New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP025533 | = 1777474 | 121 (0.910) | 4 (0.040) | 4/342 | 18.4 | 4.4% | intergenic (‑3/+31) | CYL77_08470/CYL77_08475 | tRNA‑Gly/tRNA‑Val |
? | CP025533 | 1777992 = | 92 (1.000) | intergenic (‑4/‑344) | CYL77_08495/CYL77_08500 | tRNA‑Gly/tRNA‑Val | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
ATTCACAACTGCCCCACCGGCCCCAAAAGTGAGGGCCCCTAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAA > CP025533/1777226‑1777721 | aTTCACAACTGCCCCACCGGCCCCAAAAGTGAGGGCCCCTAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATg > 2:156027/1‑249 (MQ=255) aTTCAAACCTGCCCCACAGGCGCCAGAGGTCAGGGCCCCTGATATCGCGCCCAGCAGCGTGAATGACCTCCAGCAATATAACCACCCTGCTTGGGCATGCCGACCGCTTAATAAACACTTTGGGAAGCACGCAAGACAACCAATGAGCGTTAACTCATAGGTAAATAAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATg < 2:951981/249‑1 (MQ=16) tCACAACTGCCCCACCGGCCCCAAAAGTGAGGGCCCCTAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGaa < 1:389894/249‑1 (MQ=255) tCACAACTGCCCCACCGGCCCCAAAAGTGAGGGCCCCTAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGaa < 1:485260/249‑1 (MQ=255) ccccACCGGCCCCAAAAGTGAGGGCCCCTAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTa < 2:133184/249‑1 (MQ=255) acACCGGCCCCAAAAGTGAGGGCACCTAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTaan > 2:1301797/2‑248 (MQ=255) cACCGGCCCCAAAAGTGAGGGCCCCTAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAag < 2:1285331/249‑1 (MQ=255) aCCGGCCCCAAAAGTGAGGGCCCCTAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAaga < 1:453984/249‑1 (MQ=255) cGGCCCCAAAAGTGAGGGCCCCTAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAgg > 2:512920/1‑249 (MQ=255) cccAAAAGTGAGGGCCCCTAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGgttgt > 1:1117850/1‑249 (MQ=255) cccAAAAGTGAGGGCCCCTAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGgttgt > 1:680148/1‑249 (MQ=255) aaGTGAGGGCCCCTAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTc > 1:116571/1‑249 (MQ=255) aaGTGAGGGCCCCTAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTc > 2:624999/1‑249 (MQ=255) gAGGGCCCCTAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCctct < 2:727658/249‑1 (MQ=255) ngCCCCTAAAATCGCCCCCATCCCCCTGAATGACCACCATCCATATATCGACCCATCATGAGTACTTCGACCCCTTAAAACCCTTTTTGGCAAGCAAGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTCTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTgg < 2:344005/248‑1 (MQ=25) ccccTAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTg > 1:1030674/1‑249 (MQ=255) ccTAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTgcg > 1:761417/1‑249 (MQ=255) ccTAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTgcg > 2:1139143/1‑249 (MQ=255) tAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGcgcg > 1:380075/1‑249 (MQ=255) naaaaTCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGcgcg < 2:691424/248‑1 (MQ=255) aTCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATAc > 1:1317553/1‑249 (MQ=255) cgcgCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTg < 1:179735/249‑1 (MQ=255) cgcCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTggg > 1:192470/1‑249 (MQ=255) cgcCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACAAACTGCGCTACATCTGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTggg > 2:250059/1‑249 (MQ=255) gcCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGa > 1:41367/1‑249 (MQ=255) cccAGCCGCTTGAATGACCTCCATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTGCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCTCGATACTGGGAt < 2:359175/249‑1 (MQ=255) cccAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGAt < 1:1231028/249‑1 (MQ=255) ccgccTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAAc > 1:525664/1‑249 (MQ=255) ccgccTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAAc > 1:841911/1‑249 (MQ=255) cccgAATGACATAAATCCATAGAACGACCCATCTTGGGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATTGGCGTTAACCCCTAGGTGTATTAAATAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAg < 2:896715/246‑1 (MQ=21) cTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGt > 1:288171/1‑249 (MQ=255) 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cAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCg > 1:826470/1‑249 (MQ=255) ccATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTc > 1:556678/1‑249 (MQ=255) cATCTATCCACCGATCTTGATCACTCCGACCCTTTCAAACACTTTTTGCGAAGCACGCAAAAACAACTATGAGCGTTAACCAAGTGGTGTTTTAAATAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCa < 2:1196692/249‑1 (MQ=17) 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tAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCCAg < 1:88661/249‑1 (MQ=255) acaaCACCTTTTGGGAAGCACGCAAAAACTCCTATTAGCGTTAACCCAGAGGTGTTTTAAATAGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACgcgcggga < 2:851050/247‑5 (MQ=255) acTTTTTGGGCAGCACGCAAATACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACTTCCTCATGAACATTGATTAAAGTGGTTGTTCGTTCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGTGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGc < 2:186489/249‑1 (MQ=255) 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ATTCACAACTGCCCCACCGGCCCCAAAAGTGAGGGCCCCTAAAATCGCGCCCAGCCGCCTGAATGACCTCAATCCATATATCGACCCATCTTGAGCACTTCGACCCCTTAAAACACTTTTTGGGAAGCACGCAAAAACACCTATGAGCGTTAACCCATAGGTGTTTTAAATTGAGCGGATGACGAGACTCGAACTCGCGACCCTCACCTTGGCAAGGTGATGCGCTACCAACTGCGCTACATCCGCATGAACATTGATTAAAGAGGTTGTTCGTCCTCTTGGTGCGCGATACTGGGATTGAACCAGTGACCTCTTCCGTGTCAGGGAAGCGCTCTCCCGCTGAGCTAAACGCGCCAGAACTGCGAGGTGGAAACGGGAATCGAACCCGTGTGCACGGTTTTGCAGACCGTTGCCTCACCACTCGGCCATTCCACCATGGCATAAATTTGCCTTTAGGTACGTGGTAAACATACCAGAGCGGATGACGAGACTCGAA > CP025533/1777226‑1777721 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |