| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AM260479 | 735,524 | +G | intergenic (‑409/+175) | h16_A0685 ← / ← h16_A0686 | hypothetical membrane spanning protein/Predictedpermease/CBS‑domain‑containing membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AM260479 | 735,521 | 1 | . | G | 100.0% | 80.7 / NA | 24 | intergenic (‑406/+178) | h16_A0685/h16_A0686 | hypothetical membrane spanning protein/Predictedpermease/CBS‑domain‑containing membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (10/14); total (10/14) | |||||||||||
GAGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑GGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGCATCGT > AM260479/735388‑735637 | gAGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCa < 1:928215/134‑1 (MQ=255)gAGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCa < 1:878019/134‑1 (MQ=255) gCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑gg < 2:874615/134‑1 (MQ=255) aaaaaGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑ggggcag < 2:146608/134‑5 (MQ=255) gTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCt < 1:27827/134‑1 (MQ=255) cAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGtt < 1:227467/134‑1 (MQ=255) cAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGtt < 1:880787/134‑1 (MQ=255) cAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGATTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGtt < 1:742093/134‑1 (MQ=255) aaaaaaCGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGtt > 1:1009994/1‑133 (MQ=255) gcgTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑ggggcag > 2:468529/1‑112 (MQ=255) gcgTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑ggggcag < 1:468529/116‑5 (MQ=255) gCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGa < 1:318920/134‑1 (MQ=255) gccggcAATCAATTCCAGGGTGTTGTTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATcccc < 2:613798/134‑1 (MQ=255) ccggcAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCa < 1:663124/134‑1 (MQ=255) gtggtTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCctgctg < 2:1009994/133‑1 (MQ=255) gCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGc < 1:688355/77‑1 (MQ=255) gCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGc > 2:688355/1‑77 (MQ=255) aCGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCAt > 2:138761/1‑134 (MQ=255) gCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGtt < 2:980307/70‑1 (MQ=255) gCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGtt > 1:980307/1‑70 (MQ=255) ccGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGcc > 1:158752/1‑133 (MQ=255) ccGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTAGGCCATGTGGGTCa > 1:585068/1‑43 (MQ=11) ccGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCa < 2:585068/43‑1 (MQ=35) ccGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGgc > 1:229760/1‑134 (MQ=255) aCCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTg > 2:157509/1‑134 (MQ=255) ccTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATcgc > 2:436955/1‑97 (MQ=255) ccTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATcgc < 1:436955/97‑1 (MQ=255) gCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGtt > 1:520154/1‑35 (MQ=11) gCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGtt < 2:520154/35‑1 (MQ=11) cTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGCAtcgt < 1:157509/134‑1 (MQ=255) gtgAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTAtt > 1:513628/1‑36 (MQ=11) gtgAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTAtt < 2:513628/36‑1 (MQ=11) | GAGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑GGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGCATCGT > AM260479/735388‑735637 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |