Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | AM260480 | 2311317 | 2311317 | 1 | 28 [0] | [0] 23 | h16_B2054 | putative transporter |
GCACGCCGATCAGGGTACCCAGCACGCAGCCCAGGAAGGCGTAGGCCAGGTTCTGCAGCGACAGGGCCGTGGAAAAGCCCAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGATAAAGGCCGGCCACACCGGCATCTGCAGGTTGATGCCGTAGACGAATGCGCCAAGGCTGATCAGCACCAGCACCACGGCGTTGAGCAGCGCGCCCTTCCAGCTGAATTCATGGCTGGCCATCGACGAC > AM260480/2311188‑2311444 | gcaCGCCGATCAGGGTACCCAGCACGCAGCCCAGGAAGGCGTAGGCCAGGTTCTGCAGCGACAGGGCCGTGGAAAAGCCCAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtact > 1:166921‑M1/1‑129 (MQ=255) caCGCCGATCAGGGTACCCAGCACGCAGCCCAGGAAGGCGTAGGCCAGGTTCTGCAGCGACAGGGCCGTGGAAAAGCCCAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaa > 1:63324‑M1/1‑128 (MQ=255) cAGGAAGGCGTAGGCCAGGTTCTGCAGCGACAGGGCCGTGGAAAAGCCCAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaaagtaatgtcac > 2:519653‑M1/1‑98 (MQ=255) cAGGAAGGCGTAGGCCAGGTTCTGCAGCGACAGGGCCGTGGAAAAGCCCAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaaagtaatgtcac < 1:519653‑M1/125‑28 (MQ=255) tAGGCCAGGTTCTGCAGCGACAGGGCCGTGGAAAAGCCCAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaaagtaatgtcacatagcggcatacttgcatt < 2:63324‑M1/134‑47 (MQ=255) ggCCAGGTTCTGCAGCGACAGGGCCGTGGAAAAGCCCAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactg < 1:323571‑M1/100‑15 (MQ=255) ggCCAGGTTCTGCAGCGACAGGGCCGTGGAAAAGCCCAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactg > 2:323571‑M1/1‑86 (MQ=255) cGACAGGGCCGTGGAAAAGCCCAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtac < 2:525944‑M1/74‑4 (MQ=255) cGACAGGGCCGTGGAAAAGCCCAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtac > 1:525944‑M1/1‑71 (MQ=255) gACAGGGCCGTGGAAAAGCCCAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaaagtaatgtcacatagcggcatacttgcattcgggctggcaaaagaac > 1:516722‑M1/1‑70 (MQ=255) ggCCGTGGAAAAGCCCAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaaagtaat > 1:211148‑M1/1‑65 (MQ=255) ggCCGTGGAAAAGCCCAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaaagtaat < 2:211148‑M1/87‑23 (MQ=255) ccGTGGAAAAGCCCAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaaagtaatgtcacatagcggcatacttgcattcgggctggcaa < 2:343604‑M1/120‑58 (MQ=255) ccGTGGAAAAGCCCAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaaagtaatgtcacatagcggcatacttgcattcgggctggcaa > 1:343604‑M1/1‑63 (MQ=255) cGTGGAAAAGCCCAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaaagtaatgtcacatagcggcatacttgcattcgggctggcaaaagaacgatttgacc < 2:516722‑M1/134‑73 (MQ=255) aaaGCCCAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaaagtaatgtcacatagcggcatacttgcattcgggctggcaaaagaacgatttgaccaggctc > 2:246640‑M1/1‑56 (MQ=255) ccAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaaagtaatgtcacatagc > 2:505156‑M1/1‑51 (MQ=255) ccAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaaagtaatgtcacatagc < 1:505156‑M1/83‑33 (MQ=255) ccAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaaagt > 1:588008‑M1/1‑51 (MQ=255) ccAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaaagt < 2:588008‑M1/70‑20 (MQ=255) ccAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaa < 1:721824‑M1/67‑17 (MQ=255) ccAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaa > 2:721824‑M1/1‑51 (MQ=255) cGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaaagtaatgtcacatagcggcatacttgcatt < 2:433689‑M1/66‑47 (MQ=255) cGGCGCTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaaagtaatgtcacatagcggcatacttgcatt > 1:433689‑M1/1‑20 (MQ=255) cTCCTTAACCGGTGAtactaaccttactgaaagtaatgtcacatagcggcatacttgcattcgggctggcaaaagaacgatttgaccaggctcggcaatttctggatgcgacgcaaagcgccgagcgccagttt > 2:114277‑M1/1‑15 (MQ=255) ccGGTGAtactaaccttactgaaagtaatgtcacatagcggcatacttgcattcgggctggcaaaagaacgatttgaccaggctcggcaatttctggatgcgacgcaaagcgccgagcgccagtttcttcatgt > 2:316127‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGGTGAtactaaccttactgaaagtaatgtcacatagcggcatacttgcattcgggctggcaaaagaacgatttgaccaggctcggcaatttctggatgcgacgcaaagcgccgagcgccagtttcttcatgt > 2:660410‑M1/1‑7 (MQ=255) cGGTGAtactaaccttactgaaagtaatgtcacatagcggcatacttgcattcgggctggcaaaagaacgatttgaccaggctcggcaatttctggatgcgacgcaaagcgccgagcgccagtttcttcatgtc < 2:166921‑M1/134‑129 (MQ=255) | GCACGCCGATCAGGGTACCCAGCACGCAGCCCAGGAAGGCGTAGGCCAGGTTCTGCAGCGACAGGGCCGTGGAAAAGCCCAGCGCAAGGTGATCAAACAATTCCATGGTCGGCGCTCCTTAACCGGTGATAAAGGCCGGCCACACCGGCATCTGCAGGTTGATGCCGTAGACGAATGCGCCAAGGCTGATCAGCACCAGCACCACGGCGTTGAGCAGCGCGCCCTTCCAGCTGAATTCATGGCTGGCCATCGACGAC > AM260480/2311188‑2311444 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |