| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | CP025533 | 2,200,552 | 1289 bp→CCATCCACTAAACTTAAACA | coding (19‑1307/1344 nt) | CYL77_10460 ← | glutamate dehydrogenase |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP025533 | 2201841 = | 0 (0.000) | coding (18/1344 nt) | CYL77_10460 | glutamate dehydrogenase | |||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
CCAAGTGCAGAGTTGAACTGCACGCGGAAACCACGGTTGACGTGGACCTGGCCCTGGTCATCAACCCAAGGCACACGGAAGATGAGCTGACGCTCAGGCTCGCACAGGCGCTGGATGAGACCGTAATCAGCGTAATGAGGGTCCTTTTCCAGGACGATCTTCAAAGATTCCAAAACCTCTGCCACTGCCTGGTGAAATTCAGGCTCGCCAGCATTGCGCTTCAGAAGCATGTCGTAATAGTTAGAGACCTGCTCATCAACTGTCATGATTTCCTCGTTCCCATCTCGGCTGCATGCGCGCACGATTTTAAAGTGTGTACCTGGGCCATTTAGTGATGTTGGTGGTTCCCATTGAGGGCACCATGTACATCCTAGGCGTTTGCTGGAGCAAAATGCCTGTGAAAAATCTGATCCTGAAACTTTTAAAAACTGCGTTCACATCAACCGGCTTGTCATACCTAACGGTTAATAGTTTTAAACTACGGATGCCCTAAAGAG > CP025533/2201593‑2202089 | accagccaccaagatgcgctcaatcaagcggatctttcccagactctggccacgcttaaagacaccacggtgatcatcattgcgcaccgcacagctgcattaacccatgtggatcggataattgacctggaagaaatcaaagatccctgatccttaacgcggatcaggggtttaagtaaagcgcaggggtcttagatgacgccctgtgccagcatcgcgtcagctaccccatccactaaacttaaacac > 1:1126161‑M2/249‑249 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |