New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AM260479 | 735914 = | 31 (1.230) | 7 (0.290) | 7/194 | 1.2 | 20.4% | coding (925/1140 nt) | h16_A0686 | CBS‑domain‑containing membrane protein |
? | AM260479 | 735936 = | 25 (1.040) | coding (903/1140 nt) | h16_A0686 | CBS‑domain‑containing membrane protein |
GTCGTCGATCACCGGCGCGTGGTGCAAGCCGCCGTCCGAGAATGCCTGGGCCAACTCCACCATCGGCTGCTCGGGTCGGGCGGTGACAACGGCGCGTGTCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTGGCGTCCACTACCGGCAGGGCCTTGATACGGTGCCGCGACAGCAGGTGCCCGGCCTCATGTGCAGG > AM260479/735783‑736046 | gtcgtcGATCACCGGCGCGTGGTGCAAGCCGCCGTCCGAGAATGCCTGGGCCAACTCCACCATCGGCTGCTCGGGTCGGGCGGTGACAACGGCGCGTGTCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCcgccgc < 1:1032386/133‑1 (MQ=255) gtcgtcGATCACCGGCGCGTGGTGCAAGCCGCCGTCCGAGAATGCCTGGGCCAACTCCACCATCGGCTGCTCGGGTCGGGCGGTGACAACGGCGCGTGTCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCcgccgc < 1:352614/133‑1 (MQ=255) gtcgtcGATCACCGGCGCGTGGTGCAAGCCGCCGTCCGAGAATGCCTGGGCCAACTCCACCATCGGCTGCTCGGGTCGGGCGGTGACAACGGCGCGTGTCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCcgccgc < 1:83466/133‑1 (MQ=255) aTCACCGGCGCGTGGTGCAAGCCGCCGTCCGAGAATGCCTGGGCCAACTCCACCATCGGCTGCTCGGGTCGGGCGGTGACAACGGCGCGTGTCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCgg > 1:136262/1‑133 (MQ=255) tgaggccgggcacctgctgtcgcggcaccgtatcaaggccctgccggtagtggacgccacccggcggctggtaggcatcatcacccagagcgatttttttgcgGCGCACCGGTAt > 1:315743‑M1/104‑115 (MQ=255) tgaggccgggcacctgctgtcgcggcaccgtatcaaggccctgccggtagtggacgccacccggcggctggtaggcatcatcacccagagcgatttttttgcgGCGCACCGGTAt < 2:315743‑M1/12‑1 (MQ=255) agaATGCCTGGGCCAACTCCACCATCGGCTGCTCGGGTCGGGCGGTGACAACGGCGCGTGTCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTgg < 1:732119/134‑1 (MQ=255) ggCCAACTCCACCATCGGCTGCTCGGGTCGGGCGGTGACAACGGCGCGTGTCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGc < 2:957540/134‑1 (MQ=255) caccaTCGGCTGCTCGGGTCGGGCGGTGACAACGGCGCGTGTCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAgcc > 1:917039/1‑134 (MQ=255) aTCGGCTGCTCGGGTCGGGCGGTGACAACGGCGCGTGTCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGccgccg < 2:136262/134‑1 (MQ=255) ggtcgggCGGTGACAACGGCGCGTGTCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCt > 2:856813/1‑76 (MQ=255) ggtcgggCGGTGACAACGGCGCGTGTCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCt < 1:856813/76‑1 (MQ=255) ggCGGTGACAACGGCGCGTGTCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTGGCGTCCACTACCg < 1:428159/134‑1 (MQ=255) cacccggcggctggtaggcatcatcacccagagcgatttttttgcgGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGCGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTGGCGTCCACTACCGGCAGGGc < 1:303770‑M1/88‑1 (MQ=255) aCGGCGCGTGTCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTg < 2:820859/111‑1 (MQ=255) aCGGCGCGTGTCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTg > 1:820859/1‑111 (MQ=255) gtCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTgg < 2:564428/75‑1 (MQ=255) gtCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTgg > 1:564428/1‑75 (MQ=255) gtCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTa > 2:378319/1‑88 (MQ=255) gtCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTa < 1:378319/88‑1 (MQ=255) gcatcatcacccagagcgatttttttgcgGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTGGCGTCCACTACCGGCAGGGCCTTGATACGGTGCcgc < 1:857614‑M1/104‑1 (MQ=255) cGCACGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTGGCGTCCACTACCGGCAGGGCCTTGATACGGTGCCGCGAcagcag < 2:917039/134‑1 (MQ=255) aCGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTGGCGTCCACTACCGGCAGGGCCTTGATACGGTGCCGCGACAGCAGGTg < 1:441538/134‑1 (MQ=255) cGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTGGCGTCCACTACCGGCAGGGCCTTGATACGGTGCCGCGACAGCAGGTGc > 1:74903/1‑134 (MQ=255) agagcgatttttttgcgGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTGGCGTCCACTACCGGCAGGGCCTTGATACGGTGCCGCGACAGCAGGTGcc > 2:857614‑M1/18‑134 (MQ=255) gTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTGGCGTCCACTACCGGCAGGGCCTTGATACGGTGCCGCGACAGCAGGTGccc > 2:423367/1‑134 (MQ=255) tACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTGGCGTCCACTACCGGCAGGGCCTTGATACGGTGCCGCGACAGCAGGTGCCCg < 2:74903/134‑1 (MQ=255) cagccagcCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAAt > 2:498071/1‑45 (MQ=255) cagccagcCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAAt < 1:498071/45‑1 (MQ=255) atttttttgcgGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTGGCGTCCACTAc > 1:85109‑M1/12‑90 (MQ=255) atttttttgcgGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTGGCGTCCACTAc < 2:85109‑M1/79‑1 (MQ=255) cgcgCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGt < 1:121489/44‑1 (MQ=255) cgcgCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGt > 2:121489/1‑44 (MQ=255) cgcgCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTGGCGTCCACTACCGGCAGGGCCtt > 2:854271/1‑92 (MQ=255) cgcgCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTGGCGTCCACTACCGGCAGGGCCtt < 1:854271/92‑1 (MQ=255) cgcgCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTGGCGTCCACTACCGGCAGGGCCTTGATa < 1:419146/96‑1 (MQ=255) cgcgCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTGGCGTCCACTACCGGCAGGGCCTTGATa > 2:419146/1‑96 (MQ=255) cgcgCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTGGCGTCCACTACCGGCAGGGCCTTGATACGGTGCCGCGACAGCAGGTGCCCGGCCTCATGTGCAgg > 2:482580/1‑134 (MQ=255) | GTCGTCGATCACCGGCGCGTGGTGCAAGCCGCCGTCCGAGAATGCCTGGGCCAACTCCACCATCGGCTGCTCGGGTCGGGCGGTGACAACGGCGCGTGTCATCAGGTCCCGCACGGTACCAGCCAGCCGCCGCGCACCGGTATCACGCTGCGCCGCAAAAAAATCGCTCTGGGTGATGATGCCTACCAGCCGCCGGGTGGCGTCCACTACCGGCAGGGCCTTGATACGGTGCCGCGACAGCAGGTGCCCGGCCTCATGTGCAGG > AM260479/735783‑736046 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |