| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_27 | = 7726 | 0 (0.000) | 246 (0.670) +CG |
71/250 | 0.4 | 100% | coding (703/705 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | UDP‑N‑acetylglucosamine 2‑epimerase (EC 5.1.3.14) |
| ? | AssemblyC74_contig_41 | = 1330 | 0 (0.000) | coding (1/411 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | UDP‑N‑acetylglucosamine 2‑epimerase (EC 5.1.3.14) | |||||
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
AGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_27/7596‑7726‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCATAATATA < AssemblyC74_contig_41/1330‑1217 || AGTTTTAACCAATCATTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTA > 1:353418/1‑135AGTTTTAACCAAACATTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATATAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATTAAGATATTCTCGCGTTA > 1:654658/1‑135 TTTTAACCAATCATTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTAT > 1:3034347/1‑134 TTTTAACCAATCATTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTAT > 2:3100094/1‑134 TTAACCAATCATTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTT > 1:2514114/1‑134 CAATCATTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATT > 2:1291143/1‑135 AATCATTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTC > 1:759829/1‑135 ATCATTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCA < 1:1434507/135‑1 ATCATTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCA < 2:1630325/135‑1 TCATTATGG‑AAAAAAATTATATTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCAT < 2:3288021/135‑1 TTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGTGGTATTTCCCATTCATAA > 1:2056549/1‑135 TTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAA > 1:786604/1‑135 TTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAA > 1:2288558/1‑135 TTATGG‑AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAA > 2:570764/1‑135 ggAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGATAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAATTGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATC < 2:439232/133‑1 ggAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATC < 2:3487232/133‑1 ggAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATC < 1:1595652/133‑1 ggAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATC < 1:362813/133‑1 AAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCT > 2:519168/1‑135 AAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAA > 2:2738921/1‑135 AAAATTATCTTATTAACTGTTAATCGAAGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAA < 2:679282/135‑1 AATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGT < 2:2293490/135‑1 AATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAG > 1:2184781/1‑134 ACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATC < 2:3538101/115‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 2:1723978/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 2:1835127/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 1:3208291/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 1:475030/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 1:2897271/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 1:519168/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 1:2723638/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 2:1552647/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 2:2393796/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 1:662620/135‑1 CTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 2:2746644/135‑1 CATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAA < 2:1204012/135‑1 ATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAAC > 1:3233824/1‑135 ATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAAC > 1:3141374/1‑135 ATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAAC > 2:2634213/1‑135 ATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAAC > 2:908028/1‑135 ATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCA > 2:2373224/1‑128 ATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCA < 1:2373224/128‑1 CGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACAT > 1:3102466/1‑135 CGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACAT > 2:233676/1‑135 CGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACAT > 1:2241259/1‑135 CGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGT > 1:1164781/1‑113 AGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATG < 1:1848780/135‑1 GAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGT > 2:3197850/1‑135 AATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTC < 2:2987407/133‑1 TTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCG < 1:2649761/135‑1 TTAGGGGAACCAATGATTAATAAATATAACGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCG < 2:3086198/135‑1 GGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGAT < 1:1050096/135‑1 GGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCG > 1:1051920/1‑135 GAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCG < 1:2324678/134‑1 GAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCG < 2:2514114/134‑1 CCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATT < 2:1051781/134‑1 CCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATT < 1:2434253/134‑1 CCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATT < 1:532480/134‑1 CCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATT < 2:745649/134‑1 TAATATATTTAAATCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 1:3197850/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAATCATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 1:2914832/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAAT < 2:3102466/135‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 1:2542427/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 1:1895502/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 1:1229619/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 2:2598181/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 2:2482/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 2:802071/134‑1 TAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAA < 1:2980917/134‑1 TATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAA < 2:1472329/95‑1 ATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACC < 1:1523959/135‑1 TTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTT < 1:2484339/135‑1 TTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTT < 2:3141374/135‑1 AAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTA > 2:3443706/1‑135 AAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAG > 1:1008729/1‑135 AAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAG > 2:3379316/1‑135 AAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAG > 2:1121669/1‑135 AAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAG > 1:837879/1‑135 AAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAG > 2:3014224/1‑135 AAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAG > 1:3292451/1‑135 AAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAG > 1:3413282/1‑135 AGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGA > 2:1037062/1‑135 AATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGT > 2:2823351/1‑135 AATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGT > 2:778524/1‑135 ATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTT > 2:2166824/1‑135 AATCAATTATTAGAAAAAAATGAAGAGATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAATAATCCTAATGTACGGAATTTAGCAACGAAACATGTCTGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTA < 2:3277018/135‑1 ATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGACGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAG > 2:987021/1‑135 ATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAG > 2:2873245/1‑135 ATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAG > 2:1947617/1‑135 ATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAG > 2:1527469/1‑135 ATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAG > 2:1311037/1‑135 CAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGAT < 2:793642/135‑1 ATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTT < 2:1090119/135‑1 ATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTT < 1:1455053/135‑1 GTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCAT > 2:3223744/1‑135 GTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCCAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCAT > 1:2761036/1‑135 AGAAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCATAA > 2:1427387/1‑135 AAAAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCATAATA > 1:3333407/1‑135 AAAAATGAAGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCATAATAT < 1:908028/134‑1 AGATATTGTCGCGGTATTTCCCATTCATAAAAATC > 1:2473131/1‑35 || AGTTTTAACCAATCATTATGGAAAAAAAATTATCTTATTAACTGTTCATCGACGAGAAAATTTAGGGGAACCAATGATTAATATATTTAAAGCAATTAATCAATTAGTAGAAAAAAATGAAGATATTGTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_27/7596‑7726‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTATTTCCCATTCATAAAAATCCTAAAGTACGGAATTTAGCAACGAAACATTTATGTCGCTCGGATCGATTGAAGATAATTGAACCTTTAGATGTTGTAGATTTTCATAATATA < AssemblyC74_contig_41/1330‑1217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |