Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	AY305378	415628	415796	169	2 [1]	[0] 2	[nagM3]–[PHG397]	[nagM3],[PHG397]

CGTCGCGCTTGAGCACCAGCACGTCGGTCGTGCCGTCCTGGATCACGCCACCGGTCTGGTCGATTAACTGCAGTCGCCGGTTCACGCGCCCTACGCGCTTGCTGGTGCCGGCCTCTGTTT  >  AY305378/415797‑415916 |                                                                                                                        cGTCGCGCTTGAGCACCAGCACGTCGGTCGTGCCGTCCTGGATCACGCCACCGGTCTGGTCGATTAACTGCAGTCGCCGGTTCACGCGCCCTACGCGCTTGCTGGTGCCGGCCTCTGttt  <  1:907171/120‑1 (MQ=255) cGTCGCGCTTGAGCACCAGCACGTCGGTCGTGCCGTCCTGGATCACGCCACCGGTCTGGTCGATTAACTGCAGTCGCCGGTTCACGCGCCCTACGCGCTTGCTGGTGCCGGCCTCTGttt  >  2:907171/1‑120 (MQ=255) |                                                                                                                        CGTCGCGCTTGAGCACCAGCACGTCGGTCGTGCCGTCCTGGATCACGCCACCGGTCTGGTCGATTAACTGCAGTCGCCGGTTCACGCGCCCTACGCGCTTGCTGGTGCCGGCCTCTGTTT  >  AY305378/415797‑415916

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑