| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AM260479 | 735,524 | +G | intergenic (‑409/+175) | h16_A0685 ← / ← h16_A0686 | hypothetical membrane spanning protein/Predictedpermease/CBS‑domain‑containing membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AM260479 | 735,521 | 1 | . | G | 100.0% | 70.8 / NA | 20 | intergenic (‑406/+178) | h16_A0685/h16_A0686 | hypothetical membrane spanning protein/Predictedpermease/CBS‑domain‑containing membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (12/8); total (12/8) | |||||||||||
GAGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑GGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGCATCGTCGGTTTCTTCTG > AM260479/735388‑735649 | gAGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTGCGCCATGTGAGTCa < 2:45903/134‑1 (MQ=255) cAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑ggggca < 2:1063677/134‑4 (MQ=255) aaaaaGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑ggggcag < 1:411004/134‑5 (MQ=255) aaaaaGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑ggggcag < 1:774661/134‑5 (MQ=255) cAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGtt < 1:571633/134‑1 (MQ=255) aaaaaCGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTaa > 1:573268/1‑134 (MQ=255) aaaaCGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCa < 2:90636/114‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCa > 1:90636/1‑114 (MQ=255) aaaaCGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAAc > 2:214208/1‑134 (MQ=255) aaaaCGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGATGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAAc > 2:585892/1‑134 (MQ=255) cTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTAtt < 2:733768/130‑1 (MQ=255) cTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTAtt > 1:733768/1‑130 (MQ=255) gccggcAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATcccc < 2:573268/134‑1 (MQ=255) atcaatTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAgg > 2:928017/1‑134 (MQ=255) tggtTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCctgctg > 2:366661/1‑132 (MQ=255) tggtTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCctgctg < 1:366661/132‑1 (MQ=255) gCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCgg > 2:1090517/1‑133 (MQ=255) cTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGa < 1:1090517/133‑1 (MQ=255) ttCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGAGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACg > 2:422617/1‑134 (MQ=255) ccGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGgc > 1:810040/1‑134 (MQ=255) gTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTgcgc < 1:585892/134‑1 (MQ=255) aGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGc < 2:371564/117‑1 (MQ=255) aGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGc > 1:371564/1‑117 (MQ=255) aGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGCATCGTCGGTTtcttct < 1:214208/133‑1 (MQ=255) aGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGCATCGTCGGTTTCTTCTg > 2:690038/1‑134 (MQ=255) aGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGCATCGTCGGTTTCTTCTg > 1:215803/1‑134 (MQ=255) | GAGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑GGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGCATCGTCGGTTTCTTCTG > AM260479/735388‑735649 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |