New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AM260479 | 1803401 = | 34 (1.270) | 6 (0.240) | 5/192 | 1.7 | 14.9% | coding (635/912 nt) | h16_A1656 | Ap4A phosphorylase II |
? | AM260479 | 1803438 = | 37 (1.500) | coding (672/912 nt) | h16_A1656 | Ap4A phosphorylase II | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CGGCCTGGCATTTGCGCATGCGTTCGCGCCGCTGGATCTGTCCGCGGCGCCGGTGGAAGAGATGGCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATGCCCGCGGGGCTGCTGCTGGTGCCGAGATCCATGGAGTGCGTGGAAGGCATCGCAGTCAA > AM260479/1803315‑1803548 | cGGCCTGGCATTTGCGCATGCGTTCGCGCCGCTGGATCTGTCCGCGGCGCCGGTGGAAGAGATGGCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAgg > 2:296521/1‑134 (MQ=255) ggCCTGGCATTTGCGCATGCGTTCGCGCCGCTGGATCTGTCCGCGGCGCCGGTGGAAGAGATGGCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAggg < 1:768020/134‑1 (MQ=255) catggatctcggcaccagcagcagccccgcgggcatgaccagcaggttgtacggcgctgacgggtgcaggccgccctcgacatcgaccgcgcgcacgccaaccgcatccagcaacgcgcggtCGATGTCGAggg > 1:499504‑M2/123‑134 (MQ=255) tGGCATTTGCGCATGCGTTCGCGCCGCTGGATCTGTCCGCGGCGCCGGTGGAAGAGATGGCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGggcggc > 2:647296/1‑134 (MQ=255) tttGCGCATGCGTTCGCGCCGCTGGATCTGTCCGCGGCGCCGGTGGAAGAGATGGCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGcc > 2:35294/1‑130 (MQ=255) tttGCGCATGCGTTCGCGCCGCTGGATCTGTCCGCGGCGCCGGTGGAAGAGATGGCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGcc < 1:35294/130‑1 (MQ=255) ggcaccagcagcagccccgcgggcatgaccagcaggttgtacggcgctgacgggtgcaggccgccctcgacatcgaccgcgcgcacgccaaccgcatccagcaacgcgcggtCGATGTCGAGGGCGGCCTGCAc < 2:499504‑M2/22‑1 (MQ=255) cgcATGCGTTCGCGCCGCTGGATCTGTCCGCGGCGCCGGTGGAAGAGATGGCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCg < 1:606853/134‑1 (MQ=255) aTGCGTTCGCGCCGCTGGATCTGTCCGCGGCGCCGGTGGAAGAGATGGCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGt > 1:988346/1‑132 (MQ=255) ttCGCGCCGCTGGATCTGTCCGCGGCGCCGGTGGAAGAGATGGCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTc > 2:498970/1‑128 (MQ=255) ttCGCGCCGCTGGATCTGTCCGCGGCGCCGGTGGAAGAGATGGCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTc < 1:498970/128‑1 (MQ=255) cgccgcTGGATCTGTCCGCGGCGCCGGTGGAAGAGATGGCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTa > 2:1059071/1‑133 (MQ=255) tCCGCGGCGCCGGTGGAAGAGATGGCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTgg < 1:1059071/130‑1 (MQ=255) gcggcgCCGGTGGAAGAGATGGCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGAACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATGcc > 1:1040013/1‑134 (MQ=255) ggAAGAGATGGCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCg < 2:861392/94‑1 (MQ=255) ggAAGAGATGGCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCg > 1:861392/1‑94 (MQ=255) ggAAGAGATGGCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATGCCCGCGGGgctgc > 2:160043/1‑134 (MQ=255) tGGCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATGCCCGCGGGGCTGCTGCTGGTg < 1:296521/134‑1 (MQ=255) gtgcaggccgccctcgacatcgACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATGCCCGCGGGGCTGCTGCTGGTGcc < 2:499504‑M1/112‑1 (MQ=255) gCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCg < 2:1016116/67‑1 (MQ=255) gCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCg > 1:1016116/1‑67 (MQ=255) gCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCg > 1:846455/1‑84 (MQ=255) gCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCg < 2:846455/84‑1 (MQ=255) tGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAggg < 1:1165777/68‑1 (MQ=255) tGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAggg > 2:1165777/1‑68 (MQ=255) tGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGcc < 1:589188/73‑1 (MQ=255) tGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGcc > 2:589188/1‑73 (MQ=255) tGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATGCCCGCGGGgctgctgct > 1:628499/1‑125 (MQ=255) tGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATGCCCGCGGGgctgctgct < 2:628499/125‑1 (MQ=255) cGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATGCCCGCGGGGCTGCTGCTGGTGCCGAGATc > 1:43191/1‑133 (MQ=255) ggCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATGCCCGCGGGGCTGCTGCTGGTGCCGAGATCCa < 2:1040013/134‑1 (MQ=255) ccctcgacatcgACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATGCCCGCGGGGCTGCTGCTGGTGCCGAGATCCATg > 1:499504‑M1/13‑134 (MQ=255) cGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATGCCCGCGGGGCTGCTGCTGGTGCCGAGATCCATGGAGt < 2:43191/134‑1 (MQ=255) cGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGAATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATGCCCGCGGGGCTGCTGCTGGTGCCGAGATCCATGGAGt > 1:668927/1‑134 (MQ=255) CGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATGCCCGCGGGGCTGCTGCTGGTGCCGAGATCCATGGAGTGCGTGGAAGGCa > 1:160043‑M1/1‑134 (MQ=255) gCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATGCCCGCGGGGCTGCTGCTGGTGCCGAGATCCATGGAGTGCGTGGAAGGCATCGCa < 2:988346/133‑1 (MQ=255) gATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATGCCCGCGGGGCTGCTGCTGGTGCCGAGATCCATGGAGTGCGTGGAAGGCATCGCAGTCaa < 2:1138400/134‑1 (MQ=255) gATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTCGTCATGCCCGCGGGGCTGCTGCTGGTGCCGAGATCCATGGAGTGCGTGGAAGGCATCGCAGTCaa > 1:1138400/1‑134 (MQ=255) aaccgcatccagcaacgcgcggtCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATg > 2:1007535‑M2/24‑75 (MQ=255) aaccgcatccagcaacgcgcggtCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATg < 1:1007535‑M2/52‑1 (MQ=255) ggCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATGCCCGCGGGGCTGCTGCTGGTg > 2:59891/1‑87 (MQ=255) ggCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATGCCCGCGGGGCTGCTGCTGGTg < 1:59891/87‑1 (MQ=255) cagcaacgcgcggtCGATGTCGAGGGCGGCCTGCAc < 1:1057637‑M2/22‑1 (MQ=255) cagcaacgcgcggtCGATGTCGAGGGCGGCCTGCAc > 2:1057637‑M2/15‑36 (MQ=255) gcgcgcGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGcc > 2:345874/1‑42 (MQ=255) gcgcgcGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGcc < 1:345874/42‑1 (MQ=255) cggtCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACaa < 2:1034216‑M2/39‑1 (MQ=255) cggtCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACaa > 1:1034216‑M2/5‑43 (MQ=255) | CGGCCTGGCATTTGCGCATGCGTTCGCGCCGCTGGATCTGTCCGCGGCGCCGGTGGAAGAGATGGCGTGCACGGCGTGCGAGCGCTACCGCGCGTTGCTGGATGCGGTTGGCGTGCGCGCGGTCGATGTCGAGGGCGGCCTGCACCCGTCAGCGCCGTACAACCTGCTGGTCATGCCCGCGGGGCTGCTGCTGGTGCCGAGATCCATGGAGTGCGTGGAAGGCATCGCAGTCAA > AM260479/1803315‑1803548 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |