| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | AY305378 | 445951 | 452156 | 6206 | 29 [0] | [0] NA | cbbEp–cbbLp | cbbEp,cbbYp,cbbXp,cbbSp,cbbLp |
GCGACGTTGAGAATCAGGCCGTTGAAGCCACCGCTGGCGTCCGGATAGCGGCGGCGTTCCTCGATCAGGAACTGCGTCAGGGTCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGGCTATGTATTCTTGTGTGGTGCCGTGCGGGCTACGTGATGGTGGCGGCCTCGCGCAAGCGGTGCAGGATGCCCCGGTAGCCGCCGTCGGCATCCGGCGCGCCGAACACGGCGCTGCCGGCCACGAAGGTGTC > AY305378/445827‑446082 | gCGACGTTGAGAATCAGGCCGTTGAAGCCACCGCTGGCGTCCGGATAGCGGCGGCGTTCCTCGATCAGGAACTGCGTCAGGGTCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctctttt > 2:29034‑M2/1‑124 (MQ=255)gCGACGTTGAGAATCAGGCCGTTGAAGCCACCGCTGGCGTCCGGATAGCGGCGGCGTTCCTCGATCAGGAACTGCGTCAGGGTCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctctttt < 2:666769‑M2/133‑10 (MQ=255) agaATCAGGCCGTTGAAGCCACCGCTGGCGTCCGGATAGCGGCGGCGTTCCTCGATCAGGAACTGCGTCAGGGTCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaag > 2:914727‑M2/1‑115 (MQ=255) gTTGAAGCCACCGCTGGCGTCCGGATAGCGGCGGCGTTCCTCGATCAGGAACTGCGTCAGGGTCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtggg > 2:241881‑M2/1‑104 (MQ=255) gTTGAAGCCACCGCTGGCGTCCGGATAGCGGCGGCGTTCCTCGATCAGGAACTGCGTCAGGGTCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtggg < 1:241881‑M2/127‑24 (MQ=255) aGCCACCGCTGGCGTCCGGATAGCGGCGGCGTTCCTCGATCAGGAACTGCGTCAGGGTCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggc < 2:237424‑M2/134‑36 (MQ=255) gCTGGCGTCCGGATAGCGGCGGCGTTCCTCGATCAGGAACTGCGTCAGGGTCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttc > 1:666769‑M2/1‑92 (MQ=255) ggCGTCCGGATAGCGGCGGCGTTCCTCGATCAGGAACTGCGTCAGGGTCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcagg < 2:295627‑M2/134‑46 (MQ=255) gCGTCCGGATAGCGGCGGCGTTCCTCGATCAGGAACTGCGTCAGGGTCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcaggt > 1:237424‑M2/1‑88 (MQ=255) gcggcggcgTTCCTCGATCAGGAACTGCGTCAGGGTCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcaggtaaagagcaaca > 2:778965‑M2/1‑77 (MQ=255) tCAGGGTCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcaggtaaagagcaacaagagcgatgcatagcaaactgtttgaagc > 1:295627‑M2/1‑48 (MQ=255) aGGGTCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcaggtaaagagcaacaagagcgatgcatagcaaactgtttgaagcag < 1:567729‑M2/134‑89 (MQ=255) aGGGTCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcaggtaaagagcaacaagagcgatgcatagcaaactgtttgaagcag < 1:237978‑M2/134‑89 (MQ=255) aGGGTCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaag > 1:404306‑M2/1‑46 (MQ=255) aGGGTCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaag < 2:404306‑M2/65‑20 (MQ=255) tCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcaggtaaagagcaacaagagcgatgcatagcaaactgtttgaagcag < 1:447256‑M2/130‑89 (MQ=255) tCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcaggtaaagagcaacaagagcgatgcatagcaaactgtttgaagcag > 2:447256‑M2/1‑42 (MQ=255) tCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggcttcaggtaaagagcaacaagagcgatgcatagcaaaatgtttgaagcagccct < 2:449037‑M2/134‑93 (MQ=255) cTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcaggtaaagagcaacaagagcgatgcata < 2:685315‑M2/105‑71 (MQ=255) cTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcaggtaaagagcaacaagagcgatgcata > 1:685315‑M2/1‑35 (MQ=255) cTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcaggtaaagagcaacaagagcgatgcatagcaaactgtttgaagcagcccttggcataagcga < 2:684993‑M2/134‑105 (MQ=255) cTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcaggtaa < 2:753743‑M2/78‑49 (MQ=255) cTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcaggtaa > 1:753743‑M2/1‑30 (MQ=255) gTCTCCTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcaggtaaagagcaacaagagcgatgcatagcaaactgtttgaagcagcccttggcataagcgatccgtggttcgtccg < 1:702528‑M2/134‑120 (MQ=255) ccTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcaggtaaagag < 1:193358‑M2/63‑53 (MQ=255) ccTATAGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcaggtaaagag > 2:193358‑M2/1‑11 (MQ=255) aGATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcaggtaaagagcaacaagagcgatgcatagcaaactgtttgaagcagcccttggcataagcgatccgtggttcgtccgggaagtcga < 2:23558‑M2/134‑129 (MQ=255) gATTGgcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcaggtaaagagcaacaagagcgatgcatagcaaactgtttgaagcagcccttggcataagcgatccgtggttcgtccgggaagtcgac > 2:702528‑M2/1‑5 (MQ=255) ggcctcttttgaatttcaagtgggtggtatcgtggcgggtttcaggtaaagagcaacaagagcgatgcatagcaaactgtttgaagcagcccttggcataagcgatccgtggttcgtccgggaagtcgacttc < 1:1071738‑M2/133‑133 (MQ=255) | GCGACGTTGAGAATCAGGCCGTTGAAGCCACCGCTGGCGTCCGGATAGCGGCGGCGTTCCTCGATCAGGAACTGCGTCAGGGTCATCCGCTGGACTTCGGGCATGACAGGTCTCCTATAGATTGGCTATGTATTCTTGTGTGGTGCCGTGCGGGCTACGTGATGGTGGCGGCCTCGCGCAAGCGGTGCAGGATGCCCCGGTAGCCGCCGTCGGCATCCGGCGCGCCGAACACGGCGCTGCCGGCCACGAAGGTGTC > AY305378/445827‑446082 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |