New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | CP025533 | = 2632710 | NA (NA) | intergenic (‑129/‑113) | CYL77_12475/CYL77_12480 | ISL3 family transposase/hypothetical protein |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
TCGAGTGCGTCTGCTTCGATCAGGGTGTAATCACCTGCATCGGAAGCGCCGGTGATGGTGAGTCCTAGTTCCGCAGTGCGGCAGATGGTGTCAGCGATGATGTTGCCGGTAGACTTCATGGGTAGAGCCTTTTGTTGGTGTTTGGTTAGCTTAGATACCTAAACCTTAACCCTGACAAAAGGCTCGTTTATTTTCGGGTCTACACCGCTAGCCCAGGTTCTGTGATGTACCCCAAAACCGGAAGGGCCTCTTAAGTGGCTCAAGGAAGACAAGCATCCAACAAGAACGAACCCTGCATCCCATTCCTAAAATAGTGGATGGTGTCTATATTTTTAGGTCGGGATCAGAACAGCCGCGCTTATGAAATCAGATGAGGCATGGATCGCTGGGTATAAGGCGGCGGCGCCGTTTCTATTGATTGCAGCAATCGGGATTGTTGCGTCTGGGGTGGCCTCAATTTTTGTGCCGTTTGATGCGGTCGCAACTGTATCAATG > CP025533/2632463‑2632957 | tCGAGTGCGTCTGCTTCGATCAGGGTGTAATCACCTGCATCGGAAGCGCCGGTGATGGTGAGTCCTAGTTCCGCAGTGCGGCAGATGGTGTCAGCGATGATGTTGCCGGTAGACTTCATGGGTAGAGCCTTTTGTTGGTGTTTGGTTAGCTTAGATACCTAAACCTTAACCCTGACAAAAGGCTCGTTTATTTTCGGGTCTACACCGCTAGCCCAGGTTCTGTGATGTACCCCAAAACCGGAAGGGCct > 2:159287/1‑249 (MQ=11) 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TCGAGTGCGTCTGCTTCGATCAGGGTGTAATCACCTGCATCGGAAGCGCCGGTGATGGTGAGTCCTAGTTCCGCAGTGCGGCAGATGGTGTCAGCGATGATGTTGCCGGTAGACTTCATGGGTAGAGCCTTTTGTTGGTGTTTGGTTAGCTTAGATACCTAAACCTTAACCCTGACAAAAGGCTCGTTTATTTTCGGGTCTACACCGCTAGCCCAGGTTCTGTGATGTACCCCAAAACCGGAAGGGCCTCTTAAGTGGCTCAAGGAAGACAAGCATCCAACAAGAACGAACCCTGCATCCCATTCCTAAAATAGTGGATGGTGTCTATATTTTTAGGTCGGGATCAGAACAGCCGCGCTTATGAAATCAGATGAGGCATGGATCGCTGGGTATAAGGCGGCGGCGCCGTTTCTATTGATTGCAGCAATCGGGATTGTTGCGTCTGGGGTGGCCTCAATTTTTGTGCCGTTTGATGCGGTCGCAACTGTATCAATG > CP025533/2632463‑2632957 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |