTGCTGACTTCGCGTGCTCAACTTCTCATGAGGCGACATCAGTCGAAAAGCCGGTCATTGTCGTATGAAGTCTGCGCACGAGAAGTTGAGCGGAAGAAGTCGGTGTTAAGAAGTCGA > CP025533/1242755‑1243250 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |