New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AssemblyC74_contig_24 | 255 = | 457 (1.270) | 25 (0.370) +TGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCG |
11/48 | 1.1 | 23.5% | coding (255/420 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
? | AssemblyC74_contig_24 | = 265 | 406 (1.130) | coding (265/420 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
TGAGCTATCACTTGTGGTAGAGGATGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_24/305‑255 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTATCACTTGTAGTGGTAGATGAATCTGAGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTATCACTTGTTGTGGT < AssemblyC74_contig_24/265‑141 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| cgtGCTTTCTCTTGTGGTAGAGGTTGTATCTGTACTGTCTCTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGA < 2:3528259/132‑1 GGTAGAGGTTGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGT < 1:3517754/39‑1 ATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGA > 1:1582758/1‑51 ATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTG < 2:3539089/46‑1 ATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATC > 2:3517754/1‑39 ATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCT < 2:774979/36‑1 TCTGTACTGTCTCTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGC < 1:1717988/134‑1 TCTGGACTGTCACTTGTAGCCGATGAGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTTCTGTGGATTGTAGCTGATGTCTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGAAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGC < 1:1560156/134‑1 CTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTG > 2:691162/1‑42 CTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTG < 1:691162/42‑1 TGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGA < 2:2302104/48‑1 TGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGA > 1:2302104/1‑48 TGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACT > 2:2314875/1‑39 TGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACT < 1:2314875/39‑1 ACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGT > 2:1744342/1‑135 ACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACGTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGATGCTGAAGT > 1:3089672/1‑135 ACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTG > 1:2486242/1‑68 ACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTG < 2:2486242/68‑1 ACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGT > 2:2928056/1‑48 ACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGT < 1:2928056/48‑1 CTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGA < 1:2083884/68‑1 CTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGA > 2:2083884/1‑68 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTG > 2:123294/1‑134 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGA > 2:347217/1‑130 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CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCGTTTAGCTGACGTGTCCG > 2:3371850/1‑133 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCAATCACTGGAGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGGTGACGGGTCCG > 2:3372257/1‑133 TGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGGTGAGGTGTCagag > 2:1827938/1‑129 TGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCT < 2:1600638/135‑1 TGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCG > 1:2623639/1‑131 TGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCG > 1:2623424/1‑131 TGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCG > 1:1600638/1‑131 tAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTTGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTTTCCGTGCCATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTgt < 2:3396968/134‑3 AAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTgt < 2:3290909/135‑3 AGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTTTCTCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCAATAACTTGTGGTAGATGTAGTATCTGTACAGTCGAATGAAACTGTCGTGGCGGTGCTggg > 2:3485821/1‑132 AGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGATGAAGTGTCCGagaggt > 2:120371/1‑128 AGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTG < 1:883846/56‑1 GCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTC < 1:3372257/134‑1 GCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTC < 1:3371850/134‑1 GCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGGATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCA < 1:3186355/135‑1 GCTGATGTCTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTC < 1:1040700/134‑1 ATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTG > 2:1188353/1‑135 ATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTG > 2:3141792/1‑135 ATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTG < 1:903255/135‑1 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agaGCTATCACTTGTTGTTGATGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAATCTGATGTATCCGAGCTATCACTTGTGGTTGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTaga < 1:3486032/132‑4 CGTGCTCTCACTTGTGGTAGCGGTAGTATCTGTTCTGTCGCTTGAAGCTGATGTCTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTaga < 2:1223445/135‑4 CGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTaga < 2:2623639/135‑4 CGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGAGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTaga < 2:2623424/135‑4 GTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTagag > 2:1603195/1‑131 GTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCGGATGTATCCGTGCGATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCGTTTAGCTGAAGTGTCCGGGCTGTGACTTGTGGTagag > 2:3118070/1‑131 TGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTagagg < 2:1412519/135‑6 ATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTgt > 2:2252656/1‑114 ATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTgt < 1:2252656/116‑3 CTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTaga > 2:1053966/1‑122 CTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTaga < 1:1053966/125‑4 GTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTaga > 2:1239633/1‑116 GTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTaga < 1:1239633/119‑4 AGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGC < 1:1899057/87‑1 TCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTaga < 1:2489680/107‑4 CTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTa > 1:2338438/1‑98 CTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTa < 2:2338438/99‑2 TGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGC > 1:3291732/1‑84 TGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGC < 2:3291732/84‑1 TGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGC > 2:2592109/1‑70 TGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGC < 1:2592109/70‑1 CTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTaga < 2:1775565/95‑4 CTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTaga > 1:1775565/1‑92 GAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTaga > 1:653865/1‑89 GAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTaga < 2:653865/92‑4 GCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCTCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTg < 2:119532/70‑2 ACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGT > 1:2895272/1‑63 ACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGT < 2:2895272/63‑1 GGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTg < 1:632151/58‑2 GGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTg > 2:632151/1‑57 TAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTg < 1:1306762/56‑2 TAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTg > 2:1306762/1‑55 TCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTG < 2:1379967/43‑1 TCTGGACTGTCTCTGGACGCTGACGTGTCCGAGCTATCACTTGTTGTGGTAGATGAATCTGAGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTATCACTTGTTGT < 2:1090551/134‑1 TGTACTGTCTCTTGATGCTGACGTGTACTTGCTATCACTTGTAGTGGTAGATGAATCTGAGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTATCACTTGTTGTGGT < 2:1623859/135‑1 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGAGCTATCACTTGTGGTAGAGGATGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_24/305‑255 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTATCACTTGTAGTGGTAGATGAATCTGAGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTATCACTTGTTGTGGT < AssemblyC74_contig_24/265‑141 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |