| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AM260480 | 2,018,102 | +C | intergenic (+111/+98) | h16_B1778 → / ← h16_B1779 | putative peptidase/putative peptidase, S33 family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AM260480 | 2,018,101 | 1 | . | C | 100.0% | 41.5 / NA | 12 | intergenic (+110/+99) | h16_B1778/h16_B1779 | putative peptidase/putative peptidase, S33 family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base C (6/6); total (6/6) | |||||||||||
GCAGCGTTCAGGTCGTTGCGCTGAGCGCGGCAGGCGGGCGGCGGCGGGCGCTGAAGCATGGCAATGCCTTCAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCC‑‑GA‑CATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTCATGGCAGCCAGTATCAGCAATCTGCGCATTGCGCCCCTCATGCGTCAGCGCCTG > AM260480/2017968‑2018209 | gcAGCGTTCAGGTCGTTGCGCTGAGCGCGGCAGGCGGGCGGCGGCGGGCGCTGAAGCATGGCAATGCCTTCAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCC‑‑Ga > 2:920154/1‑134 (MQ=255) gCGTTCAGGTCGTTGCGCTGAGCGCGGCAGGCGGGCGGCGGCGGGCGCTGAAGCATGGCAATGCCTTCAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCC‑‑GA‑cca < 1:1038780/134‑3 (MQ=255) ttCAGGTCGTTGCGCTGAGCGCGGCAGGCGGGCGGCGGCGGGCGCTGAAGCATGGCAATGCCTTCAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCC‑‑GA‑ccatgc > 2:604127/1‑129 (MQ=255) ggcgggcgGCGGCGGGCGCTGAAGCATGGCAATGCCTTCAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTC‑‑GGGCATGCCCCGGACCATGCGCACCGATGGcc < 2:800300/120‑1 (MQ=255) ggcgggcgGCGGCGGGCGCTGAAGCATGGCAATGCCTTCAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTC‑‑GGGCATGCCCCGGACCATGCGCACCGATGGcc > 1:800300/1‑120 (MQ=255) gCATGGCAATGCCTTCAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCC‑‑GA‑ccatg > 1:340347/1‑80 (MQ=255) gCATGGCAATGCCTTCAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCC‑‑GA‑ccatg < 2:340347/84‑5 (MQ=255) tGGCAATGCCTTCAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCC‑‑GACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTCATg < 1:920154/134‑1 (MQ=255) cTTCAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCC‑‑GACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTCATGGCAGCCAg > 1:274340/1‑133 (MQ=255) cAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCC‑‑GACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTCATGGCAg < 1:781635/126‑1 (MQ=255) cAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCC‑‑GACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTCATGGCAg > 2:781635/1‑126 (MQ=255) cGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCC‑‑GACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTCATGGCAGCCAGt > 2:565674/1‑124 (MQ=255) cGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCC‑‑GACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTCATGGCAGCCAGt < 1:565674/124‑1 (MQ=255) gccgccCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCC‑‑GACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTCATGGCAGCCAGTATCAGCAATCTgc < 2:274340/134‑1 (MQ=255) cccTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCC‑‑GACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTCATGGCAGCCAGTATCAGCAATCTGCGCAt < 1:604127/134‑1 (MQ=255) ccTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCC‑‑GACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTCATGGCAGCCAGTATCAGCAATCTGCGCAtt > 1:527277/1‑134 (MQ=255) ggCGCATGGTCCGGGGCATGCCC‑‑GACCATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTCATGGCAGCCAGTATCAGCAATCTGCGCATTGCGCCCCTCATGCGTCAGCGCCTg > 2:597872/1‑134 (MQ=255) | GCAGCGTTCAGGTCGTTGCGCTGAGCGCGGCAGGCGGGCGGCGGCGGGCGCTGAAGCATGGCAATGCCTTCAGCGCCCGAGCCGCCCTTGCTTCGTGCCCGCTTATCCGGGCGCATGGTCCGGGGCATGCCC‑‑GA‑CATGCGCACCGATGGCCAGCGCCGCCCAGCTCCGATGCCAGCGCTGACAGCGTCATGGCAGCCAGTATCAGCAATCTGCGCATTGCGCCCCTCATGCGTCAGCGCCTG > AM260480/2017968‑2018209 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |