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Missing coverage evidence... | ||||||||||
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New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
CAATAGGCTCCGCAGCTGGCTCCGGCTCCACATCTGGAACTGGAGTTTCCTCCAGCGCAGCTTCCGCAGATTCCACAGCAACCTGAGCAGCCTCTGCAGCCTCGGTGACCTCAGCAACTGCCGCAAGTTCTTCAACTGCAGGTTCTTCGATTGTTTCGGGAACTTCCGCTACTGCAGGTTCCTCAACAACTGCAGGTTCCTCTGCTACTGCAGGTTCCTCAACAATTGCTGGTTCCTCTGCTACTGCAGGTTCCTCTGCTACTGCAGGTTCCTCTGCTACTGCAGGTTCCTCAACAATTGCTGGTTCCTCTGCTACTGCAGGTTCTTCAACAACTGCTGGCTCTTCAGTTTCGACCTCTGGCTCAACAGCGACAACTTCTTTAACCTCAGGCTCCTTAACTTCTGGTTCCTCGACAACATCATCAGAGGTTTCTGGTTCAGGAGTTGCAGGTGCTTCTTCAGCAGGCTTTTGAGCTGCGAAAGTTTCAGTCGATTG > CP025533/2180461‑2180956 | ccgccggcacgatctcatcaataggctccgcagctggctccggctccacatctggaactggagtttcctccagcgcagcttccgcagattccacagcaacctgagcagcctctgcagcctcggtgacctcagcaactgccgcaagttcttcaactgcaggttcttcgattgtttcgggaacttccgctactgcaggttcctcaacaactgcaggttcctctgctactgcaggttcctcaacaattgctg < 2:78931‑M1/1‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |