| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AM260479 | 1,042,407 | T→G | K131N (AAA→AAC) | h16_A0947 ← | Coproporphyrinogen III oxidase, Fe‑S oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AM260479 | 1,042,407 | 0 | T | G | 100.0% | 83.1 / NA | 22 | K131N (AAA→AAC) | h16_A0947 | Coproporphyrinogen III oxidase, Fe‑S oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (10/12); total (10/12) | |||||||||||
CTTCGGCACCGCCGTGGATGCGCCCGAGCGCCTGGAGGTGCCGGTCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGTTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGACAGCAGCCGGTCCATGCCTGCCGCCGACAGCAGGCTGGGCGTGCCGCCGCCGATAAAGACCGTATGCA > AM260479/1042277‑1042534 | cTTCGGCACCGCCGTGGATGCGCCCGAGCGCCTGGAGGTGCCGGTCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTg < 2:92205/134‑1 (MQ=255)cTTCGGCACCGCCGTGGATGCGCCCGAGCGCCTGGAGGTGCCGGTCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTg < 1:400473/134‑1 (MQ=255) gAGCGCCTGGAGGTGCCGGTCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCg < 2:463679/133‑1 (MQ=255) gAGCGCCTGGAGGTGCCGGTCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCg > 1:463679/1‑133 (MQ=255) aGCGCCTGGAGGTGCCGGTCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCgg > 2:676971/1‑133 (MQ=255) ccTGGAGGTGCCGGTCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGTCATc > 2:241087/1‑133 (MQ=255) gAGGTGCCGGTCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCg > 1:997607/1‑134 (MQ=255) ggTCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCagcagc < 2:997607/134‑1 (MQ=255) tCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAgcgc > 1:914304/1‑134 (MQ=255) tGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATcc < 1:1079947/132‑1 (MQ=255) aTGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGAcag < 2:610781/134‑1 (MQ=255) tGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGAcag > 2:460468/1‑133 (MQ=255) cAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGACAGCAGCCGGTCCa > 1:824990/1‑134 (MQ=255) gCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGACAGCAGCCGGTCCAtg < 1:676971/134‑1 (MQ=255) cGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATc > 1:517415/1‑103 (MQ=255) cGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATc < 2:380366/103‑1 (MQ=255) cGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATc < 2:517415/103‑1 (MQ=255) cGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATc > 1:380366/1‑103 (MQ=255) gCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGACAGCAGCCGGTCCATGCCTGCCGCCGACAGCAGGCTGGGCGTgcc < 2:824990/134‑1 (MQ=255) tCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGTCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGACAGCAGCCGGTCCATGCCTGCCGCCGACAGCAGGCTGGGCGTGCCGCCGCCGAt < 1:241087/134‑1 (MQ=255) gCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGACAGCAGCCGGTCCATGCCTGCCGCCGACAGCAGGCTGGGCGTGCCGCCGCCGATaaa < 1:460468/134‑1 (MQ=255) gCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGACAGCAGCCGGTCCATGCCTGCCGCCGACAGCAGGCTGGGCGTGCCGCCGCCGATAAAGACCGTATGCa > 2:757044/1‑134 (MQ=255) | CTTCGGCACCGCCGTGGATGCGCCCGAGCGCCTGGAGGTGCCGGTCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGTTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGACAGCAGCCGGTCCATGCCTGCCGCCGACAGCAGGCTGGGCGTGCCGCCGCCGATAAAGACCGTATGCA > AM260479/1042277‑1042534 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |