| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_33 | 1 = | 0 (0.000) | 386 (0.750) | 97/254 | 0.1 | 100% | coding (1/972 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_8 | = 115683 | 0 (0.000) | coding (1791/1791 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Phage capsid and scaffold | |||||
Only 100 of 386 total aligned reads displayed.
AAAGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_33/134‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCTAATAAAACTA < AssemblyC74_contig_8/115683‑115550 AAAGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATAT < 1:673731/135‑1 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC > 2:2192185/1‑134 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC > 2:2083878/1‑134 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC > 2:400420/1‑134 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC > 1:3535505/1‑134 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC > 2:147739/1‑134 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATC > 2:894529/1‑134 AGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTACACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCCAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTATGATATC > 1:1508253/1‑134 GTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCA < 1:1721039/135‑1 CCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCA < 2:1892564/135‑1 TCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGT < 1:419754/135‑1 TCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGT < 2:1345939/135‑1 CCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTA > 1:2427255/1‑135 TTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATT < 2:2571841/135‑1 TTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATT < 1:463449/135‑1 TTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATT < 2:1524239/135‑1 TTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATT < 1:2686679/135‑1 CTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTC < 2:660636/135‑1 TTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCC < 2:1997122/135‑1 TGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCCAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCC > 2:1086503/1‑134 TGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACC > 1:2470008/1‑134 AATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCC < 1:2164456/135‑1 AATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCC < 2:5332/135‑1 AATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCC < 1:2967782/135‑1 AATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACC > 2:2631706/1‑132 TGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTG < 1:147739/135‑1 GTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGA > 1:133270/1‑135 CCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTATGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGA < 2:2493045/135‑1 CCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGA < 1:894529/135‑1 CCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGA < 2:3211389/135‑1 CCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGA < 2:3171382/135‑1 tcTTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACC < 1:3334238/133‑1 TATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACC < 1:1553509/135‑1 TCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACC > 2:2135919/1‑135 TCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATT > 1:1960366/1‑110 TCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATT < 2:1960366/110‑1 CACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTT < 1:1852408/135‑1 ACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTT > 1:2745581/1‑134 CATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGT < 1:1575421/135‑1 ATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTC > 2:1565207/1‑135 ATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTC > 1:2534959/1‑135 ATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTC > 2:1617665/1‑135 ATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTC > 2:2582413/1‑135 ATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACC < 2:165520/97‑1 GCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCA > 2:1752981/1‑135 GCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCA > 1:1034897/1‑135 GATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGA > 2:1250890/1‑135 GATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGA > 1:115692/1‑135 GATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCT > 2:2733617/1‑111 TGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTG > 1:1390494/1‑109 TGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTG < 2:1390494/109‑1 GTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTA > 1:1213571/1‑135 GTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGA > 2:1046701/1‑113 TCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATT < 1:995598/134‑1 TCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATT < 1:802919/134‑1 TCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATT < 1:1752981/134‑1 TCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATT < 2:1500707/134‑1 CGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCGTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTC > 2:1771351/1‑135 AAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTT > 1:1108142/1‑134 ATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTC < 2:736770/135‑1 ATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTC < 2:1097053/135‑1 GTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGA < 2:615707/100‑1 TTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTT > 1:2307803/1‑134 TTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACT < 1:1799038/135‑1 TTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCC < 2:301070/128‑1 TTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCC > 1:301070/1‑128 TTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTG < 2:2236430/91‑1 CACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTA < 2:2964561/135‑1 AAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTATGCATCTGTTTTTAATTAACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATTGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTATTTTCATTTAACTGTAAGat > 2:2911483/1‑133 AATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTT < 1:3236105/135‑1 AATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTT < 2:1436450/135‑1 ATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCC > 2:3543425/1‑135 ATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCC > 2:2385286/1‑135 TCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCT < 1:625790/135‑1 TCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCT < 1:715479/135‑1 AAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTA > 1:2015865/1‑135 AAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTT < 1:545319/127‑1 AAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATT > 2:941357/1‑104 AAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCAACACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTA > 2:3331217/1‑135 AAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAA > 1:2632059/1‑133 GCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCT < 1:2582413/135‑1 GCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCC > 2:3399170/1‑119 GCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCC < 1:3399170/119‑1 GCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTG > 1:1077804/1‑64 TCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAA > 1:1631125/1‑135 ATCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTtc > 2:2607246/1‑133 TCTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTG < 1:3079654/49‑1 CTGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTT < 1:2219846/135‑1 TGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTT > 1:349147/1‑134 TGTTTTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTG < 2:112668/47‑1 TTTAATTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCA > 1:2081308/1‑135 TTCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCC < 2:517984/135‑1 TCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCT < 1:2911483/135‑1 TCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCT < 2:3519038/135‑1 TCACTAGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCT < 1:2785349/135‑1 AGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCT > 1:262098/1‑130 AGGATATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTA > 2:2307618/1‑79 TATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCTAATAAAA < 2:2463017/133‑1 ATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCTAATAAAACT < 2:1198380/134‑1 ATCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCTAATAAAACT < 2:8296/134‑1 AAAGTTCCTCCTGTTTCTTGTTGAATGTTCCCCAATATTCCACATGCAGATTGTTTCGTAAATCCGTTATTACACAAAATATCGTAAATTCTCCAAGCTCTCTTTTCTGCATCTGTTTTTAATTCACTAGGATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_33/134‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCACCAGTAGATTCTCCACCTCCTGATGGACCACCACCTTGTCCAGGAATTATTTCTTTTCCTTTAACTGTAAGTTTTCCTTGTACATCTAAGTCTCCAAAATAAATTGCTTTACCATTTCCTAATAAAACTA < AssemblyC74_contig_8/115683‑115550 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |