| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AM260480 | 2,063,918 | G→A | P215L (CCG→CTG) | h16_B1826 ← | Acyl‑CoA dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AM260480 | 2,063,918 | 0 | G | A | 100.0% | 88.8 / NA | 24 | P215L (CCG→CTG) | h16_B1826 | Acyl‑CoA dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (13/11); total (13/11) | |||||||||||
CGCATGCAATGCGACAGCCGCGCCGGCGACAAGCGAACCTGCGCATAACGGAAGCCCTCGTCCACCTCGCCCAGCACCTGGTCCTGCGGCACGCGCAGGCCGTCGATCAGGACCTGCGCATGTCCGCCCGGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGTCGACCAGGAACATGGTGGCCTGCGCGCGCTCACCATCGCCGGTGCGCGCCATCAGGATGCCGGCGCTGG > AM260480/2063789‑2064047 | cgcATGCAATGCGACAGCCGCGCCGGCGACAAGCGAACCTGCGCATAACGGAAGCCCTCGTCCACCTCGCCCAGCACCTGGTCCTGCGGCACGCGCAGGCCGTCGATCAGGACCTGCGCATGTCCGCCCAGCAt < 1:824821/134‑1 (MQ=255) aaTGCGACAGCCGCGCCGGCGACAAGCGAACCTGCGCATAACGGAAGCCCTCGTCCACCTCGCCCAGCACCTGGTCCTGCGGCACGCGCAGGCCGTCGATCAGGACCTGCGCATGTCCGCCCAGCATGGAACTg < 1:1162905/134‑1 (MQ=255) ccTCGTCCACCTCGCCCAGCACCTGGTCCTGCGGCACGCGCAGGCCGTCGATCAGGACCTGCGCATGTCCGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCgg > 2:955506/1‑116 (MQ=255) ccTCGTCCACCTCGCCCAGCACCTGGTCCTGCGGCACGCGCAGGCCGTCGATCAGGACCTGCGCATGTCCGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCgg < 1:955506/116‑1 (MQ=255) cGTCCACCTCGCCCAGCACCTGGTCCTGCGGCACGCGCAGGCCGTCGATCAGGACCTGCGCATGTCCGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGTc > 1:877158/1‑133 (MQ=255) cACCTCGCCCAGCACCTGGTCCTGCGGCACGCGCAGGCCGTCGATCAGGACCTGCGCATGTCCGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGTCGAcc < 1:445979/133‑1 (MQ=255) gCACGCGCAGGCCGTCGATCAGGACCTGCGCATGTCCGCCCAGCATGGAACTGTCg > 1:109691/1‑56 (MQ=255) gCACGCGCAGGCCGTCGATCAGGACCTGCGCATGTCCGCCCAGCATGGAACTGTCg < 2:109691/56‑1 (MQ=255) gCACGCGCAGGCCGTCGATCAGGACCTGCGCATGTCCGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGt > 1:1030833/1‑102 (MQ=255) gCACGCGCAGGCCGTCGATCAGGACCTGCGCATGTCCGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGt < 2:1030833/102‑1 (MQ=255) aCGCGCAGGCCGTCGATCAGGACCTGCGCATGTCCGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGt > 1:1090224/1‑100 (MQ=255) aCGCGCAGGCCGTCGATCAGGACCTGCGCATGTCCGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGt < 2:1090224/100‑1 (MQ=255) cAGGCCGTCGATCAGGACCTGCGCATGTCCGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGTCGACCAGGAACATGGTGGCCTGCGCGCGCTCACCATCGc > 1:66170/1‑134 (MQ=255) cAGGCCGTCGATCAGGACCTGCGCATGTCCGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGTCGACCAGGAACATGGTGGCCTGCGCGCGCTCACCATCGc > 2:657926/1‑134 (MQ=255) cgcATGTCCGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGTCGa < 2:173808/77‑1 (MQ=255) cgcATGTCCGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGTCGa > 1:173808/1‑77 (MQ=255) aTGTCCGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGTCGAcc > 1:593323/1‑76 (MQ=255) aTGTCCGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGTCGAcc < 2:593323/76‑1 (MQ=255) aTGTCCGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGTCGACCAGGAACATGGTGGCCTGCGCGCGCTCACCATCGCCGGTGCGCGCCATCAGGATGCCgg > 2:396293/1‑134 (MQ=255) cGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGTCGAcc > 1:196532/1‑71 (MQ=255) cGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGTCGAcc < 2:196532/71‑1 (MQ=255) cGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGTCGACCAGGAACATGGTGGCCTGCGCGCGCTCACCATCGCCgg > 1:841335/1‑108 (MQ=255) cGCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGTCGACCAGGAACATGGTGGCCTGCGCGCGCTCACCATCGCCgg < 2:841335/108‑1 (MQ=255) gCCCAGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGTCGACCAGGAACATGGTGGCCTGCGCGCGCTCACCATCGCCGGTGCGCGCCATCAGGATGCCGGCGCTgg > 1:904316/1‑134 (MQ=255) | CGCATGCAATGCGACAGCCGCGCCGGCGACAAGCGAACCTGCGCATAACGGAAGCCCTCGTCCACCTCGCCCAGCACCTGGTCCTGCGGCACGCGCAGGCCGTCGATCAGGACCTGCGCATGTCCGCCCGGCATGGAACTGTCGATGGTGTCAAGCAGGCGTTCGATGCGGATCGCCGGATGGGGCAGGTCGACCAGGAACATGGTGGCCTGCGCGCGCTCACCATCGCCGGTGCGCGCCATCAGGATGCCGGCGCTGG > AM260480/2063789‑2064047 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |