| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AM260480 | 2,295,879 | T→A | Q603L (CAG→CTG) | h16_B2042 ← | Hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AM260480 | 2,295,879 | 0 | T | A | 100.0% | 50.6 / NA | 15 | Q603L (CAG→CTG) | h16_B2042 | Hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (6/9); total (6/9) | |||||||||||
GTTGCTGGTCGCGGGCCTGGTCCTGCCACTGGCGTTGCTGGGCGTCGCGTTGCCGGGCCTCCTGCTGTTGCCGCTGCAGATCAGGCGCCTGCCGCTGCTGCTCGCGCAGCGCGCGCTGCTGTTCCCGCTGCTGCTCCATCTGCTGGCGCTGCAAAACCTGCTGCTGTTCGCGCTGCATGCCCTGCGCCCGCCGTTGCGGGTCGGCCGGTCCGCCCGGCTGGCCCGGCTGGCCAACAAAGCCGCGGGCTTCGTCGGGCCGGC > AM260480/2295748‑2296008 | gTTGCTGGTCGCGGGCCTGGTCCTGCCACTGGCGTTGCTGGGCGTCGCGTTGCCGGGCCTCCTGCTGTTGCCGCTGCAGATCAGGCGCCTGCCGCTGCTGCTCGCGCAGCGCGCGCTGCTGTTCCCgctgcagc < 2:145565/134‑1 (MQ=255) cTGCCACTGGCGTTGCTGGGCGTCGCGTTGCCGGGCCTCCTGCTGTTGCCGCTGCAGATCAGGCGCCTGCCGCTGCTGCACGCGCAGCGCGCGCTGCTGTTCCCGCTGCAGCTCCATCTGCTGGCGCTGCaaaa < 2:928652/134‑1 (MQ=255) gTTGCTGGGCGTCGCGTTGCCGGGCCTCCTGCTGTTGCCGCTGCAGATCAGGCGCCTGCCGCTGCTGCTCGCGCAGCGCGCGCTGCTGTTCCCGCTGCAGCTCCATCTGCTGGCGCTGCAAAACCTGCTGCTGt < 1:890172/134‑1 (MQ=255) ttGCTGGGCGTCGCGTTGCCGGGCCTCCTGCTGTTGCCGCTGCAGATCAGGCGCCTGCCGCTGCTGCTCGCGCAGCGCGCGCTGCTGTTCCCGCTGCAGCTCCATCTGCTGGCGCTGCAAAACCTGCTGCTGtt > 2:64535/1‑134 (MQ=255) cctcctGCTGTTGCCGCTGCAGATCAGGCGCCTGCCGCTGCTGCTCGCGCAGCGCGCGCTGCTGTTCCCGCTGCAGCTCCATCTGCTGGCGCTGCAAAACCTGCTGCTGTTCGCGCTGCATGCCCTGcgcccgc < 1:948844/134‑1 (MQ=255) cctcctGCTGTTGCCGCTGAAGATCAGGCGCCTGCCGCTGCTGCTCGCGCAGCGCGCGCTGCTGTTCCCGCTGCAGCTCCATCTGCTGGCGCTGCAAAACCTGCTGCTGTTCGCGCTGCATGCCCTGcgcccgc < 1:897534/134‑1 (MQ=255) cAGATCAGGCGCCTGCCGCTGCTGCTCGCGCAGCGCGCGCTGCTGTTCCCGCTGCAGCTCCATCTGCTGGCGCTGCAAAACCTGCTGCTGTTCGCGCTGCATGCCCTGCGCCCGCCGTTGCGGGTCGGCCgg < 1:315613/132‑1 (MQ=255) cAGATCAGGCGCCTGCCGCTGCTGCTCGCGCAGCGCGCGCTGCTGTTCCCGCTGCAGCTCCATCTGCTGGCGCTGCAAAACCTGCTGCTGTTCGCGCTGCATGCCCTGCGCCCGCCGTTGCGGGTCGGCCGGTc > 1:910299/1‑134 (MQ=255) cTGCCGCTGCTGCTCGCGCAGCGCGCGCTGCTGTTCCCGCTGCAGCTCCATCTGCTGGCGCTGCAAAACCTGCTGCTGTTCGCGCTGCATGCCCTGCGCCCGCCGTTGCGGGTCGGc < 1:229217/117‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGCTGCTCGCGCAGCGCGCGCTGCTGTTCCCGCTGCAGCTCCATCTGCTGGCGCTGCAAAACCTGCTGCTGTTCGCGCTGCATGCCCTGCGCCCGCCGTTGCGGGTCGGc > 2:229217/1‑117 (MQ=255) cTGCCGCTGCTGCTCGCGCAGCGCGCGCTGCTGTTCCCGCTGCAGCTCCATCTGCTGGCGCTGCAAAACCTGCTGCTGTTCGCGCTGCATGCCCTGCGCCCGCCGTTGCGGGTCGGCCGGTCCgcccggctggc > 1:1043755/1‑134 (MQ=255) ctgctgctCGCGCAGCGCGCGCTGCTGTTCCCGCTGCAGCTCCATCTGCTGGCGCTGCAAAACCTGCTGCTGTTCGCGCTGCATGCCCTGCGCCCGCCGTGGCGGGTCGGCCGGTCCgcccggctggcccgcaa < 2:860795/134‑4 (MQ=255) tgctgctCGCGCAGCGCGCGCTGCTTTTCCCGCTGCAGCTCCATCTGCTGGCGCTGCAAAACCTGCTGCTGTTCGCGCTGCATGCCCTGCGCCCGCCGTTGCGGGTCGGCCGGTCCgcccggctggcccggctg > 2:929896/1‑134 (MQ=255) cgcAGCGCGCGCTGCTGTTCCCGCTGCAGCTCCATCTGCTGGCGCTGCAAAACCTGCTGCTGt < 1:930486/63‑1 (MQ=255) cgcAGCGCGCGCTGCTGTTCCCGCTGCAGCTCCATCTGCTGGCGCTGCAAAACCTGCTGCTGt > 2:930486/1‑63 (MQ=255) ctgTTCCCGCTGCAGCTCCATCTGCTGGCGCTGCAAAACCTGCTGCTGTTCGCGCTGCATGCCCTGCGCCCGCCGTTGCGGGTCGGCCGGTCCGCCCGGCTGGCCCGGCTGGCCAACAAAGCCGCGGGCTtcg < 2:390235/133‑1 (MQ=255) ctgcagctCCATCTGCTGGCGCTGCAAAACCTGCTGCTGTTCGCGCTGCATGCCCTGCGCCCGCCGTTGCGGGTCGGCCGGTCCGCCCGGCTGGCCCGGCTGGCCAACAAAGCCGCGGGCTTCGTCGGGCCGgc < 1:929896/134‑1 (MQ=255) | GTTGCTGGTCGCGGGCCTGGTCCTGCCACTGGCGTTGCTGGGCGTCGCGTTGCCGGGCCTCCTGCTGTTGCCGCTGCAGATCAGGCGCCTGCCGCTGCTGCTCGCGCAGCGCGCGCTGCTGTTCCCGCTGCTGCTCCATCTGCTGGCGCTGCAAAACCTGCTGCTGTTCGCGCTGCATGCCCTGCGCCCGCCGTTGCGGGTCGGCCGGTCCGCCCGGCTGGCCCGGCTGGCCAACAAAGCCGCGGGCTTCGTCGGGCCGGC > AM260480/2295748‑2296008 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |