Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | AM260480 | 433,189 | A→C | R133R (CGA→CGC) | h16_B0381 → | Acetyl‑CoA acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AM260480 | 433,189 | 0 | A | C | 100.0% | 166.2 / NA | 43 | R133R (CGA→CGC) | h16_B0381 | Acetyl‑CoA acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (16/27); total (16/27) |
GATGTGCGGCTCGGCCATGAAGTCCGTGATGCTCGCGCATGACCTGCTGCTTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGATACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCTGGAGGACGCCTACGAAGGCCACCTGATGGGCTACTACGCAGACCTCGCCGCCGAGGCGCGCGGCATGGGCCGC > AM260480/433060‑433318 | gATGTGCGGCTCGGCCATGAAGTCCGTGATGCTCGCGCATGACCTGCTGCTTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACg > 2:247877/1‑134 (MQ=255) gATGTGCGGCTCGGCCATGAAGTCCGTGATGCTCGCGCATGACCTGCTGCTTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACg < 2:52819/134‑1 (MQ=255) aTGTGCGGCTCGGCCATGAAGTCCGTGATGCTCGCGCATGACCTGCTGCTTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACgg < 1:880613/134‑1 (MQ=255) tgCGGCTCGGCCATGAAGTCCGTGATGCTCGCGCATGACCTGCTGCTTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTa > 2:735748/1‑134 (MQ=255) cGGCTCGGCCATGAAGTCCGTGATGCTCGCGCATGACCTGCTGCTTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTAcc < 2:762503/134‑1 (MQ=255) ggCCATGAAGTCCGTGATGCTCGCGCATGACCTGCTGCTTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCtt < 1:921067/133‑1 (MQ=255) cATGAAGTCCGTGATGCTCGCGCATGACCTGCTGCTTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTggg > 1:801917/1‑133 (MQ=255) cGTGATGCTCGCGCATGACCTGCTGCTTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGt < 1:39530/134‑1 (MQ=255) cGTGATGCTCGCGCATGACCTGCTGCTTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGt < 1:345925/134‑1 (MQ=255) aTGCTCGCGCATGACCTGCTGCTTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCtt > 1:456169/1‑117 (MQ=255) aTGCTCGCGCATGACCTGCTGCTTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCtt < 2:456169/117‑1 (MQ=255) aTGCTCGCGCATGACCTGCTGCTTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCt > 2:790368/1‑134 (MQ=255) cTCGCGCATGACCTGCTGCTTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGa < 2:817051/134‑1 (MQ=255) gcATGACCTGCTGCTTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACg > 1:346043/1‑98 (MQ=255) gcATGACCTGCTGCTTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACg < 2:346043/98‑1 (MQ=255) gcATGACCTGCTGCTTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACcaca < 2:801917/134‑1 (MQ=255) ctgctTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGc < 1:187489/132‑1 (MQ=255) ctTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGAc < 1:735748/132‑1 (MQ=255) ggCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCt < 1:951581/107‑1 (MQ=255) ggCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCt > 2:951581/1‑107 (MQ=255) gCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCt > 2:749790/1‑130 (MQ=255) gCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCt < 1:749790/130‑1 (MQ=255) cTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCt > 1:536578/1‑84 (MQ=255) cTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCt < 2:536578/84‑1 (MQ=255) cggtggcggGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCTGGAGGACGCCTACGAAGGc < 2:421547/134‑1 (MQ=255) tggcggGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCTGGAGGACGCCTACGAAGGCCAc < 1:247877/134‑1 (MQ=255) gcgggcggCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCTGGAGGACGCCTACGAAGGCCACCt < 1:634784/134‑1 (MQ=255) gcgggcggCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCTGGAGGACGCCTACGAAGGCCACCt < 1:627384/134‑1 (MQ=255) gcgggcggCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCTGGAGGACGCCTACGAAGGCCACCt < 1:790368/134‑1 (MQ=255) gAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCTGGAGGACGCCTACGAAGGCCACCTGATGGGctacta > 1:652076/1‑134 (MQ=255) ccAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCTGGAGGACGCCTACGAAGGCCACCt < 2:601986/112‑1 (MQ=255) ccAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCTGGAGGACGCCTACGAAGGCCACCt > 1:601986/1‑112 (MQ=255) gcCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCTGGAGGACGCCTACGAAGGCCACCTGATgg > 2:797474/1‑110 (MQ=255) gcCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCTGGAGGACGCCTACGAAGGCCACCTGATgg < 1:797474/110‑1 (MQ=255) cGTACATCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCTGGAGGACGCCTACGAAGGCCACCTGATGGGCTACTACGCAGACCTCGCCGCCGAg < 2:468330/134‑1 (MQ=255) tCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCTGGAGGACGCCTACGAAGGCCACCt > 2:375676/1‑97 (MQ=255) tCGTCCCGCGCGGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCTGGAGGACGCCTACGAAGGCCACCt < 1:375676/97‑1 (MQ=255) gcgcgGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCt < 2:388937/42‑1 (MQ=255) gcgcgGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCt > 1:388937/1‑42 (MQ=255) gcgcgGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCTGGAGGACGCCTACGAAGGCCACCTGATGGGCTACTACGCAGACCTCGCCGCCGAGGCGCGCGGCATgg < 2:261783/134‑1 (MQ=255) cgcgGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTc < 1:822180/39‑1 (MQ=38) cgcgGCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTc > 2:822180/1‑39 (MQ=38) gCCGCTACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCTGGAGGACGCCTACGAAGGCCACCTGATGGGCTACTACGCAGACCTCGCCGCCGAGGCGCGCGGCATGGGCcgc > 2:2374/1‑134 (MQ=255) | GATGTGCGGCTCGGCCATGAAGTCCGTGATGCTCGCGCATGACCTGCTGCTTGCCGGCACCTGCAACGTGGCGGTGGCGGGCGGCATGGAGTCGATGACCAACGCGCCGTACATCGTCCCGCGCGGCCGATACGGCTACCGCCTTGGGCACGGCCAGTTCCTCGACCACATGTACTGCGACGGGCTGGAGGACGCCTACGAAGGCCACCTGATGGGCTACTACGCAGACCTCGCCGCCGAGGCGCGCGGCATGGGCCGC > AM260480/433060‑433318 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |