| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | = 497710 | 122 (0.920) | 8 (0.090) | 8/346 | 15.2 | 8.5% | intergenic (+2/‑251) | CYL77_02460/CYL77_02465 | tRNA‑Thr/tRNA‑Thr |
| ? | CP025533 | 498036 = | 88 (0.950) | intergenic (+3/‑36) | CYL77_02465/CYL77_02470 | tRNA‑Thr/tRNA‑Met | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
TGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGAAACCGCTTCTAACTGCAAATTTTTTGAGGTTAGAAGCGGTGTTTTCGCAAATTGACAGGCTGATGGTAACATTGCCTGTGCTCCATAGGGGCGTAGCTCAATTGGCAGAGCAACGGTCTCCAAAACCGTA > CP025533/497793‑498283 | gAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCtt < 1:350664/249‑1 (MQ=255) aGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCttt > 2:1217333/1‑249 (MQ=255) gTTTTTAGTGTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGTGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTACCTTCCTGCACATTCGTGTTCCGCTAGACGTTCTGGTGAACTTCATTAAAATCTAAACGGAGCGCAGAGGTAGTAATGCGGAGTTGATTTTAAAGAACTAGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCtttt < 2:720656/249‑1 (MQ=21) ttttAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTAt > 1:935816/1‑249 (MQ=255) tAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATtct > 2:921950/1‑249 (MQ=255) tgtCAGGCCACATGCATCGTAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGt < 1:122552/247‑1 (MQ=255) cATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTCTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGc < 1:1188915/249‑1 (MQ=255) gCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAAtg > 1:678783/1‑249 (MQ=255) gCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAAtg < 1:851489/249‑1 (MQ=255) tAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGc > 2:974908/1‑249 (MQ=255) tGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCCGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGACAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTa < 1:570793/249‑1 (MQ=255) gCAATTTAATCCAAGAATAGCGTGAGCGTACTTCAGATCTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGAGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAg < 1:1072088/249‑1 (MQ=38) aaTTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCt > 2:296114/1‑249 (MQ=255) aaTTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCt > 2:694591/1‑249 (MQ=255) aTCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTgg > 2:792977/1‑249 (MQ=255) aTCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTgg < 1:22566/249‑1 (MQ=255) tCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGt > 1:727066/1‑249 (MQ=255) ccAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGtn > 1:224398/1‑248 (MQ=255) aGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTagag > 1:1185911/1‑249 (MQ=255) gAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGc > 1:216413/1‑249 (MQ=255) aaaaCCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGTCTTTCACGGAGCGCAGCGGTACCTATCCGGACTTCATTTTAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCa < 2:575148/249‑1 (MQ=255) aaaaCCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGGGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCa > 2:1172815/1‑249 (MQ=255) aCCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCCACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGc < 1:5460/249‑1 (MQ=255) tAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTc > 2:159915/1‑249 (MQ=255) cTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGTGCGCAGCGGTAGTTAGACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGATCAAGCGACTCATa > 2:548542/1‑249 (MQ=255) ttCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATaa > 2:855591/1‑249 (MQ=255) ttCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATaa > 2:733310/1‑249 (MQ=255) tCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCTACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAAt > 2:1087657/1‑249 (MQ=255) cAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCtg > 2:183201/1‑249 (MQ=255) cAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCtg > 2:473619/1‑249 (MQ=255) aTTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTgtgt > 1:1180600/1‑249 (MQ=255) ttGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTcg > 1:84816/1‑249 (MQ=255) ttGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTcg > 2:1045110/1‑249 (MQ=255) tgtgTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTcgc > 2:253896/1‑249 (MQ=255) 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aaGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTAcc > 1:260939/1‑249 (MQ=255) aGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACcg > 1:1083225/1‑249 (MQ=255) ttAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAAAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGAt > 1:908973/1‑249 (MQ=255) 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aGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGAAACCGCTTCTAACTGCAAAttttt > 2:623898/1‑249 (MQ=255) gcgatgcGGAGTGCATTTCCAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGAAACCGCTTCTAACTGCAAAtttttt < 2:251067/243‑1 (MQ=255) gTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGAAACCGCTTCTAACTGCAAAtttttt < 1:902349/249‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |