| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | AssemblyC74_contig_55 | = 585 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 360 total aligned reads displayed.
TCAGTATATTTTGATGAACGCATATGTAGTCCTCATTTCTTGGGAGTTTTGAGACTACTATATGCGTTTTTTTGTTGATTTACCAACATGTTTAGACATTTTCCTCTAGGAAAAAATTAACTAGCACCACGGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_49/134‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTATTATAATCTCATCCTATAAAAAATCAATACTAAAAAACTATTCTTTCGAGTAGCTCTGAACAGATGTCATCATAACTTATGAAGGAAATAGACATAAGATTGTGTATAAAAAAATAACCACCCGAAGGT < AssemblyC74_contig_55/585‑454 AGTATATTTTGATGAACGCATATGTAGTCCTCATTTCTTGGGAGTTTTGAGACTACTATATGCGTTTTTTTGTTGATTTACCAACATGTTTAGACATTTTCCTCTAGGAAAAAATTAACTAGCACCACGGGTTTA < 2:1333568/135‑1 AGTATATTTTGATGAACGCATATGTAGTCCTCATTTCTTGGGAGTTTTGAGACTACTATATGCGTTTTTTTGTTGATTTACCAACATGTTTAGACATTTTCCTCTAGGAAAAAATTAACTAGCACCACGGGTTTA > 2:3193315/1‑135 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |