| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AM260480 | 2,018,102 | +C | intergenic (+111/+98) | h16_B1778 → / ← h16_B1779 | putative peptidase/putative peptidase, S33 family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AM260480 | 2,018,101 | 1 | . | C | 100.0% | 50.5 / NA | 14 | intergenic (+110/+99) | h16_B1778/h16_B1779 | putative peptidase/putative peptidase, S33 family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base C (7/7); total (7/7) | |||||||||||
GTTGCGCTGAGCGCGGCAGGCGGGCGGCGGCGGGCGCTGAAGCATGGCAATGCCTTCAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCCGA‑CATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTCATGGCAGCCAGTATCAGCAATCTGCGCATTGCGCCCCTCATGCGTCAGCGCCTGTCTACATC > AM260480/2017982‑2018217 | gTTGCGCTGAGCGCGGCAGGCGGGCGGCGGCGGGCGCTGAAGCATGGCAATGCCTTCAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCCGACCATgcgcccgga < 1:458261/133‑6 (MQ=255) gggcgCTGAAGCATGGCAATGCCTTCAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCCGACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAgcgc > 1:651664/1‑134 (MQ=255) gCATGGCAATGCCTTCAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCCGACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTAACAGCGt > 1:985887/1‑133 (MQ=255) tGGCAATGCCTTCAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCCGACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTAACAGCGTCATg < 2:985887/134‑1 (MQ=255) cgccCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCCGACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAgcg > 1:861659/1‑96 (MQ=255) cgccCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCCGACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAgcg < 2:861659/96‑1 (MQ=255) cGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCCGACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGa > 1:194404/1‑77 (MQ=255) cGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCCGACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGa < 2:194404/77‑1 (MQ=255) cGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCCGACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTc > 1:825677/1‑90 (MQ=255) cGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCCGACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTc < 2:825677/90‑1 (MQ=255) cTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCCGACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTCATGGCAGCCAGTATCAGCAATCTGCGCATTGCGCCCCTCATGCGTc < 2:619027/134‑1 (MQ=255) tATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCCGACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTCATGGCAGCCAGTATCAGCAATCTGCGCATTGCGCCCCTCATGCGTCAg > 1:851161/1‑134 (MQ=255) gcATGGTCCGGGGCATGCCCGACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTCATGGCAGCCAGTATCAGCAATCTGCGCATTGCGCCCCTCATGCGTCAGCGCCTGTCt < 2:651664/134‑1 (MQ=255) tCCGGGGCATGCCCGACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTCATGGCAGCCAGTATCAGCAATCTGCGCATTGCGCCCCTCATGCGTCAGCGCCTGTCTACATc > 1:111829/1‑133 (MQ=255) | GTTGCGCTGAGCGCGGCAGGCGGGCGGCGGCGGGCGCTGAAGCATGGCAATGCCTTCAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCCGA‑CATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTCATGGCAGCCAGTATCAGCAATCTGCGCATTGCGCCCCTCATGCGTCAGCGCCTGTCTACATC > AM260480/2017982‑2018217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |