| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AM260480 | 1,518,085 | C→T | A85T (GCC→ACC) | h16_B1356 ← | conserved hypothetical membrane spanning protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AM260480 | 1,518,085 | 0 | C | T | 100.0% | 89.1 / NA | 25 | A85T (GCC→ACC) | h16_B1356 | conserved hypothetical membrane spanning protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (12/13); total (12/13) | |||||||||||
GATGGCGGGGGCCGCCGCGGCGGCCATGCTGGCAAGCCCGAGCAGGGCCGCGCACAGGTAACGGTTGGCGGGTTTCATGCCCGGCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGCCCGGTACACGTAGATCCCGGTCAGCAGCACGGCCGAGACGATCACCGCCACGCCGACGGGAATGCCCACCGTCATCACACCCGCGCCGAGCGGTGTGCCGAGCGTGGCCGGCGAGAA > AM260480/1517955‑1518202 | gATGGCGGGGGCCGCCGGGGCGGCCATGCTGGCAAGCCCGAGCAGGGCCGCGCACAGGTAACGGTTGGGGGGTTTCATGCCCGGCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGtcc < 2:1086895/133‑1 (MQ=255) gCGGGGGCCGCCGCGGCGGCCATGCTGGCAAGCCCGAGCAGGGCCGCGCACAGGTAACGGTTGGCGGGTTTCATGCCCGGCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTac < 1:341997/134‑1 (MQ=255) ggCCGCCGCGGCGGCCATGCTGGCAAGCCCGAGCAGGGCCGCGCACAGGTAACGGTTGGCGGGTTTCATGCCCGGCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACg > 2:418832/1‑132 (MQ=255) ccgccgCGGCGGCCATGCTGGCAAGCCCGAGCAGGGCCGCGCACAGGTAACGGTTGGCGGGTTTCATGCCCGGCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACg > 1:681863/1‑130 (MQ=255) gcggcCATGCTGGCAAGCCCGAGCAGGGCCGCGCACAGGTAACGGTTGGCGGGTTTCATGCCCGGCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGt > 2:945009/1‑133 (MQ=255) cggcCATGCTGGCAAGCCCGAGCAGGGCCGCGCACAGGTAACGGTTGGCGGGTTTCATGCCCGGCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTca < 2:264673/134‑1 (MQ=255) cTGGCAAGCCCGAGCTGGGCCGCGCACAGGTAACGGTTGGCGGGTTTCATGCCCGGCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGCGCGGGTCCAGGTCGCGGTAGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTCAGCAGCAc < 2:72871/133‑1 (MQ=255) gCCCGAGCAGGGCCGCGCACAGGTAACGGTTGGCGGGTTTCATGCCCGGCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTCAGCAGCACGGCCgaga < 2:681863/134‑1 (MQ=255) gTTGGCGGGTTTCATGCCCGGCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTCAGCAGCACGGCCGAGACGATCACCGCCACGCCGACGGGAATGcc < 1:945009/134‑1 (MQ=255) gggTTTCATGCCCGGCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTca < 2:537981/85‑1 (MQ=255) gggTTTCATGCCCGGCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTca > 1:537981/1‑85 (MQ=255) gTTTCATGCCCGGCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTCAGCAGCACGGCCGAGACGATCACCGCCACGCCGACGGGAATGCCCACCGtca > 1:760587/1‑134 (MQ=255) gTTTCATGCCCGGCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTCAGCAGCACGGCCGAGACGATCACCGCCACGCCGACGGGAATGCCCACCGtca > 2:539832/1‑134 (MQ=255) gTTTCATGCCCGGCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTCAGCAGCACGGCCGAGACGATCACCGCCACGCCGACGGGAATGCCCACCGtca > 2:1144329/1‑134 (MQ=255) ttCATGCCCGGCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTCAGCAGCACGGCCGAGACGATCACCGCCACGCCGACGGGAATGCCCACCGtcat > 2:1026500/1‑133 (MQ=255) tGCCCGGCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTCAGCAGCACGGCCGAGACGATCACCGCCACGCCGACGGGAATGCCCACCGTCATCacac > 2:330233/1‑134 (MQ=255) ggCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTCAGCAGCACGGCCGAGACGATCACCGCCACGCCGACGGGAATGCCCACCGTCATCACACCcgcg < 1:418832/134‑1 (MQ=255) aCTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTcagc < 2:757001/71‑1 (MQ=255) aCTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTcagc > 1:757001/1‑71 (MQ=255) aCTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTCAGCAGCACGGCCGAGACGATCACCGCCACGCCGACGGGAATGCCCACCGTCATCACACCCGCGCCg < 1:539832/134‑1 (MQ=255) cACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTCAGCAGCACGGCCGAGACGATCACCGCCACGCCGACGGGAATGCCCACCGTCATCACACCCGCGCCGAGCGGTGTGc < 1:1144329/134‑1 (MQ=255) cgttGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTCAGCAGCACGGCCGAGACGATCACCGCCACGCCGa > 2:859682/1‑84 (MQ=255) cgttGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTCAGCAGCACGGCCGAGACGATCACCGCCACGCCGa < 1:859682/84‑1 (MQ=255) tCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTCAGCAGCACGGCCGAGACGATCACCGCCACGCCGACGGGAATGcc < 2:1145151/83‑1 (MQ=255) tCCAGGTCGCGGTTGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTCAGCAGCACGGCCGAGACGATCACCGCCACGCCGACGGGAATGcc > 1:1145151/1‑83 (MQ=255) tGGTCCGGTACACGTAGATCCCGGTCAGCAGCACGGCCGAGACGATCACCGCCACGCCGACGGGAATGCCCACCGTCATCACACCCGCGCCGAGCGGTGTGCCGAGCGTGGCCGGCGAGaa < 1:1029425/121‑1 (MQ=255) | GATGGCGGGGGCCGCCGCGGCGGCCATGCTGGCAAGCCCGAGCAGGGCCGCGCACAGGTAACGGTTGGCGGGTTTCATGCCCGGCACTCCTTGCGCACGCGTTCGTTGAGCGGATCCAGGTCGCGGTTGGCCCGGTACACGTAGATCCCGGTCAGCAGCACGGCCGAGACGATCACCGCCACGCCGACGGGAATGCCCACCGTCATCACACCCGCGCCGAGCGGTGTGCCGAGCGTGGCCGGCGAGAA > AM260480/1517955‑1518202 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |