Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | AM260479 | 208,953 | A→C | V315V (GTT→GTG) | h16_A0195 ← | Putative GTPase (G3E family) |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AM260479 | 208,953 | 0 | A | C | 100.0% | 143.1 / NA | 37 | V315V (GTT→GTG) | h16_A0195 | Putative GTPase (G3E family) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (19/18); total (19/18) |
GAGGATGGCGTCGCGGGGCAGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCATGGAACACCACTTTGCGGTCAACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGTTTTTCCCCGTATACGGCCAGGATGCCGGACAGGAATTCCTCCAGCTTGCCGTAGTGGAAGGGCTTGTCGCTGCGG > AM260479/208824‑209067 | gAGGATGGCGTCGCGGGGCAGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCcaca < 2:781743/133‑1 (MQ=255) gATGGCGTCGCGGGGCAGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGt > 1:949686/1‑134 (MQ=255) gcgGGGCAGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCatata > 1:435352/1‑132 (MQ=255) ggggCAGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCatatat > 2:34618/1‑131 (MQ=255) ggggCAGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCatatat < 1:34618/131‑1 (MQ=255) gggCAGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTc < 2:295575/123‑1 (MQ=255) gggCAGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTc > 1:295575/1‑123 (MQ=255) aGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGcc < 2:586165/134‑1 (MQ=255) gATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCatat > 2:658698/1‑113 (MQ=255) gATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCatat < 1:658698/113‑1 (MQ=255) gATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAgcg > 2:23842/1‑132 (MQ=255) acacCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGt > 1:486507/1‑113 (MQ=255) acacCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGt < 2:486507/113‑1 (MQ=255) acacCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCAATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACAcc < 1:498335/100‑1 (MQ=255) acacCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCAATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACAcc > 2:498335/1‑100 (MQ=255) acacCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTACCCATCAGCTGGTGGACCCCCT‑GAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGtt > 2:782417/1‑134 (MQ=255) cacCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGcagcag > 1:474640/1‑132 (MQ=255) cacCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGcagcag < 2:474640/132‑1 (MQ=255) cacCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTACCCATCAGCTGGTGGACCCCCT‑GAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGttt < 1:782417/134‑1 (MQ=255) acCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGttt < 2:949686/134‑1 (MQ=255) cgTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTc < 1:330637/93‑1 (MQ=255) cgTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTc > 2:330637/1‑93 (MQ=255) cgTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGTTTTTCCCCGt < 1:23842/134‑1 (MQ=255) gCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGttt > 1:913903/1‑123 (MQ=255) gCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGttt < 2:913903/123‑1 (MQ=255) tccCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCacac > 2:341602/1‑70 (MQ=255) tccCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCacac < 1:341602/70‑1 (MQ=255) ggCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGttt > 2:548716/1‑99 (MQ=255) ggCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGttt < 1:548716/99‑1 (MQ=255) ccGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCtt > 2:12426/1‑80 (MQ=255) ccGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCtt < 1:12426/80‑1 (MQ=255) tggACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGTTTTTCCCCGTATACGGCCAgg > 1:711965/1‑90 (MQ=255) tggACCCCCTGGAACACCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGTTTTTCCCCGTATACGGCCAgg < 2:711965/90‑1 (MQ=255) acacCACTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGTTTTTCCCCGTATACGGCCAGGATGCCGGACAGGAATTCCTCCAGCTTGCCGTAGTGGAAGGGCTTGTCGCTGCgg > 1:360307/1‑131 (MQ=255) acTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGTTTTTCCCCGTATACGGCCAGGATGCCGGACAGGAATTCCTCCAGCTTGCCGTAGTGGAAGGGCTTGTCGCTGCg < 2:306869/125‑1 (MQ=255) acTTTGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGTTTTTCCCCGTATACGGCCAGGATGCCGGACAGGAATTCCTCCAGCTTGCCGTAGTGGAAGGGCTTGTCGCTGCg > 1:306869/1‑125 (MQ=255) ttGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGTTTTTCCCCGTATACGGCCAGGATGCCGGACAGGAATTCCTCCAGCTTGCCGTa > 1:673528/1‑101 (MQ=255) ttGCGGTCCACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGTTTTTCCCCGTATACGGCCAGGATGCCGGACAGGAATTCCTCCAGCTTGCCGTa < 2:673528/101‑1 (MQ=255) | GAGGATGGCGTCGCGGGGCAGGTCCACGCCGATGAACACCATGCGCGTGCCCGGGGTCTCTTCCTCCCACTTGGCGCCGATGTCGCTGCCCATCAGCTGGTGGACCCCATGGAACACCACTTTGCGGTCAACACCGTCCATATATAGTACGCCCTTGTAGCGCAGCAGTTTTTCCCCGTATACGGCCAGGATGCCGGACAGGAATTCCTCCAGCTTGCCGTAGTGGAAGGGCTTGTCGCTGCGG > AM260479/208824‑209067 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |