| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | CP025533 | 2,042,148 | 725 bp→TGTTTAAGTTTAGTGGATGG | coding (19‑743/780 nt) | CYL77_09745 → | DeoR/GlpR transcriptional regulator |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | CP025533 | 2042148 | 2042872 | 725 | 152 [0] | [0] 146 | CYL77_09745 | DeoR/GlpR transcriptional regulator |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | = 2042147 | 0 (0.000) | 137 (1.120) +TGTTTAAGTTTAGTGGATGG |
110/456 | 0.0 | 100% | coding (18/780 nt) | CYL77_09745 | DeoR/GlpR transcriptional regulator |
| ? | CP025533 | 2042873 = | 0 (0.000) | coding (744/780 nt) | CYL77_09745 | DeoR/GlpR transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
TCGCGCTGATGCGTGCGGATGTAGTGTTCATCGGCACCAACGCGTTGACGTTGGATCACGGATTGTCTACGGCCGATTCCCAAGAGGCTGCCATGAAATCTGCGATGATCACCAACGCCCACAAGGTGGTGGTGTTGTGTGACTCCACCAAGATGGGCACCGACTACCTCGTGAGCTTTGGCGCAATCAGCGATATCGATGTGGTGGTCACCGATGCGGGTGCACCAGCAAGTTTCGTTGAGCAGTTGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAATCTCTCATTACATGCGCCTGGTGACGTTT > CP025533/2042626‑2043121 | tttttgctgatctagaaagtgagtttacctgtgggttttcgaaaattctgggccggacaatagaaaaacgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggGc < 2:684426‑M2/2‑1 (MQ=255) ttttgctgatctagaaagtgagtttacctgtgggttttcgaaaattctgggccggacaatagaaaaacgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggGCg < 2:407945‑M2/3‑1 (MQ=255) ttttgctgatctagaaagtgagtttacctgtgggttttcgaaaattctgggccggacaatagaaaaacgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggGCg < 2:718068‑M2/3‑1 (MQ=255) ctgatctagaaagtgagtttacctgtgggttttcgaaaattctgggccggacaatagaaaaacgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggGCGAGAAc < 1:857360‑M2/8‑1 (MQ=255) 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agaaaaacgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTAt < 2:521157‑M2/63‑1 (MQ=255) agaaaaacgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTAt < 1:1059185‑M2/63‑1 (MQ=255) acgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTg > 2:561755‑M2/181‑249 (MQ=255) 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TCGCGCTGATGCGTGCGGATGTAGTGTTCATCGGCACCAACGCGTTGACGTTGGATCACGGATTGTCTACGGCCGATTCCCAAGAGGCTGCCATGAAATCTGCGATGATCACCAACGCCCACAAGGTGGTGGTGTTGTGTGACTCCACCAAGATGGGCACCGACTACCTCGTGAGCTTTGGCGCAATCAGCGATATCGATGTGGTGGTCACCGATGCGGGTGCACCAGCAAGTTTCGTTGAGCAGTTGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAATCTCTCATTACATGCGCCTGGTGACGTTT > CP025533/2042626‑2043121 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |