| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_51 | = 723 | 0 (0.000) | 209 (0.450) | 63/254 | 0.2 | 56.8% | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity/– | Conserved domain protein/– |
| ? | AssemblyC74_contig_61 | = 87 | 318 (0.520) | coding (336/420 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
TCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_51/594‑723‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAAT < AssemblyC74_contig_61/87‑3 CTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATT < 2:737952/135‑1 CTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATT < 1:1465206/135‑1 AACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTAT > 1:1876758/1‑135 CGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGT < 2:2385967/135‑1 CGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGT > 2:3075082/1‑135 GTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTT > 2:3522280/1‑135 AGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTAT > 2:2444379/1‑133 AGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTAT > 1:2167359/1‑133 AGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTAT > 2:450139/1‑133 GTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGT < 1:3528313/135‑1 GTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCT < 1:3320685/133‑1 GTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCT < 2:1876758/133‑1 GTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCT < 2:2462175/133‑1 TAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTC > 2:1038767/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 2:3379660/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 1:2664931/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 1:1065557/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 2:2425703/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 2:2366311/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCT > 1:1737417/1‑135 AATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATAAGTCATATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTGTGGCTGTGGCTCT > 2:2699168/1‑135 ATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTC < 2:522015/133‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:3139858/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 2:1863131/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 2:2176196/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:450139/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:3367165/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 2:2938557/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:1793930/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:2224513/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:1101873/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 2:2549627/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:185018/135‑1 TTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACATTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTATATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 1:2652647/135‑1 GGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAA < 1:2674105/135‑1 GAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAAC > 2:2258300/1‑135 ATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGA > 2:2924037/1‑135 ATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACG < 1:2402657/134‑1 ACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGT < 2:2799357/135‑1 TCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTACTGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTA < 1:986127/135‑1 GAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGAAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGA > 2:1454217/1‑135 AATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAG < 2:1359377/134‑1 TATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAAT > 1:403512/1‑135 TATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGA > 2:687648/1‑118 TATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGA < 1:687648/118‑1 TATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTG < 2:2873058/135‑1 ATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGG < 1:3485871/135‑1 ATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGG < 1:3075082/135‑1 AGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATA > 1:619517/1‑135 AGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATA > 1:2473663/1‑135 TATCTGTTTTATGGCTGTTTTTGTTTAAATACATTGGATGTAATCAAATGGGATACGTCCAATGTTACTAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACG < 2:2112579/135‑1 TATATGTTTTATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACG < 1:1695589/135‑1 ATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGT > 1:3306596/1‑135 ATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGT > 1:2118894/1‑135 ATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGT > 1:2430268/1‑135 ATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTG < 1:1638068/127‑1 ATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTG > 2:1638068/1‑127 TATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACG < 1:410975/133‑1 TATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACG < 2:645262/133‑1 ATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCG > 2:20489/1‑135 ATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCG > 2:2574034/1‑135 ATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCG > 2:2113133/1‑135 ATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCG > 1:2826679/1‑135 ATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCG > 1:2750652/1‑135 ATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCG > 2:588473/1‑135 ATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTG > 1:2985806/1‑125 TTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAcg > 2:2644709/1‑133 TTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTAGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATTGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAG > 1:2071820/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 2:1683941/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 2:3276514/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 1:1117503/1‑135 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAA < 2:3109884/129‑1 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAA > 1:3109884/1‑129 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTA > 1:1160705/1‑113 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGA > 1:57085/1‑98 TGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT > 1:2124831/1‑93 GGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACT < 1:1859709/135‑1 GCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 2:2684533/1‑133 GCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAC > 2:3452520/1‑133 TGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTC < 2:1737417/134‑1 TGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTC < 2:2118894/134‑1 TGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT > 2:2996089/1‑89 GTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTA < 2:2494707/135‑1 GTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAAGGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTAT > 2:3423565/1‑133 TAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAc > 2:342519/1‑134 GTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAct < 1:1314472/134‑3 GTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAct < 1:1038767/134‑3 GTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAct < 2:1065557/134‑3 GTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAct < 1:290747/134‑3 AACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGA < 1:2186001/128‑1 AACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT > 1:1019677/1‑78 AACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCT > 1:2686243/1‑55 GGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT > 1:1416949/1‑54 GGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGG < 1:2777911/42‑1 CAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTT < 2:1054930/46‑1 AAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATG > 1:3183858/1‑59 GTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACG < 2:3248146/72‑1 GTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACG > 1:3248146/1‑72 AATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTA < 2:1089231/45‑1 AATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTA > 1:1089231/1‑45 TCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCGAAGGTAAATTATATAGAGTATATGTTTAATGGCTGTAGTAGTTTAACTACCTTGGATGTAAGCAAATGGGATACGTCAAATGTTACGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_51/594‑723‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAAT < AssemblyC74_contig_61/87‑3 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |