| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AM260480 | 69,908 | +G | intergenic (+89/‑184) | h16_B0060 → / → h16_B0061 | conserved hypothetical membrane protein/ABC‑type transporter, periplasmic component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AM260480 | 69,908 | 1 | . | G | 100.0% | 104.9 / NA | 28 | intergenic (+89/‑184) | h16_B0060/h16_B0061 | conserved hypothetical membrane protein/ABC‑type transporter, periplasmic component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (15/13); total (15/13) | |||||||||||
CAGCTTTGCGGGGTTGGACCCGGCTGTGCCGGCTTTCCCCTGAGCCGTCGGCGTATCGTCGCTTATTGTCGTTCAACGCGGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTA‑CGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGATGCCGCTGCAACACTCCGATCTTTCCCGGTTTGCCCCCATGAGACGCATGCGGTAACTTGCGTAACGGCG > AM260480/69777‑70023 | cAGCTTTGCGGGGTTGGACCCGGCTGTGCCGGCTTTCCCCTGAGCCGTCGGCGTATCGTCGCTTATTGTCGTTCAACGCGGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTagc > 1:368259/1‑132 (MQ=255) cGGGGTTGGACCCGGCTGTGCCGGCTTTCCCCTGAGCCGTCGGCGTATCGTCGCTTATTGTCGTTCAACGCGGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGcccc < 2:1069653/133‑1 (MQ=255) gTTGGACCCGGCTGTGCCGGCTTTCCCCTGAGCCGTCGGCGTATCGTCGCTTATTGTCGTTCAACGCGGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTc < 2:638294/134‑1 (MQ=255) gtgCCGGCTTTCCCCTGAGCCGTCGGCGTATCGTCGCTTATTGTCGTTCAACGCGGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGc > 1:1161535/1‑134 (MQ=255) ggCTTTCCCCTGAGCCGTCGGCGTATCGTCGCTTATTGTCGTTCAACGCGGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTcg > 1:638066/1‑134 (MQ=255) tCCCCTGAGCCGTCGGCGTATCGTCGCTTATTGTCGTTCAACGCGGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGtt > 1:199326/1‑134 (MQ=255) cGTCGGCGTATCGTCGCTTATTGTCGTTCAACGCGGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGAt > 1:239447/1‑134 (MQ=255) gTCGGCGTATCGTCGCTTATTGTCGTTCAACGCGGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGATg > 1:986806/1‑134 (MQ=255) cGTATGGTCGCTTATTGTCGTTCAACGCGGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGATGCCGCt > 2:907368/1‑134 (MQ=255) cGTATCGTCGCTTATTGTCGTTCAACGCGGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGt > 2:140856/1‑117 (MQ=255) cGTATCGTCGCTTATTGTCGTTCAACGCGGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGt < 1:140856/117‑1 (MQ=255) cGTATCGTCGCTTATTGTCGTTCAACGCGGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGATGCCGCt < 2:323166/134‑1 (MQ=255) gTTCAACGCGGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGATGCCGCTGCAACACTCCGATCTTTcc < 1:536447/134‑1 (MQ=255) aaCGCGGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGATGCCGCTGCAACACTCCGATCTTTCCCgg < 2:986806/133‑1 (MQ=255) aaCGCGGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGATGCCGCTGCAACACTCCGATCTTTCCCGGt > 1:972349/1‑134 (MQ=255) aaCGCGGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGATGCCGCTGCAACACTCCGATCTTTCCCGGt < 2:239447/134‑1 (MQ=255) cgGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGATGCCGCTGCAACACTCCGATCTTTCCCGGTTTGc < 2:972349/134‑1 (MQ=255) gTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGgt < 1:620309/94‑1 (MQ=255) gTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGgt > 2:620309/1‑94 (MQ=255) aTGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTcgcg < 2:89112/81‑1 (MQ=255) aTGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTcgcg > 1:89112/1‑81 (MQ=255) aTGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGATGCCGCTGCAACACTCCGATCTTTCCCGGTTTGCCCCCAt > 1:446807/1‑133 (MQ=255) cgcgcgCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGATGCCGCTGCAACACTCCGATCTTTCCCGGTTTGCCCCCATGAGACGCATg > 1:1103433/1‑134 (MQ=255) gcgcgcCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGATGCCGCTGCAACACTCCGATCTTTCCCGGTTTGCCCCCATGAGACGCATGc > 2:470908/1‑134 (MQ=255) gcgcgcCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGATGCCGCTGCAACACTCCGATCTTTCCCGGTTTGCCCCCATGAGACGCATGc > 1:379311/1‑134 (MQ=255) gcgcCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGATGCCGCTGCAACACTCCGATCTTTCCCGGTTTGCCCCCATGAGACGCATGCgg < 2:368259/134‑1 (MQ=255) ggcgCGCCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGATGCCGCTGCAACACTCCGATCTTTCCCGGTTTGCCCCCATGAGACGCATGCGGTAACTTGCg > 2:660480/1‑133 (MQ=255) gcCCTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGATGCCGCTGCAACACTCCGATCTTTCCCGGTTTGCCCCCATGAGACGCATGCGGTAACTTGCGTAACgg < 2:638066/134‑1 (MQ=255) ccTGACGCGCATCCTTTAGCGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGATGCCGCTGCAACACTCCGATCTTTCCCGGTTTGCCCCCATGAGACGCATGCGGTAACTTGCGTAACGgcg < 2:1161535/134‑1 (MQ=255) | CAGCTTTGCGGGGTTGGACCCGGCTGTGCCGGCTTTCCCCTGAGCCGTCGGCGTATCGTCGCTTATTGTCGTTCAACGCGGTCGCATGTCTTTCCGCGCGCCCTTGCGGCGCGCCCTGACGCGCATCCTTTA‑CGCGCCCCGGCTCGCACCGGAACCGCCTTCGCGGTTCCGGTGTGATGCCGCTGCAACACTCCGATCTTTCCCGGTTTGCCCCCATGAGACGCATGCGGTAACTTGCGTAACGGCG > AM260480/69777‑70023 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |