| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_27 | 1 = | 0 (0.000) | 246 (0.600) | 71/254 | 0.4 | 100% | intergenic (–/‑26) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Undecaprenyl‑phosphate galactosephosphotransferase (EC 2.7.8.6) |
| ? | AssemblyC74_contig_37 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑435) | –/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | –/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTATAAAGGAAGTTGGTGAATATATTTGGAAGATAATTTTAAATTATCAAAAAATGGATATCTTGATATAGGAAAAAGGGGAATCGATTTAGTTTTTAGCACAGTGGGGTTGATTGTTTTGTTTCCTTTATTTT > AssemblyC74_contig_27/1‑135 | tttatggcattactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaatattagtagtttaatatgttttaaatttaattttgttcaaagg < 1:234956‑M1/2‑1 (MQ=255) attactttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaattttgttcaaaGGTATAAAgg < 1:1781487‑M1/10‑1 (MQ=255) actttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaattttgttcaaaGGTATAAAGGAAg > 1:267802‑M1/123‑135 (MQ=255) tttatagcatttttgcaatgaaaaaatgctgcattgagtaattctctagactgtcataggacccatttaaagtatttaattttagtagtttaatatgttttaaatttaattttgttcaaaGGTATAAAGGAAGtt < 2:2305937‑M1/15‑1 (MQ=255) 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTATAAAGGAAGTTGGTGAATATATTTGGAAGATAATTTTAAATTATCAAAAAATGGATATCTTGATATAGGAAAAAGGGGAATCGATTTAGTTTTTAGCACAGTGGGGTTGATTGTTTTGTTTCCTTTATTTT > AssemblyC74_contig_27/1‑135 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |