| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AM260479 | 208,953 | A→C | V315V (GTT→GTG) | h16_A0195 ← | Putative GTPase (G3E family) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AM260479 | 208,953 | 0 | A | C | 100.0% | 103.5 / NA | 27 | V315V (GTT→GTG) | h16_A0195 | Putative GTPase (G3E family) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (14/13); total (14/13) | |||||||||||
GATGGCGTCGCGGGGCAGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCATGGAACACCACTTTGCGGTCAACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGTTTTTCCCCGTATACGGCCAGGATGCCGGACAGGAATTCCTCCAGCTTGCCGTAGTGGAAGGGCTTGTCGCTGCGG > AM260479/208827‑209067 | gATGGCGTCGCGGGGCAGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGTGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGt > 2:1014527/1‑134 (MQ=255)gATGGCGTCGCGGGGCAGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGCCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGt > 2:735376/1‑134 (MQ=255) aTGGCGTCGCGGGGCAGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGCCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTc < 1:735376/134‑1 (MQ=255) gcgGGGCAGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCatatat < 2:461193/133‑1 (MQ=255) gcgGGGCAGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCatatat < 1:1014527/133‑1 (MQ=255) gggCAGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCcaca > 1:256263/1‑118 (MQ=255) gggCAGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCcaca < 2:256263/118‑1 (MQ=255) gATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCatatat < 1:6212/115‑1 (MQ=255) gATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTAGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCatatat > 2:6212/1‑115 (MQ=255) ccATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGtttt < 1:23398/134‑1 (MQ=255) cgTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACAcc > 2:945437/1‑90 (MQ=255) cgTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACAcc < 1:30248/90‑1 (MQ=255) cgTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACAcc > 2:30248/1‑90 (MQ=255) cgTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACAcc < 1:945437/90‑1 (MQ=255) cgTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCatatat > 2:1062512/1‑100 (MQ=255) cgTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCatatat < 1:1062512/100‑1 (MQ=255) cGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGTTTTTCCCCGTATACgg > 2:885166/1‑134 (MQ=255) gggTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCatatat > 1:886325/1‑92 (MQ=255) gggTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCatatat < 2:886325/92‑1 (MQ=255) gTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGTTTTTCCCCGTATACGGCCAg < 2:163550/134‑1 (MQ=255) tccCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACAcc > 1:882256/1‑71 (MQ=255) tccCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACAcc < 2:882256/71‑1 (MQ=255) ggCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCacac < 2:524095/62‑1 (MQ=255) ggCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCacac > 1:524095/1‑62 (MQ=255) gACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGttt < 1:646522/69‑1 (MQ=255) gACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGttt > 2:646522/1‑69 (MQ=255) ccctGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGTTTTTCCCCGTATACGGCCAGGATGCCGGACAGGAATTCCTCCAGCTTGCCGTAGTGGAAGGGCTTGTCGCt > 1:747607/4‑134 (MQ=255) aaCACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGTTTTTCCCCGTATACGGCCAGGATGCCGGACAGGAATTCCTCCAGCTTGCCGTAGTGGAAGGGCTTGTCGCTGCgg > 2:369678/1‑132 (MQ=255) aaCACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGTTTTTCCCCGTATACGGCCAGGATGCCGGACAGGAATTCCTCCAGCTTGCCGTAGTGGAAGGGCTTGTCGCTGCgg > 2:920474/1‑132 (MQ=255) | GATGGCGTCGCGGGGCAGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCATGGAACACCACTTTGCGGTCAACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGTTTTTCCCCGTATACGGCCAGGATGCCGGACAGGAATTCCTCCAGCTTGCCGTAGTGGAAGGGCTTGTCGCTGCGG > AM260479/208827‑209067 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |