| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 293 total aligned reads displayed.
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tAGCGAAGCTTGATTCAGCAAATAGAGCGTCAAACACTGGTGCGGTGATCAGATGCTGTGACAACATGCTGATTGCCTCGTCGTCAGAGATGGACTCATTGAGGTTGCCACGTAGACCTTCAACAAATCGCTCGAACTCTTCTTTGATCGTTGGTGAAGCATTGTCTAAGAGCGCTTTAATACGGGTTATTTGTGCTTGGGCGATGTCAGCAACATCATCTGCCCAATCTTCCCAGTAGGTTCGGGTAc < 2:413743/249‑1 (MQ=255) cctcgatccaccgatgtgccctcggtgatgtcctgatcccggttccgggcgggtccggaattttcgggtaggggtgatcgccagatcacgtcttgttctggttgttccacgaattgttgtcatctcacgccgaaagctcggctgggtggtcagggagctaccggttacggtggtgaatggccgtgatcaaacagtttctgccactgtggttgccacgtccacccctcgggaaggtggagcaccagtcgg > 2:1273165‑M2/1‑1 (MQ=255) cctcgatccaccgatgtgccctcggtgatgtcctgatcccggttccgggcgggtccggaattttcgggtaggggtgatcgccagatcacgtcttgttctggttgttccacgaattgttgtcatctcacgccgaaagctcggctgggtggtcagggagctaccggttacggtggtgaatggccgtgatcaaacagtttctgccactgtggttgccacgtccacccctcgggaaggtggagcaccagtcgg < 2:97815‑M2/249‑249 (MQ=255) | GTCCACGATCTCAACAGGGGTATAGACAATACCTAGAGCTTCAGATTGCTTTTTAAAGGCCTTTTTAAAGAATCGTTCGTAGAGGTCTTTAATTACTGCTTGTTTACCAGCTGCGGAGCTTACTTCAGCAGCACGGATACGAACAGAGTCATAGAACTTCTCAAGTTTTTCCGTTTCAGAGTTAAGTTCAGCACTATTAAGAGCATCTGCCATGCGTTGCATAACCTGGGAAACAGGGTTTTGCTTAGCGAAGCTTGATTCAGCAAATAGAGCGTCAAACACTGGTGCGGTGATCAGATGCTGTGACAACATGCTGATTGCCTCGTCGTCAGAGATGGACTCATTGAGGTTGCCACGTAGACCTTCAACAAATCGCTCGAACTCTTCTTTGATCGTTGGTGAAGCATTGTCTAAGAGCGCTTTAATACGGGTTATTTGTGCTTGGGCGATGTCAGCAACATCATCTGCCCAATCTTCCCAGTAGGTTCGGGTACCAA > CP025533/3286190‑3286686 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |