| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AM260479 | 1,042,407 | T→G | K131N (AAA→AAC) | h16_A0947 ← | Coproporphyrinogen III oxidase, Fe‑S oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AM260479 | 1,042,407 | 0 | T | G | 100.0% | 77.2 / NA | 21 | K131N (AAA→AAC) | h16_A0947 | Coproporphyrinogen III oxidase, Fe‑S oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (11/10); total (11/10) | |||||||||||
CACCGCCGTGGATGCGCCCGAGCGCCTGGAGGTGCCGGTCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGTTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGACAGCAGCCGGTCCATGCCTGCCGCCGACAGCAGGCTGGGCGTGCCGCCGCCGATAAAGACCGTATGCAC > AM260479/1042283‑1042535 | cACCGCCGTGGATGCGCCCGAGCGCCTGGAGGTGCCGGTCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTc > 1:519676/1‑133 (MQ=255) gAGCGCCTGGAGGTGCCGGTCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCgg > 1:373009/1‑134 (MQ=255) aGCGCCTGGAGGTGCCGGTCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCgg > 1:828862/1‑133 (MQ=255) ccGGTCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGgcagc < 1:366355/133‑1 (MQ=255) tCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTg > 2:920323/1‑90 (MQ=255) tCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTg < 1:920323/90‑1 (MQ=255) tCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAgcgc > 2:853021/1‑134 (MQ=255) gTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAgcgcg < 1:853021/133‑1 (MQ=255) aGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGata < 2:519676/134‑1 (MQ=255) ccGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGAcagcag > 2:255594/1‑134 (MQ=255) gCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGACAGCAGCCGGTCCAtg < 1:255594/134‑1 (MQ=255) gTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGACAGCAGCCGGTCCAtgcctg < 2:1024554/134‑1 (MQ=255) ttGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGACAGCAGCCGGTCCAtgcctgc > 2:125164/1‑134 (MQ=255) cgcgGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGACAGCAGCCGGTCCATGCCTGCCGCCGACAGCAgg > 1:60045/1‑134 (MQ=255) gTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGC‑GATATCCGACAGCAGCCGGTCCATGCCTGCCGCCGACAGCAGGCTGGGCGTGccgccgccg < 2:528760/132‑1 (MQ=255) gCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCagcagc > 1:69263/1‑63 (MQ=255) gCCTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCagcagc < 2:69263/63‑1 (MQ=255) ccTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGACAGCAGCCGGTCCATGCCTGCCGCCGACAGCAGGCTGGGCGTgcc < 1:756757/121‑1 (MQ=255) ccTCGAAGGTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGACAGCAGCCGGTCCATGCCTGCCGCCGACAGCAGGCTGGGCGTgcc > 2:756757/1‑121 (MQ=255) ggTGCCGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGACAGCAGCCGGTCCATGCCTGCCGCCGACAGCAGGCTGGGCGTGCCGCCGCCGATAAAGACCGTAt > 2:469394/1‑134 (MQ=255) ccGGGGTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGACAGCAGCCGGTCCATGCCTGCCGCCGACAGCAGGCTGGGCGTGCCGCCGCCGATAAAGACCGTATGCAc < 2:60045/134‑1 (MQ=255) | CACCGCCGTGGATGCGCCCGAGCGCCTGGAGGTGCCGGTCGTTGAAGCTCTGGATGCCGATCGACAGCCGGTTGATGCCGCTGGCGCGGTAGCTGGCGAACTTGTCGGCCTCGAAGGTGCCGGGTTTGGCCTCCATCGTGATCTCGGCGTCGGCATCCAGCGGCAGCAGCGCGCGGATATCCGACAGCAGCCGGTCCATGCCTGCCGCCGACAGCAGGCTGGGCGTGCCGCCGCCGATAAAGACCGTATGCAC > AM260479/1042283‑1042535 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |